Apaf-1 |
---|
|
Estructures disponibles |
---|
PDB | Cerca ortòloga: PDBe RCSB |
---|
Llista de codis id de PDB |
---|
1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW, 3JBT |
|
|
Identificadors |
---|
Àlies | APAF1 (HUGO), APAF-1, CED4, apoptotic peptidase activating factor 1 |
---|
Identif. externs | OMIM: 602233 MGI: 1306796 HomoloGene: 7626 GeneCards: APAF1 OMA: APAF1 - orthologs |
---|
Localització del gen (humà) |
---|
| Crom. | Cromosoma 12 (humà)[1] |
---|
| Banda | 12q23.1 | Inici | 98.645.290 bp[1] |
---|
Fi | 98.735.433 bp[1] |
---|
|
Localització del gen (ratolí) |
---|
| Crom. | Cromosoma 10 (ratolí)[2] |
---|
| Banda | 10 C2|10 45.47 cM | Inici | 90.989.311 bp[2] |
---|
Fi | 91.082.770 bp[2] |
---|
|
|
Ontologia genètica |
---|
Funció molecular | - heat shock protein binding
- ADP binding
- unió proteica
- unió de proteïnes idèntica
- unió d'ATP
- unió de nucleòtids
- cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
| Component cel·lular | - citoplasma
- citosol
- exosoma extracel·lular
- nucli cel·lular
- apoptosome
- regió extracel·lular
- secretory granule lumen
- ficolin-1-rich granule lumen
- complex macromolecular
| Procés biològic | - cellular response to transforming growth factor beta stimulus
- neuron apoptotic process
- regulation of apoptotic process
- diferenciació cel·lular
- response to hypoxia
- response to nutrient
- response to G1 DNA damage checkpoint signaling
- envelliment humà
- positive regulation of apoptotic signaling pathway
- glial cell apoptotic process
- desenvolupament neuronal
- desenvolupament d'organisme multicel·lular
- cardiac muscle cell apoptotic process
- intrinsic apoptotic signaling pathway
- intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress
- neural tube closure
- brain development
- positive regulation of apoptotic process
- apoptotic signaling pathway
- forebrain development
- regulation of apoptotic DNA fragmentation
- protein homooligomerization
- activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
- activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c
- apoptosi
- neutrophil degranulation
- negative regulation of G0 to G1 transition
- kidney development
| Fonts:Amigo / QuickGO |
|
Ortòlegs |
---|
Espècies | Humà | Ratolí |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (ARNm) | |
---|
NM_001160 NM_013229 NM_181861 NM_181868 NM_181869 |
| |
---|
NM_001042558 NM_001282947 NM_009684 |
|
---|
RefSeq (proteïna) | |
---|
NP_001151 NP_037361 NP_863651 NP_863658 NP_863659 |
| |
---|
NP_001036023 NP_001269876 NP_033814 |
|
---|
Localització (UCSC) | Chr 12: 98.65 – 98.74 Mb | Chr 10: 90.99 – 91.08 Mb |
---|
Cerca a PubMed | [3] | [4] |
---|
|
Wikidata |
Veure/Editar gen humà | Veure/Editar gen del ratolí |
|
La proteïna Apaf-1 (Apoptosis protease-activating factor-1) és un regulador clau de la via apoptòtica mitocondrial, sent l'element central del complex multimèric anomenat apoptosoma, format també per la procaspasa-9 i el citocrom c.
Les activitats Apaf es van descriure per primera vegada en experiments in vitro per recuperar l'activitat caspasa a partir de fraccions citosòliques de cèl·lules HeLa. Apaf-1 va resultar ser una molècula adaptadora amb homologia amb la proteïna CED-4 de C. elegans, mentre que Apaf-2 i Apaf-3 van ser identificats com el citocrom ci la caspasa-9 respectivament (Zou et al. 1997).
La formació de l'estructura de l'apoptosoma es desencadena amb l'alliberament del mitocondri del citocrom c intervingut per la família Bcl-2. Un cop alliberat, el citocrom c s'uneix a Apaf-1 formant un primer complex. Aquesta unió ve definida per l'existència en l'extrem C-terminal d'Apaf-1 de diversos dominis WD40 d'unió proteïna-proteïna com els presents en la subunitat b de les proteïnes G heterotrimèriques. Apaf-1 presenta també un domini de reclutament de caspases (CARD) que, en condicions d'inactivitat, estaria "segrestat" per dos dels dominis WD40, però que s'allibera amb la unió del citocrom c. L'exposició dels dominis CARD permet a Apaf-1 reclutar la procaspasa-9 en presència de dATP que intervé l'oligomerització del complex. Un cop unida, la procaspasa-9 té un autoprocessament donant lloc a la seva forma activa de caspasa-9, una caspasa iniciadora capaç d'activar caspases efectores com la caspasa-3. Aquesta successió d'esdeveniments acaba desembocant en l'activació d'altres caspases i de factors de degradació d'ADN que s'encarregarien de fragmentar el material genètic.
Bibliografia
- Zou H, Henzel WJ, Liu X, Lutschg A, Wang X. Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3. Cell 1997 Aug 8;90(3):405-13. PMID: 9267021.
- Yoshida H, Kong YY, Yoshida R, Elia AJ, Hakem A, Hakem R, Penninger JM, Mak TW. Apaf1 is required for mitochondrial pathways of apoptosis and brain development. Cell. 1998 Sep 18;94(6):739-50. PMID: 9753321.
- Danial NN, Korsmeyer SJ. Cell death: critical control points. Cell 2004 Jan 23;116 (2):205-19. PMID: 14744432.
Enllaços externs
- APAF1 (Apoptotic protease activating factor 1) Arxivat 2005-10-25 a Wayback Machine.
- ↑ 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000120868 - Ensembl, May 2017
- ↑ 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019979 – Ensembl, May 2017
- ↑ «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.