Apolipoproteïna B

Infotaula de genApolipoproteïna B
Identificadors
ÀliesAPOB (HUGO), FLDB, LDLCQ4, apoB-100, apoB-48, apolipoprotein B, FCHL2
IDs externesOMIM: 107730   MGI: 88052   HomoloGene: 328   GeneCards: APOB   OMA: APOB - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 2 (humà)
Crom.Cromosoma 2 (humà)[1]
Cromosoma 2 (humà)
Localització genòmica per Apolipoproteïna B
Localització genòmica per Apolipoproteïna B
Banda2p24.1Inici21.001.429 bp[1]
Fi21.044.073 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 12 (ratolí)
Crom.Cromosoma 12 (ratolí)[2]
Cromosoma 12 (ratolí)
Localització genòmica per Apolipoproteïna B
Localització genòmica per Apolipoproteïna B
Banda12 A1.1|12 3.53 cMInici8.027.648 bp[2]
Fi8.066.835 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
Més explicacions
Més dades d'expressió de referència
BioGPS
Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • unió proteica 
  • lipid binding Podeu traduir-lo
  • lipid transporter activity Podeu traduir-lo
  • cholesterol transfer activity Podeu traduir-lo
  • lipase binding Podeu traduir-lo
  • low-density lipoprotein particle receptor binding Podeu traduir-lo
  • phospholipid binding Podeu traduir-lo
  • heparin binding Podeu traduir-lo
  • signaling receptor binding Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • early endosome Podeu traduir-lo
  • chylomicron remnant Podeu traduir-lo
  • vesicle lumen Podeu traduir-lo
  • reticle endoplasmàtic 
  • endosome membrane Podeu traduir-lo
  • mature chylomicron Podeu traduir-lo
  • endoplasmic reticulum lumen Podeu traduir-lo
  • vesicle membrane Podeu traduir-lo
  • endosome lumen Podeu traduir-lo
  • intermediate-density lipoprotein particle Podeu traduir-lo
  • clathrin-coated endocytic vesicle membrane Podeu traduir-lo
  • membrana del reticle endoplasmàtic Podeu corregir-lo
  • exosoma extracel·lular Podeu corregir-lo
  • endocytic vesicle lumen Podeu traduir-lo
  • cos cel·lular neuronal Podeu corregir-lo
  • citoplasma 
  • quilomicró 
  • very-low-density lipoprotein particle Podeu traduir-lo
  • low-density lipoprotein particle Podeu traduir-lo
  • endoplasmic reticulum exit site Podeu traduir-lo
  • extracel·lular 
  • reticle endoplasmàtic llis 
  • citosol 
  • membrana plasmàtica 
  • lysosomal lumen Podeu traduir-lo
  • intracellular membrane-bounded organelle Podeu traduir-lo
  • regió extracel·lular Podeu corregir-lo
  • high-density lipoprotein particle Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • artery morphogenesis Podeu traduir-lo
  • in utero embryonic development Podeu traduir-lo
  • fecundació 
  • Endocitosi mediada per receptors Podeu corregir-lo
  • positive regulation of cholesterol storage Podeu traduir-lo
  • lipid metabolism Podeu traduir-lo
  • cholesterol metabolic process Podeu traduir-lo
  • cholesterol transport Podeu traduir-lo
  • regulation of cholesterol biosynthetic process Podeu traduir-lo
  • lipid transport Podeu traduir-lo
  • desenvolupament neuronal Podeu corregir-lo
  • leukocyte migration Podeu traduir-lo
  • response to carbohydrate Podeu traduir-lo
  • retinoid metabolic process Podeu traduir-lo
  • steroid metabolic process Podeu traduir-lo
  • triglyceride mobilization Podeu traduir-lo
  • lipid catabolic process Podeu traduir-lo
  • response to lipopolysaccharide Podeu traduir-lo
  • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation Podeu traduir-lo
  • cellular response to prostaglandin stimulus Podeu traduir-lo
  • response to virus Podeu traduir-lo
  • positive regulation of lipid storage Podeu traduir-lo
  • cellular response to tumor necrosis factor Podeu traduir-lo
  • response to selenium ion Podeu traduir-lo
  • flagellated sperm motility Podeu traduir-lo
  • positive regulation of gene expression Podeu traduir-lo
  • resposta a una substància orgànica Podeu corregir-lo
  • cholesterol homeostasis Podeu traduir-lo
  • espermatogènesi 
  • triglyceride catabolic process Podeu traduir-lo
  • cholesterol efflux Podeu traduir-lo
  • post-embryonic development Podeu traduir-lo
  • lipoprotein transport Podeu traduir-lo
  • toll-like receptor signaling pathway Podeu traduir-lo
  • response to estradiol Podeu traduir-lo
  • membrane organization Podeu traduir-lo
  • chylomicron remodeling Podeu traduir-lo
  • low-density lipoprotein particle remodeling Podeu traduir-lo
  • chylomicron assembly Podeu traduir-lo
  • very-low-density lipoprotein particle assembly Podeu traduir-lo
  • chylomicron remnant clearance Podeu traduir-lo
  • low-density lipoprotein particle clearance Podeu traduir-lo
  • very-low-density lipoprotein particle clearance Podeu traduir-lo
  • lipoprotein metabolic process Podeu traduir-lo
  • lipoprotein biosynthetic process Podeu traduir-lo
  • lipoprotein catabolic process Podeu traduir-lo
  • modificació postraduccional 
  • transport Podeu corregir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

338

238055

Ensembl

ENSG00000084674

ENSMUSG00000020609

UniProt

P04114

E9Q414

RefSeq (ARNm)

NM_000384

NM_009693

RefSeq (proteïna)

NP_000375

NP_033823

Localització (UCSC)Chr 2: 21 – 21.04 MbChr 12: 8.03 – 8.07 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

L'apolipoproteïna B, coneguda també amb el nom d'ApoB i codificada pel gen APOB, pertany al grup de les apolipoproteïnes,[5] proteïnes involucrades en el transport de lípids al llarg del corrent sanguini, així com en la caracterització de les lipoproteïnes, de les quals en formen part.

Existeixen dos tipus de apolipoproteïnes B que es diferencien bàsicament entre elles per la seva llargada i el seu lloc de síntesi, la ApoB100 és sintetitzada al fetge mentre que la ApoB48 ho és al duodè.[6]

Estructura

L'ApoB-100 i l'ApoB-48 presenten diferències a nivell d'estructura[7] primària, ja que la segona és un fragment de la primera.

ApoB-100

Estructura de l'ApoB-100 amb els seus dominis, la zona de truncament per sintetitzar l'ApoB-48 i la d'unió als receptors de les LDL.
Escala Kyte-Doolittle ApoB-100
  • Molècula de LDL amb una molècula d'ApoB-100 unida

L'ApoB-100[8] està formada per una cadena de 4563 aminoàcids i té un pes molecular de 550 kDa.[9] En ella podem diferenciar-hi cinc dominis diferents, dos dominis en hèlix α, dos en làmina β i un domini βα1. Els dos dominis en hèlix α, anomenats α₂ i α₃ conformen regions d'alta flexibilitat que s'associen amb lípids de forma no permanent. Els dominis en làmina β, β1 i β₂, respectivament, s'encarreguen també de vincular-se amb molècules lipídiques, però en aquest cas de forma irreversible i només per les regions apolars. La cara soluble en aigua d'aquests dominis queda exposada a l'entorn. El domini βα1 consta d'un subdomini en forma de barril β i dos altres subdominis que junts s'encarreguen de captar fosfolípids del reticle endoplasmàtic per conformar les lipoproteïnes. De l'aminoàcid 3373 al 3393 conté la regió encarregada de la unió amb el receptor de les lipoproteïnes de baixa densitat (LDL). Un dels mètodes per tal de desxifrar aquests dominis és amb l'anàlisi de la hidrofobicitat dels aminoàcids que els formen mitjançant escales d'hidrofobicitat[10][11] com l'escala Kyte-Doolittle que atorga valors d'hidrofobicitat a cada aminoàcid. A la regió que s'uneix amb el receptor de LDL, de l'aminòacid 3373 al 3393, la hidrofobicitat es baixa, ja que es troba en contacte amb altres molècules polars. D'altra banda, l'ApoB-100[12] presenta varietat a nivell d'hidrofobicitat i hidrofilicitat al tenir regions a l'interior de LDL i a l'exterior com es pot veure a l'animació.

Escala Kyte-Doolittle aminoàcids 3373-3393 ApoB-100

ApoB-48

L'ApoB-48 està formada per una cadena de 2179 aminoàcids i té un pes molecular de 250 kDa.[13] Es tracta d'una proteïna truncada,[14] ja que conté el 48% de la cadena de l'Apo-B, que correspon als dos primers dominis de l'ApoB-100 juntament amb una porció del tercer.[9] L'hi manca el C-terminal i no pot unir-se a les LDL. Aquest truncament és una modificació post-transcripcional i el realitza l'enzim citidina desaminasa, que canvia una Citidina per una Uridina, fet que al seu torn comporta la modificació d'un codó CAA que codifica per la glutamina a UAA, codó de parada que posa fi a la seqüència.

Funció

Degut a les diferències que existeixen entre la ApoB-100 i la ApoB-48 la seva principal funció serà diferent.

ApoB-100

La apolipoproteïna B-100 és un dels principals constituents de les lipoproteïnes de densitat intermèdia (IDL), de baixa densitat (LDL) i també de les de molt baixa densitat (VLDL), d'aquesta forma participa en el transport del colesterol al llarg de l'organisme.

Quan ingerim lípids, els quilomicrons els transporten des del tub digestiu fins al fetge. Allà els lípids s'empaqueten i són combinats amb l'apolipoproteïna B-100. Aquesta combinació dona lloc a unes lipoproteïnes de molt baixa densitat, les VLDL, riques en triacilglicèrids i que contenen cada una molècula d'ApoB-100. Els triacilglicèrids són eliminats per l'enzim lipoproteïna lipasa. A mesura que es van perdent triacilglicèrids i la molècula es va reduint, s'obtenen lipoproteïnes de densitat intermèdia (IDL) i posteriorment lipoproteïnes de baixa densitat, colesterol LDL popularment conegut com a “colesterol dolent” (ja que aquest és causant de malalties cardiovasculars).

La imatge mostra l'estructura d'un quilomicró; hi podem veure diferents tipus d'apolipoproteïnes juntament amb fosfolípids (amb el cap verd i la cua groga) que engloben colesterol (C) i triacilglicèrids (T).

Cada partícula de LDL continua tenint una molècula d'ApoB-100, per aquest motiu sovint es mesuren els nivells d'ApoB-100 en sang per determinar la quantitat de colesterol, ja que són un reflex dels nivells de LDL.[15]

A més l'ApoB-100 té una funció molt important en l'entrada del colesterol a les cèl·lules, ja que és reconeguda pels receptors de LDL de les membranes cel·lulars i s'hi uneix actuant com a lligand. D'aquest forma el colesterol entra a la cèl·lula. Un cop dins, la ApoB-100 es degrada als lisosomes i una lipasa dona el colesterol a les cèl·lules.[16]

ApoB-48

La apolipoproteïna B-48 forma part dels quilomicrons, que són lipoproteïnes esfèriques sintetitzades a les cèl·lules epitel·lials de l'intestí. La funció principal d'aquesta és, juntament amb l'ApoE, actuar com a marcador dels quilomicrons que es troben al fetge perquè siguin reconeguts i posteriorment, mitjançant la endocitosi, siguin eliminats.

Gen APOB i malalties associades a mutacions del gen

El gen de l'apolipoproteïna B, de 43 kb, disposa de 28 introns i 29 exons[17] i conté la informació per la traducció de les dues versions de la proteïna; la versió curta, ApoB48 i la versió llarga, ApoB100.

La localització del gen[18] correspon al locus 2p24.1 del braç curt del cromosoma dos.

Les conseqüències associades a la modificació estructural del gen APOB causen trastorns coneguts.

Localització del gen APOB al cromosoma dos, englobat amb un cercle vermell a la imatge.

Hipobetalipoproteinemia

La hipobetalipoproteinemia[19] és una anomalia poc freqüent relacionada amb baixos nivells de colesterol i d'apolipoproteïnes, causant de la mala absorció i el mal transport dels lípids i vitamines liposolubles pel cos. Afecta els pacients homozigots respecte el gen amb el trastorn.

Normalment és deguda a la síntesi d'una de les dues isoformes de la proteïna (ApoB) massa curtes. El grau de disfunció ve determinat precisament per la llargada de la molècula (com més curta pitjor) i per l'abast de l'afectació; en cas que perjudiqui les dues isoformes és més greu.

Hipercolesterolèmia

La hipercolesterolèmia[20] és una afecció caracteritzada pels alts nivells de colesterol en sang que causa malalties, en gran part cardiovasculars. Pot aparèixer a partir d'una mutació al gen APOB, tot i que aquest no té un paper clau en la manifestació de l'hipercolesterolèmia (la mutació del gen correspon a menys del cinc per cent de causes que provoquen l'afecció).[21]

L'alteració és deguda a l'alta concentració de les molècules que transporten els lípids per la sang, entre elles, les apolipoproteïnes B. El tipus de molècula transportadora determina la malaltia.

La mutació causa que l'apolipoproteïna malmesa no es pugui unir als receptors de membrana i, en conseqüència, aquesta es queda a la sang, la qual cosa fa augmentar el nivell de colesterol en sang. L'excés d'aquest colesterol provoca la seva dipositació en llocs anormals, com ara en les artèries que subministren sang al cor, augmentant així el risc d'atac de cor.

Pel fet d'aquesta dipositació de colesterol excessiva, diversos estudis han demostrat que la concentració d'apolipoproteïna B plasmàtica és un bon paràmetre per detectar arterioesclerosi. Aquesta malaltia crònica consisteix en l'enduriment natural de les parets de les artèries tot i que es pot accelerar per l'abús d'ingesta d'àcids grassos o colesterol. Tot això ens permet veure l'apolipoproteïna com una diana terapèutica.[22]

Per reduir l'excés d'Apo-B i de colesterol en sang s'ha de practicar exercici i seguir una dieta equilibrada.

Vegeu també

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000084674 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020609 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. «apolipoproteina B | ScyKness» (en castellà). [Consulta: 18 octubre 2018].
  6. «apolipoproteina B | ScyKness» (en castellà). [Consulta: 21 octubre 2018].
  7. «ApoB». [Consulta: 17 octubre 2018].
  8. «APOB - Apolipoprotein B-100 precursor - Homo sapiens (Human) - APOB gene & protein» (en anglès). [Consulta: 17 octubre 2018].
  9. 9,0 9,1 «ScienceDirect». [Consulta: 17 octubre 2018].
  10. «Crear escales d'hidrofobicitat a partir de la seqüència d'aminoàcids».
  11. «Hydrophobicity scales» (en anglès).
  12. «Seqüència d'aminoàcids completa de l'ApoB-100».
  13. Higuchi, K.; Hospattankar, A. V.; Law, S. W.; Meglin, N.; Cortright, J. «Human apolipoprotein B (apoB) mRNA: identification of two distinct apoB mRNAs, an mRNA with the apoB-100 sequence and an apoB mRNA containing a premature in-frame translational stop codon, in both liver and intestine». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 85, 6, 1988-3, pàg. 1772–1776. ISSN: 0027-8424. PMID: 2450346.
  14. «apolipoproteina B | ScyKness» (en castellà). [Consulta: 17 octubre 2018].
  15. «Apolipoproteína B | Lab Tests Online-ES» (en castellà). [Consulta: 18 octubre 2018].
  16. «Papel de las lipoproteínas». [Consulta: 21 octubre 2018].
  17. «Gene View» (en anglès). Arxivat de l'original el 2018-10-21. [Consulta: 21 octubre 2018].
  18. «Gene». [Consulta: 21 octubre 2018].
  19. «Hipobetalipoproteinemia» (en castellà). [Consulta: 21 octubre 2018].
  20. «Hipercolesterolèmia». [Consulta: 22 octubre 2018].
  21. Viigimaa M. ; Heinsar S. ; Lovic D. ; Katsimardou A. ; Piperidou A. ; Duishvili D «New horizons in the pathogenesis, pathophysiology and treatment of familial hypercholesterolaemia.». Current Pharmaceutical Design.
  22. «Investigació APOB com a marcador d'arteriosclerosi» (en castellà). [Consulta: 22 octubre 2018].