Anexo:Genomas eucariotas secuenciados
Este anexo de genomas eucariotas "secuenciados" contiene todos los eucariotas de los que se sabe que disponen de secuencias completas de genomas nucleares y de orgánulos que han sido secuenciados, ensamblados, anotados y publicados; no se incluyen los genomas en borrador ni las secuencias de orgánulos.
El ADN se secuenció por primera vez en 1977. El primer organismo de vida libre cuyo genoma se secuenció por completo fue la bacteria Haemophilus influenzae, en 1995. En 1996, Saccharomyces cerevisiae (levadura de panadería) fue la primera secuencia del genoma de un eucariota y en 1998 se publicó la primera secuencia del genoma de un eucariota pluricelular, Caenorhabditis elegans.
Protistas
A continuación se presentan los nueve primeros genomas secuenciados de protistas.
Organismo | Tipo | Relevancia | Tamaño del genoma | Número de genes predichos | Organización | Año de finalización |
---|---|---|---|---|---|---|
Guillardia theta | Cryptophyta | Organismo | 0.551 Mb (sólo genoma nucleomorfo) | 465,[1] 513, 598 (UniProt) | Instituto Canadiense de Investigación Avanzada, Universidad Philipps de Marburgo y Universidad de la Columbia Británica | 2001[1] |
Plasmodium falciparum Clon:3D7 | Apicomplexa | Patógeno humano (malaria) | 22.9 Mb | 5,268[2] | Consorcio del Proyecto Genoma de la Malaria | 2002[2] |
Plasmodium yoelii yoelii Cepa:17XNL | Apicomplexa | Patógeno de roedores (malaria) | 23.1 Mb | 5,878[3] | El TIGR y el Naval Medical Research Command (NMRC) | 2002[3] |
Cryptosporidium hominis Cepa:TU502 | Apicomplexa | Patógeno humano | 10.4 Mb | 3,994[4] | Universidad de la Mancomunidad de Virginia | 2004[4] |
Cryptosporidium parvum Aislado C o genotipo 2 | Apicomplexa | Patógeno humano | 16.5 Mb | 3,807[5] | La UCSF y la Universidad de Minnesota | 2004[5] |
Thalassiosira pseudonana Cepa:CCMP 1335 | Diatomea | Organismo modelo | 34.5 Mb | 11,242[6] | Instituto Conjunto del Genoma y Universidad de Washington | 2004[6] |
Trypanosoma cruzi Cepa:CL-Brener | Kinetoplastea | Patógeno humano | 67 Mb | 22,570[7] | Instituto de Investigación Genómica (TIGR) e Instituto Karolinska (KI) e Instituto de Investigación Biomédica de Seattle (SBRI) | 2005[7] |
Trypanosoma brucei Clon:TREU 927/4 | Kinetoplastea | Patógeno humano | 26 Mb | 9,068[8] | Instituto Wellcome Trust Sanger e Instituto de Investigación Genómica (TIGR) | 2005[8] |
Leishmania major Cepa: Friedlin | Kinetoplastea | Patógeno humano | 32.8 Mb | 8,272[9] | Instituto Wellcome Trust Sanger e Instituto de Investigación Biomédica de Seattle (SBRI) | 2005[9] |
Plantas
A continuación se presentan los cinco primeros genomas secuenciados de plantas.
Organismo | Tipo | Relevancia | Tamaño del genoma | Número de cromosomas | Número de genes predichos | Organización | Año de finalización |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Arabidopsis thaliana Ecotipo:Columbia | Mostaza silvestre Thale Cress | Planta modelo | 135 Mb[10] | 5 | 25,498,[11] 27,400,[12] 31,670 (UniProt) | Iniciativa sobre el genoma de Arabidopsis[13] | 2000[11] |
Cyanidioschyzon merolae Cepa:10D | Rhodophyta | Eucariota simple | 16.5 Mb | 20 | 5,331[14] | Universidad de Tokio, Universidad de Rikkyo, Universidad de Saitama y Universidad de Kumamoto | 2004[14] |
Oryza sativa ssp indica | Arroz | Cultivo y organismo modelo | 420 Mb | 12 | 32-50,000[15] | Instituto de Genómica de Pekín, Universidad de Zhejiang y Academia China de las Ciencias | 2002[15] |
Ostreococcus tauri | Alga verde | Eucariota simple, genoma pequeño | 12.6 Mb | 7,969 (UniProt) | Laboratorio Arago | 2006[16] | |
Populus trichocarpa | Álamo balsámico o álamo negro | Secuestro de carbono, árbol modelo, uso comercial (madera) y comparación con A. thaliana | 550 Mb | 19 | 45,555[17] | Consorcio Internacional del Genoma del Álamo | 2006[17] |
Hongos
A continuación figuran los cinco primeros genomas secuenciados de hongos.
Organismo | Tipo | Relevancie | Tamaño del genoma | Número de genes predichos | Organización | Año de finalización |
---|---|---|---|---|---|---|
Saccharomyces cerevisiaeCepa:S288C | Saccharomycetes | Levadura de panadería; modelo eucariota | 12.1 Mb | 6,294[18] | Colaboración internacional para la secuenciación del genoma de la levadura[19] | 1996[18] |
Encephalitozoon cuniculi | Microsporidia | Patógeno humano | 2.9 Mb | 1,997[20] | Genoscope y Universidad Blaise Pascal | 2001[20] |
Schizosaccharomyces pombeCepa:972h- | Schizosaccharomycetaless | Modelo eucariota | 14 Mb | 4,824[21] | Sanger Institute y Cold Spring Harbor Laboratory | 2002[21] |
Neurospora crassa | Sordariomycetes | Modelo eucariota | 40 Mb | 10,082[22] | Instituto Broad, Universidad de Salud y Ciencia de Oregón, Universidad de Kentucky, and the Universidad de Kansas | 2003[22] |
Phanerochaete chrysosporiumCepa:RP78 | Agaricomycetes | Hongos de pudrición de la madera, uso en micorremediación | 30 Mb | 11,777[23] | Instituto Conjunto del Genoma | 2004[23] |
Animales
A continuación se presentan los cinco primeros genomas secuenciados de animales.
Organismo | Tipo | Relevancia | Tamaño del genoma | Número de genes predichos | Organización | Año de finalización |
---|---|---|---|---|---|---|
Caenorhabditis elegansCepa:Bristol N2 | Nematoda | Animal modelo | 100 Mb | 19,000[24] | Universidad de Washington e Instituto Sanger | 1998[24] |
Drosophila melanogaster | Mosca de la fruta | Animal modelo | 165 Mb | 13,600[25] | Celera, UC Berkeley, Baylor College of Medicine, DGP europea | 2000[25] |
Anopheles gambiaeCepa: PEST | Mosquito | Vector de la malaria | 278 Mb | 13,683[26] | Celera Genomics and Genoscope | 2002[26] |
Takifugu rubripes | Pez globo | Vertebrado con genoma pequeño | 390 Mb | 22–29,000[27] | Consorcio Internacional del Genoma del Fugu[28] | 2002[29] |
Homo sapiens | Humano | 3.2 Gb[30] | 18,826 (Consorcio CCDS) | Consorcio del Proyecto Genoma Humano y Celera Genomics | proyecto en 2001[31][32] Completo en 2006[33] |
Véase también
Referencias
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Enlaces externos
- Diark - a resource for eukaryotic genome research
- EMBL-EBL Eukaryotic Genomes
- UCSC Genome Browser
- International Sequencing Consortium - Large-scale Sequencing Project Database
- Ensembl The Ensembl Genome Browser (includes draft and low coverage genomes)
- GOLD:Genomes OnLine Database v 3.0
- SUPERFAMILY comparative genomics database Includes genomes of all completely sequenced eukaryotes, and sophisticated datamining plus visualisation tools for analysis
- Rat Genome Database
- Esta obra contiene una traducción derivada de «List of sequenced eukaryotic genomes» de Wikipedia en inglés, concretamente de esta versión, publicada por sus editores bajo la Licencia de documentación libre de GNU y la Licencia Creative Commons Atribución-CompartirIgual 4.0 Internacional.
- Datos: Q6638166