ACTN1

ACTN1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2EYI, 2EYN, 2N8Z, 2N8Y

Identifiants
AliasesACTN1
IDs externesOMIM: 102575 MGI: 2137706 HomoloGene: 55553 GeneCards: ACTN1
Position du gène (Homme)
Chromosome 14 humain
Chr.Chromosome 14 humain[1]
Chromosome 14 humain
Localisation génomique pour ACTN1
Localisation génomique pour ACTN1
Locus14q24.1|14q22-q24Début68,874,128 bp[1]
Fin68,979,440 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 12 (souris)
Chr.Chromosome 12 (souris)[2]
Chromosome 12 (souris)
Localisation génomique pour ACTN1
Localisation génomique pour ACTN1
Locus12 C3|12 36.49 cMDébut80,214,321 bp[2]
Fin80,307,145 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • Veine saphène

  • aorte ascendante

  • artère coronaire droite

  • artère poplitée

  • Tibial arteries

  • stromal cell of endometrium

  • Descending thoracic aorta

  • muscle lisse

  • Myomètre

  • muqueuse gastrique
Fortement exprimé dans
  • vestibular membrane of cochlear duct

  • Ileal epithelium

  • granulocyte

  • strie vasculaire

  • tunica media of zone of aorta

  • endothelial cell of lymphatic vessel

  • aorte ascendante

  • artère carotide externe

  • artère carotide interne

  • corps ciliaire
Plus de données d'expression de référence
BioGPS




Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • calcium liaison ionique
  • protein homodimerization activity
  • transmembrane transporter binding
  • vinculin binding
  • liaison ion métal
  • integrin binding
  • actin filament binding
  • liaison protéique
  • nuclear receptor coactivator activity
  • liaison ARN double brin
  • actin binding
  • structural constituent of postsynapse
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • cytosol
  • prolongement cellulaire
  • pseudopode
  • membrane
  • jonction cellule-cellule
  • focal adhesion
  • ruffle
  • membrane plasmique
  • intracellulaire
  • stress fiber
  • région extracellulaire
  • jonction cellulaire
  • Z discdkac
  • bordure en brosse
  • filament d'actine
  • fascia adherens
  • exosome
  • cytosquelette
  • platelet alpha granule lumen
  • Sarcomère
  • milieu extracellulaire
  • glutamatergic synapse
Processus biologique
  • regulation of apoptotic process
  • organisation des filaments d'actine
  • actin filament network formation
  • platelet degranulation
  • thrombocytopoïèse
  • actin filament bundle assembly
  • focal adhesion assembly
  • actin crosslink formation
  • platelet morphogenesis
  • Agrégation plaquettaire
  • platelet activation
  • regulation of nucleic acid-templated transcription
  • postsynapse organization
  • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

87

109711

Ensembl

ENSG00000072110

ENSMUSG00000015143

UniProt

P12814

Q7TPR4

RefSeq (mRNA)

NM_001102
NM_001130004
NM_001130005

NM_134156
NM_001346669
NM_001379075
NM_001379076

RefSeq (protéine)

NP_001093
NP_001123476
NP_001123477
NP_001093.1

NP_001333598
NP_598917
NP_001366004
NP_001366005

Localisation (UCSC)Chr 14: 68.87 – 68.98 MbChr 12: 80.21 – 80.31 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'ACTN1 est l'une des quatre alpha-actinines. Son gène est ACTN1 situé sur le chromosome 14 humain

Rôle

Il se fixe sur l'actine et fait partie du cytosquelette.

En médecine

Une mutation du gène provoque une thrombopénie modérée[5], probablement par désorganisation du cytosquelette des mégacaryocytes, donnant des plaquettes sanguines de grande taille et en nombre réduit[6].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000072110 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015143 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Bottega R, Marconi C, Faleschini M et al. ACTN1-related thrombocytopenia: identification of novel families for phenotypic characterization, Blood, 2015;125:869–872
  6. Kunishima S, Okuno Y, Yoshida K et al. ACTN1 mutations cause congenital macrothrombocytopenia, Am J Hum Genet, 2013;92:431–438
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