Alteromonadales
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Domaine | Bacteria |
---|---|
Embranchement | Pseudomonadota |
Classe | Gammaproteobacteria |
Ordre
Bowman et McMeekin[1] 2005
Les Alteromonadales forment un ordre de bactéries Gram négatif de la classe des Gammaproteobacteria, embranchement des Pseudomonadota. Cet ordre contient notamment les bactéries du genre Alteromonas.
Taxonomie
Étymologie
L'ordre Alteromonadales a été nommé ainsi d'après le genre type qui lui a été assigné, Alteromonas[1]. Son étymologie est la suivante : Al.ter.o.mon.a.da’les N.L. fem. n. Alteromonas, genre type de l'ordre; L. fem. pl. n. suff. -ales, suffixe pour dénommer un ordre; N.L. fem. pl. n. Alteromonadales, l'ordre des Alteromonas[1],[2].
Historique
L'ordre Alteromonadales a été décrit en dans le Bergey's Manual avec une seule famille, la famille Alteromonadaceae[1] et la même année dans la liste des nouveaux noms n°106 se sont ajoutées sept autres familles[3]. Cet ordre a été positionné dans la classe des Gammaproteobacteria sur la base des analyses phylogénétiques des séquences d'ARN ribosomal 16S et des caractéristiques biochimiques pour accommoder diverses bactéries marines qui forment un clade au sein des Gammaproteobacteria[1]. Avant ce reclassement de , la plupart des bactéries de cet ordre étaient classées parmi les Vibrionaceae (ex les Shewanella ou Moritella) ou non classées comme les Alteromonas[1].
La première famille incluse dans cet ordre est celle des Aeromonadaceae, décrite en 2001[4] mais amendée en 2005 par l'ajout de nouveaux genres bactériens[1]. Les sept familles suivantes ont été celles décrites par Ivanova et al. en 2004[5] juste avant la publication du Bergey's Manual[1] et validé en 2005 après celle-ci[3]. La dernière famille en date ajoutée en 2011 est celle des Celerinatantimonadaceae[6].
Liste des familles
Selon la LPSN (7 novembre 2022)[7], l'ordre des Alteromonadales compte 9 familles publiées de manière valide:
- Alteromonadaceae Ivanova & Mikhailov 2001.
- Celerinatantimonadaceae Cramer et al. 2011.
- Colwelliaceae Ivanova et al. 2004.
- Ferrimonadaceae Ivanova et al.2004.
- Idiomarinaceae Ivanova et al. 2004.
- Moritellaceae Ivanova et al. en 2004.
- Pseudoalteromonadaceae Ivanova et al. 2004.
- Psychromonadaceae Ivanova et al. 2004.
- Shewanellaceae Ivanova et al. 2004.
Description
Lors de sa description de , l'ordre Alteromonadales est composé de bactéries à Gram négatif. Ce sont des bacilles à morphologie droite ou incurvée et mobiles par l'intermédiaire d'un flagelle polaire unique[1]. Ces bacilles ne forment pas d'endospores ni de kystes. La majeure partie des bactéries de cet ordre sont des chimiohétérotrophes soit anaérobies facultatifs soit aérobies stricts et qui utilisent l'oxygène comme accepteur d'électrons[1]. La plupart des bactéries de cet ordre sont catalase et oxydase positives. Il existe différents types de régimes de croissance : psychrophiles, psychrotolérants et mésophiles. La plupart des espèces nécessitent des ions sodium pour leur croissance et cette croissance est optimale dans des milieux à base d'eau de mer. La source d'azote peut être de l'ammoniaque[1]. Le Coenzyme Q majoritaire est l'ubiquinone-8[1].
Le pourcentage en bases nucléotidiques GC de l'ADN est situé entre 36 % et 54 54% en [1].
En général, ce ne sont pas des bactéries pathogènes[1].
Habitats
Les bactéries de l'ordre des Alteromonadales sont des bactéries marines. Elles peuvent résider dans différents écosystèmes marins tels que les eaux de surface ou la glace marine ou les sédiments des abysses[1].
Notes et références
- ↑ a b c d e f g h i j k l m n et o Bowman et McMeekin 2005, p. 443.
- ↑ (en) « Order Alteromonadales », sur LPSN,
- ↑ a et b (en) Jean Euzéby, « Validation List no. 106. Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IUMS, vol. 55, , p. 2235–2238 (DOI 10.1099/ijs.0.64108-0)
- ↑ (en) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiology, vol. 70, , p. 10–17 (DOI 10.1023/A:1004876301036)
- ↑ (en) Elena P. Ivanova, Sébastien Flavier et Richard Christen, « Phylogenetic relationships among marine Alteromonas-like proteobacteria: emended description of the family Alteromonadaceae and proposal of Pseudoalteromonadaceae fam. nov., Colwelliaceae fam. nov., Shewanellaceae fam. nov., Moritellaceae fam. nov., Ferrimonadaceae fam. nov., Idiomarinaceae fam. nov. and Psychromonadaceae fam. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 54, no 5, , p. 1773-1788
- ↑ (en) Melissa J. Cramer, Nicole Haghshenas, Christopher E. Bagwell, George Y. Matsui et Charles R. Lovell, « Celerinatantimonas diazotrophica gen. nov., sp. nov., a nitrogen-fixing bacterium representing a new family in the Gammaproteobacteria, Celerinatantimonadaceae fam. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 61, no 5, , p. 1053-1060 (DOI 10.1099/ijs.0.017905-0)
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 7 novembre 2022
Bibliographie
- (en) John P. Bowman et Thomas A. McMeekin, « Order X. Alteromonadales ord. nov. », dans Brenner Don J., Krieg Noel R., Staley James T., Garrity GM (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), New York, Springer, , p. 443
Liens externes
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- Ressources relatives au vivant
:
- EPPO Global Database
- Global Biodiversity Information Facility
- iNaturalist
- Interim Register of Marine and Nonmarine Genera
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
- New Zealand Organisms Register
- Système d'information taxonomique intégré
- World Register of Marine Species
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