CYP2R1

CYP2R1
Structure de la protéine CYP2R1. Basé sur l'identifiant PDB 2ojd.
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

3C6G, 3CZH, 3DL9

Identifiants
AliasesCYP2R1, Cytochrome P450 2R1, Vitamine D 25-hydroxylase
IDs externesOMIM: 608713 MGI: 2449771 HomoloGene: 75210 GeneCards: CYP2R1
Position du gène (Homme)
Chromosome 11 humain
Chr.Chromosome 11 humain[1]
Chromosome 11 humain
Localisation génomique pour CYP2R1
Localisation génomique pour CYP2R1
Locus11p15.2Début14,877,440 bp[1]
Fin14,892,231 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 7 (souris)
Chr.Chromosome 7 (souris)[2]
Chromosome 7 (souris)
Localisation génomique pour CYP2R1
Localisation génomique pour CYP2R1
Locus7|7 F1Début114,148,917 bp[2]
Fin114,162,207 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • sperme

  • left testis

  • right testis

  • gonade

  • body of pancreas

  • skin of abdomen

  • skin of leg

  • mucosa of transverse colon

  • body of stomach

  • rectum
Fortement exprimé dans
  • left lobe of liver

  • spermatocyte

  • embryon

  • embryon

  • primary oocyte

  • secondary oocyte

  • right kidney

  • zygote

  • tail of embryo

  • tube séminifère
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • iron ion binding
  • liaison ion métal
  • monooxygenase activity
  • heme binding
  • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
  • activité d'oxydoréductase
  • vitamin D3 25-hydroxylase activity
  • steroid hydroxylase activity
  • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen
Composant cellulaire
  • membrane d'un organite
  • membrane du réticulum endoplasmique
  • intracellular membrane-bounded organelle
  • membrane
  • réticulum endoplasmique
  • cytoplasme
Processus biologique
  • response to ionizing radiation
  • vitamin D metabolic process
  • response to metal ion
  • vitamin metabolic process
  • calcitriol biosynthetic process from calciol
  • response to cesium ion
  • organic acid metabolic process
  • xenobiotic metabolic process
  • vitamin D biosynthetic process
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

120227

244209

Ensembl

ENSG00000186104

ENSMUSG00000030670

UniProt

Q6VVX0

Q6VVW9

RefSeq (mRNA)
NM_024514
NM_001377214
NM_001377215
NM_001377216
NM_001377217

NM_001377227

NM_177382

RefSeq (protéine)
NP_078790
NP_001364143
NP_001364144
NP_001364145
NP_001364146

NP_001364156

NP_796356

Localisation (UCSC)Chr 11: 14.88 – 14.89 MbChr 7: 114.15 – 114.16 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
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Le CYP2R1 est le cytochrome P450 2R1, une enzyme qui est la principale vitamine D 25-hydroxylase[5],[6]..Chez l'homme, il est codé par le gène CYP2R1 situé sur le chromosome 11p15.2[7]. Il est exprimé dans le réticulum endoplasmique du foie, où il effectue la première étape de l'activation de la vitamine D en catalysant la formation de 25-hydroxyvitamine D[8].

L'activité de la vitamine D 25-hydroxylase est également possédée par certaines autres enzymes du cytochrome P450, en particulier le CYP27A1, qui se trouve dans les mitochondries[8],[9].

Fonction

Conversion du cholécalciférol en calcidiol catalysée par le CYP2R1.

Le CYP2R1 fait partie de la superfamille des enzymes du cytochrome P450[10]. Les protéines du cytochrome P450 sont des mono-oxygénases qui catalysent de nombreuses réactions impliquées dans le métabolisme des médicaments et la synthèse du cholestérol, des stéroïdes et d'autres lipides[10].

Le CYP2R1 est présent dans le réticulum endoplasmique du foie (la fraction microsomale ). Il a une activité 25-hydroxylase, qui convertit le cholécalciférol (vitamine D 3 ) en calcifediol (25-hydroxyvitamine D 3, également connu sous le nom de calcidiol), la principale forme circulatoire de la vitamine[8],[9]. Le CYP2R1 hydroxylera également l'ergocalciférol (vitamine D 2 ), dérivé de sources alimentaires, en 25-hydroxyvitamine D 2 (ercalcidiol)[8]. Ces formes 25-hydroxylées de vitamine D, connues sous le nom de 25(OH)D, se lient fortement à la protéine liant la vitamine D dans le sang et sont les principales formes circulantes de vitamine D. Celles-ci sont couramment mesurées pour déterminer le statut en vitamine D d'une personne et permet d'établir une carence en vitamine D[11].

Le calcifédiol est ensuite converti par l'action de la 25-hydroxyvitamine D3 1-alpha-hydroxylase en calcitriol, la forme active de la vitamine D3 qui se lie au récepteur de la vitamine D (VDR) et médie la plupart des actions hormonales physiologiques de la vitamine D[5].

Importance clinique

La conversion de la vitamine D, en particulier du cholécalciférol, en 25(OH)D (calcifediol) est l'une des étapes clés du système hormonal de la vitamine D. On pensait auparavant que l'activité enzymatique du CYP2R1 réalisant ce processus était exprimée de manière constitutive et stable, de sorte que le sérum 25(OH)D était une mesure de l'apport de vitamine D[9].

Le CYP2R1 est maintenant connu pour être régulé, avec des variations dans l'expression et l'activité du CYP2R1 affectant le 25(OH)D circulant[9]. De faibles niveaux d'activité du CYP2R1 ont été trouvés après un jeûne de 24 heures, dans l'obésité, le diabète de type 1 et de type 2[12] et sont diminués par les glucocorticoïdes tels que la dexaméthasone[9]. Ces conditions sont connues pour être liées à de faibles taux sanguins de 25(OH)D, où même de fortes doses de vitamine D peuvent ne pas produire d'amélioration, ce qui peut s'expliquer par des activités enzymatiques faibles[9].

Polymorphismes du CYP2R1

Les variations polymorphes du gène CYP2R1 ont le plus grand effet sur les concentrations sériques individuelles de 25(OH)D, par rapport aux autres variations génétiques[13]. Une mutation héréditaire du gène CYP2R1 L99P, qui entraîne la substitution d'une proline à un résidu leucine au codon 99, élimine l'activité enzymatique et est associée à une forme rachitisme. Un autre variant, le K242N, où la lysine en position 242 est remplacée par l'asparagine, donne un phénotype similaire[14]. Les symptômes sont de faibles taux circulants de 25(OH)D et des symptômes classiques de carence en vitamine D[5],[15].

Études chez la souris

Des organismes modèles ont été utilisés dans l'étude de la fonction du CYP2R1. Des souris ont été générées sans Cyp2r1 et à la fois sans Cyp2r1 ni Cyp27a1[16].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000186104 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030670 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. a b et c « De-orphanization of cytochrome P450 2R1: a microsomal vitamin D 25-hydroxilase », J Biol Chem, vol. 278, no 39,‎ , p. 38084–93 (PMID 12867411, PMCID 4450819, DOI 10.1074/jbc.M307028200)
  6. « Genetic evidence that the human CYP2R1 enzyme is a key vitamin D 25-hydroxylase », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 101, no 20,‎ , p. 7711–5 (PMID 15128933, PMCID 419671, DOI 10.1073/pnas.0402490101, Bibcode 2004PNAS..101.7711C)
  7. « Entrez Gene: CYP2R1 cytochrome P450, family 2, subfamily R, polypeptide 1 »
  8. a b c et d « Vitamin D metabolism, mechanism of action, and clinical applications », Chemistry & Biology, vol. 21, no 3,‎ , p. 319–29 (PMID 24529992, PMCID 3968073, DOI 10.1016/j.chembiol.2013.12.016)
  9. a b c d e et f « Vitamin D Metabolism Revised: Fall of Dogmas », Journal of Bone and Mineral Research, vol. 34, no 11,‎ , p. 1985–1992 (PMID 31589774, PMCID 9000993, DOI 10.1002/jbmr.3884)
  10. a et b Nelson DR, « Comparison of P450s from human and fugu: 420 million years of vertebrate P450 evolution », Arch Biochem Biophys, vol. 409, no 1,‎ , p. 18–24 (PMID 12464240, DOI 10.1016/S0003-9861(02)00553-2)
  11. (en) « Office of Dietary Supplements - Vitamin D », ods.od.nih.gov, (consulté le )
  12. « CYP2R1 (vitamin D 25-hydroxylase) gene is associated with susceptibility to type 1 diabetes and vitamin D levels in Germans. », Diabetes Metab. Res. Rev., vol. 23, no 8,‎ , p. 631–6 (PMID 17607662, DOI 10.1002/dmrr.719, S2CID 376070)
  13. « Low-Frequency Synonymous Coding Variation in CYP2R1 Has Large Effects on Vitamin D Levels and Risk of Multiple Sclerosis », American Journal of Human Genetics, vol. 103, no 6,‎ , p. 1053 (PMID 30526863, PMCID 6288274, DOI 10.1016/j.ajhg.2018.11.010)
  14. « CYP2R1 mutations causing vitamin D-deficiency rickets », J Steroid Biochem Mol Biol, vol. 173,‎ , p. 333–336 (PMID 27473561, DOI 10.1016/j.jsbmb.2016.07.014, S2CID 1693344)
  15. « Vitamin D-Dependent Rickets Type 1B (25-Hydroxylase Deficiency): A Rare Condition or a Misdiagnosed Condition? », Journal of Bone and Mineral Research, vol. 32, no 9,‎ , p. 1893–1899 (PMID 28548312, DOI 10.1002/jbmr.3181)
  16. « CYP2R1 is a major, but not exclusive, contributor to 25-hydroxyvitamin D production in vivo », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 110, no 39,‎ , p. 15650–5 (PMID 24019477, PMCID 3785760, DOI 10.1073/pnas.1315006110, Bibcode 2013PNAS..11015650Z)
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