NOD1

NOD1
Structure de la protéine NOD1. Basé sur l'identifiant PDB 2b1w.
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2B1W, 2DBD, 2NSN, 2NZ7, 4E9M, 4JQW

Identifiants
AliasesNOD1
IDs externesOMIM: 605980 MGI: 1341839 HomoloGene: 4440 GeneCards: NOD1
Position du gène (Homme)
Chromosome 7 humain
Chr.Chromosome 7 humain[1]
Chromosome 7 humain
Localisation génomique pour NOD1
Localisation génomique pour NOD1
Locus7p14.3Début30,424,527 bp[1]
Fin30,478,784 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour NOD1
Localisation génomique pour NOD1
Locus6|6 B3Début54,900,934 bp[2]
Fin54,949,597 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • nerf sural

  • left ovary

  • right lobe of thyroid gland

  • right ovary

  • gingival epithelium

  • upper lobe of left lung

  • left lobe of thyroid gland

  • apex of heart

  • subcutaneous adipose tissue

  • rate
Fortement exprimé dans
  • ganglion mésentérique

  • granulocyte

  • subcutaneous adipose tissue

  • nerf ischiatique

  • poumon droit

  • rate

  • col de l'utérus

  • myocardium of ventricle

  • îlot de Langerhans

  • stroma of bone marrow
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison nucléotide
  • protein homodimerization activity
  • liaison protéique
  • peptidoglycan binding
  • identical protein binding
  • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
  • CARD domain binding
  • liaison ATP
  • liaison de complexe macromoléculaire
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • cytosol
  • membrane
  • membrane plasmique
  • basolateral plasma membrane
  • apical plasma membrane
Processus biologique
  • regulation of apoptotic process
  • réponse de défense
  • detection of biotic stimulus
  • intracellular signal transduction
  • positive regulation of cell death
  • processus du système immunitaire
  • positive regulation of JNK cascade
  • positive regulation of xenophagy
  • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
  • cellular response to muramyl dipeptide
  • JNK cascade
  • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
  • positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation
  • positive regulation of nitric-oxide synthase activity
  • defense response to bacterium
  • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
  • protein complex oligomerization
  • detection of bacterium
  • positive regulation of interleukin-1 beta production
  • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
  • positive regulation of interleukin-6 production
  • positive regulation of tumor necrosis factor production
  • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
  • réponse inflammatoire
  • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
  • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway
  • transduction de signal
  • positive regulation of stress-activated MAPK cascade
  • defense response to Gram-positive bacterium
  • apoptose
  • système immunitaire inné
  • interleukin-1-mediated signaling pathway
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

10392

107607

Ensembl

ENSG00000106100

ENSMUSG00000038058

UniProt

Q9Y239

Q8BHB0

RefSeq (mRNA)

NM_006092
NM_001354849

NM_001171007
NM_172729

RefSeq (protéine)

NP_006083
NP_001341778

NP_001164478
NP_766317

Localisation (UCSC)Chr 7: 30.42 – 30.48 MbChr 6: 54.9 – 54.95 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le NOD1 (pour « Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1 ») est une protéine récepteur de type NOD. Son gène est le NOD1, situé sur le chromosome 7 humain.

Rôles

Il est exprimé dans divers organes dans le monde animal.

Il stimule l'apoptose[5].

Il est exprimé par les cardiomyocytes, particulièrement en cas de diabète de type 2[5]. Il intervient également dans la genèse de l'athérome[6]. Il active le NF-κB, pouvant induire une dysfonction du muscle cardiaque[7]. Son expression est aussi augmentée en cas d'insuffisance cardiaque, modulant le calcium intra cellulaire[8].

Notes et références

  1. ↑ a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106100 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038058 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. ↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. ↑ a et b Prieto P, Vallejo-Cremades MT, Benito G et al. NOD1 receptor is up-regulated in diabetic human and murine myocardium, Clin Sci (Lond), 2014;127:165–177
  6. ↑ Kanno S, Nishio H, Tanaka T et al. Activation of an innate immune receptor, Nod1, accelerates atherogenesis in Apoe-/- mice, J Immunol, 2015;194:773–780
  7. ↑ Delgado C, Ruiz-Hurtado G, Gomez-Hurtado N et al. NOD1, a new player in cardiac function and calcium handling, Cardiovasc Res, 2015;106:375–386
  8. ↑ Val-Blasco A, Piedras M, Ruiz-Hurtado G et al. Role of NOD1 in heart failure progression via regulation of Ca2+ handling, J Am Coll Cardiol, 2017;69:423–433
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