PARN

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PARN
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2A1R, 2A1S, 3CTR

Identifiants
AliasesPARN
IDs externesOMIM: 604212 MGI: 1921358 HomoloGene: 31098 GeneCards: PARN
Position du gène (Homme)
Chromosome 16 humain
Chr.Chromosome 16 humain[1]
Chromosome 16 humain
Localisation génomique pour PARN
Localisation génomique pour PARN
Locus16p13.12Début14,435,700 bp[1]
Fin14,632,728 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 16 (souris)
Chr.Chromosome 16 (souris)[2]
Chromosome 16 (souris)
Localisation génomique pour PARN
Localisation génomique pour PARN
Locus16|16 A1Début13,355,824 bp[2]
Fin13,486,034 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • tendon calcanéen

  • corps calleux

  • testicule

  • tonsille

  • epithelium of colon

  • gonade

  • cellule de la moelle osseuse

  • muscle lisse

  • îlot de Langerhans

  • vessie
Fortement exprimé dans
  • valve aortique

  • aorte ascendante

  • corpuscule rénal

  • medullary collecting duct

  • Cellule de Paneth

  • saccule

  • Ectoderme

  • otic vesicle

  • otic placode

  • ligne primitive
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ion métal
  • mRNA 3'-UTR binding
  • liaison protéique
  • Fixation d'acide nucléique
  • activité nucléase
  • exonuclease activity
  • activité hydrolase
  • protein kinase binding
  • cation binding
  • liaison ARN
  • poly(A)-specific ribonuclease activity
  • telomerase RNA binding
  • 3'-5'-exoribonuclease activity
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • cytosol
  • nucléole
  • noyau
Processus biologique
  • mRNA catabolic process
  • female gamete generation
  • regulation of mRNA stability
  • édition du ARN
  • dégradation des ARNm non-sens
  • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
  • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic
  • telomerase RNA stabilization
  • positive regulation of telomere maintenance via telomerase
  • positive regulation of telomerase activity
  • regulation of telomerase RNA localization to Cajal body
  • ncRNA deadenylation
  • box H/ACA RNA 3'-end processing
  • miRNA catabolic process
  • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

5073

74108

Ensembl

ENSG00000140694
ENSG00000274829

ENSMUSG00000022685

UniProt

O95453

Q8VDG3

RefSeq (mRNA)

NM_001134477
NM_001242992
NM_002582

NM_028761
NM_001358452
NM_001358453

RefSeq (protéine)

NP_001127949
NP_001229921
NP_002573

NP_083037
NP_001345381
NP_001345382

Localisation (UCSC)Chr 16: 14.44 – 14.63 MbChr 16: 13.36 – 13.49 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le PARN (pour « Poly(A)-specific ribonuclease ») est une enzyme de type ribonucléase dont le gène est le PARN situé sur le chromosome 16 humain.

Rôle

Il s'agit d'une exoribonucléase dégradant l'extrémité 3' de l'ARN comportant une courte chaîne d'adénosines (d'où le terme « poly(A) »).

Cet enzyme est ubiquitaire chez les eucaryotes[5].

En médecine

Une mutation du gène est responsable d'une dyskératose congénitale[6].

Notes et références

  1. ↑ a b et c ENSG00000274829 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140694, ENSG00000274829 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022685 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. ↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. ↑ Vlachakis D, Pavlopoulou A, Tsiliki G, Komiotis D, Stathopoulos C, Balatsos NA, Kossida S, An integrated in silico approach to design specific inhibitors targeting human poly(A)-specific ribonuclease, PLoS One, 2012;7:e51113
  6. ↑ Tummala H, Walne A, Collopy L et al. Poly(A)-specific ribonuclease deficiency impacts telomere biology and causes dyskeratosis congenita, J Clin Invest, 2015;125:2151-2160
v · m
Superfamille TGF beta
Ligand du ACVR ou TGFBR
Ligand de BMPR
TGFBR
(ACVR, BMPR, Famille)
TGFBR1:
  • Récepteurs d'activine de type 1
    • ACVR1
    • ACVR1B
    • ACVR1C
  • ACVRL1
  • BMPR1
    • BMPR1A
    • BMPR1B
TGFBR2:
  • Récepteurs d'activine de type 2
    • ACVR2A
    • ACVR2B
  • AMHR2
  • BMPR2
TGFBR3:
  • betaglycan
Transducteurs/SMAD
Inhibiteurs de ligands
Corécepteur
  • BAMBI
  • Cripto
Autres
  • SARA
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