Alveolata adalah sebuah kelompok protista, dianggap sebagai klad utama[2] dan superfilum[3] dalam Eukarya. Mereka saat ini dikelompokkan bersama stramenopile dan Rhizaria di antara protista dengan mitokondria tubulokristat ke dalam supergrup SAR.
Karakteristik
Karakteristik yang paling mencolok yang dibagikan adalah keberadaan alveoli kortikal (dekat permukaan). Ini adalah vesikel (kantong) pipih yang disusun sebagai lapisan tepat di bawah membran sel dan mendukungnya, biasanya berkontribusi pada pelikel yang fleksibel (kulit tipis). Pada dinoflagellata bersarung, mereka mungkin mengandung pelat kaku. Alveolata memiliki mitokondria dengan krisa tabung (invaginasi), dan sel sering memiliki intrusi berbentuk pori melalui permukaan sel. Grup ini berisi organisme yang hidup bebas dan parasit, flagelata predator, dan organisme fotosintesis.
Mikrograf elektron transmisi dari irisan tipis permukaan ciliate Paramecium putrinum, menunjukkan alveoli (panah merah) di bawah permukaan sel
Hampir semua genom mitokondria yang disekuensing dari ciliata dan apikompleksa adalah linear.[4] Mitokondria hampir semuanya membawa mtDNA mereka sendiri tetapi dengan ukuran genom yang sangat berkurang. Pengecualian adalah Cryptosporidium yang hanya tersisa dengan mitosom, genom mitokondria melingkar dari Acavomonas dan Babesia microti,[5][6] dan genom mitokondria yang sangat terfragmentasi milik Toxoplasma, terdiri dari 21 blok sekuens yang rekombinasi untuk menghasilkan segmen yang lebih panjang.[7][8]
Filogeni
Pada tahun 2017, Thomas Cavalier-Smith menggambarkan filogeni dari Alveolata sebagai berikut:[9]
Hubungan antara apikompleksa, dinoflagellata, dan silia telah disarankan selama tahun 1980-an, dan hal ini dikonfirmasi pada awal tahun 1990-an melalui perbandingan urutan RNA ribosomal, terutama oleh Gajadhar et al.[10]Cavalier-Smith memperkenalkan nama formal Alveolata pada tahun 1991,[11] meskipun pada saat itu dia menganggap pengelompokan tersebut sebagai himpunan parafilik. Banyak biolog lebih memilih menggunakan nama sehari-hari 'alveolata'.[12]
Referensi
^ Li, C.-W. (2007). "Ciliated protozoans from the Precambrian Doushantuo Formation, Wengan, South China". Geological Society, London, Special Publications. 286: 151–156. doi:10.1144/SP286.11.Parameter |coauthors= yang tidak diketahui mengabaikan (|author= yang disarankan) (bantuan)
^Adl, S.M.; et al. (2012). "The revised classification of eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429–514. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC3483872 . PMID 23020233.
^Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, Brusca RC, Cavalier-Smith T, Guiry MD, Kirk PM (2015). "A higher level classification of all living organisms". PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. doi:10.1371/journal.pone.0119248 . PMC4418965 . PMID 25923521.
^Barth, D; Berendonk, TU (2011). "Sekuen genom mitokondria dari ciliate Paramecium caudatum mengungkap pergeseran dalam komposisi nukleotida dan penggunaan kodon dalam genus Paramecium". BMC Genomics. 12: 272. doi:10.1186/1471-2164-12-272 . PMC3118789 . PMID 21627782.
^Oborník, Miroslav; Lukeš, Julius (2015-10-15). "Genom Organellar dari Chromera dan Vitrella, Kerabat Fototrof Parasit Apikompleksa". Annual Review of Microbiology. 69: 129–144. doi:10.1146/annurev-micro-091014-104449. ISSN 0066-4227. PMID 26092225. Diakses tanggal 2024-04-15.
^Cornillot E, Hadj-Kaddour K, Dassouli A, Noel B, Ranwez V, Vacherie B, Augagneur Y, Brès V, Duclos A, Randazzo S, Carcy B, Debierre-Grockiego F, Delbecq S, Moubri-Ménage K, Shams-Eldin H, Usmani-Brown S, Bringaud F, Wincker P, Vivarès CP, Schwarz RT, Schetters TP, Krause PJ, Gorenflot A, Berry V, Barbe V, Ben Mamoun C (2012). "Sekuensing genom Apikompleksa terkecil dari patogen manusia Babesia microti". Nucleic Acids Res. 40 (18): 9102–14. doi:10.1093/nar/gks700. PMC3467087 . PMID 22833609.
^Namasivayam, Sivaranjani; Baptista, Rodrigo P.; Xiao, Wenyuan; Hall, Erica M.; Doggett, Joseph S.; Troell, Karin; Kissinger, Jessica C. (Mei 2021). "Genom mitokondria terfragmentasi baru dalam patogen protista Toxoplasma gondii dan koksidia jaringan terkait". Genome Research. 31 (5): 852–865. doi:10.1101/gr.266403.120. PMC8092004 Periksa nilai |pmc= (bantuan). PMID 33906963 Periksa nilai |pmid= (bantuan).
^Namasivayam, Sivaranjani; Sun, Cheng; Bah, Assiatu B.; Oberstaller, Jenna; Pierre-Louis, Edwin; Etheridge, Ronald Drew; Feschotte, Cedric; Pritham, Ellen J.; Kissinger, Jessica C. (7 November 2023). "Invasi besar-besaran DNA organellar mendorong evolusi genom nukleus di Toxoplasma". Proceedings of the National Academy of Sciences. 120 (45): –2308569120. Bibcode:2023PNAS..12008569N. doi:10.1073/pnas.2308569120. PMC10636329 Periksa nilai |pmc= (bantuan). PMID 37917792 Periksa nilai |pmid= (bantuan).
^Cavalier-Smith, Thomas (5 September 2017). "Kerajaan Chromista dan delapan filanya: sintesis baru yang menekankan pada penargetan protein periplastid, evolusi sitoskeletal dan periplastid, dan divergensi kuno". Protoplasma. 255 (1): 297–357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3 (tidak aktif 2024-05-03). PMC5756292 . PMID 28875267.
^ Gajadhar, A. A.; et al. (1991). "Urutan RNA ribosomal dari Sarcocystis muris, Theilera annulata, dan Crypthecodinium cohnii mengungkap hubungan evolusioner di antara apikompleksa, dinoflagellata, dan silia". Parasitologi Molekuler dan Biokimia. 45 (1): 147–153. doi:10.1016/0166-6851(91)90036-6. PMID 1904987..
^Cavalier-Smith, T. (1991). "Diversifikasi sel dalam flagelat heterotrof". Dalam Patterson, David J.; Larsen, Jacob; Systematics Association. Biologi flagelat heterotrof bebas. Oxford University Press. hlm. 113–131. ISBN 978-0-19-857747-8.
^Kumar, S. & Rzhetsky, A. 1996. Hubungan evolusioner kerajaan eukariotik. Jurnal Evolusi Molekuler, 42: 183–193