SPTAN1 |
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PDBに登録されている構造 |
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PDB | オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj |
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PDBのIDコード一覧 |
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2FOT, 3F31, 3FB2 |
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識別子 |
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記号 | SPTAN1, EIEE5, NEAS, SPTA2, spectrin alpha, non-erythrocytic 1, DEE5 |
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外部ID | OMIM: 182810 MGI: 98386 HomoloGene: 2353 GeneCards: SPTAN1 |
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遺伝子の位置 (ヒト) |
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| 染色体 | 9番染色体 (ヒト)[1] |
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| バンド | データ無し | 開始点 | 128,552,558 bp[1] |
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終点 | 128,633,662 bp[1] |
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遺伝子の位置 (マウス) |
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| 染色体 | 2番染色体 (マウス)[2] |
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| バンド | データ無し | 開始点 | 29,855,572 bp[2] |
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終点 | 29,921,463 bp[2] |
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遺伝子オントロジー |
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分子機能 | • calcium ion binding • 金属イオン結合 • calmodulin binding • structural constituent of cytoskeleton • 血漿タンパク結合 • actin binding • cadherin binding
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細胞の構成要素 | • 細胞質 • 細胞外ベシクル • 細胞質基質 • スペクトリン • 膜 • intracellular membrane-bounded organelle • microtubule cytoskeleton • 細胞皮質 • エキソソーム • 細胞骨格 • 細胞外領域 • specific granule lumen • tertiary granule lumen
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生物学的プロセス | • MAPK cascade • 軸索誘導 • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • actin filament capping • cytoskeleton organization • 好中球脱顆粒 • regulation of molecular function
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出典:Amigo / QuickGO |
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オルソログ |
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種 | ヒト | マウス |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (mRNA) | NM_001130438 NM_001195532 NM_003127 NM_001363759 NM_001363765
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NM_001375310 NM_001375311 NM_001375312 NM_001375313 NM_001375314 NM_001375318 |
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NM_001076554 NM_001177667 NM_001177668 NM_001309460 NM_001369325 |
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RefSeq (タンパク質) | NP_001123910 NP_001182461 NP_003118 NP_001350688 NP_001350694
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NP_001362239 NP_001362240 NP_001362241 NP_001362242 NP_001362243 NP_001362247 |
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NP_001171138 NP_001171139 NP_001296389 NP_001356254 |
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場所 (UCSC) | Chr 9: 128.55 – 128.63 Mb | Chr 9: 29.86 – 29.92 Mb |
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PubMed検索 | [3] | [4] |
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ウィキデータ |
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αII-スペクトリン(αII-spectrin)、スペクトリンα2(spectrin α2)またはSPTAN1(spectrin alpha, non-erythrocytic 1)は、ヒトではSPTAN1遺伝子にコードされるタンパク質である[5][6][7]。αII-スペクトリンはさまざまな組織で発現しており、心筋のZ線構造、コスタメア(英語版)、筋鞘で高度に発現している。αII-スペクトリンの変異は早期乳児てんかん性脳症(EIEE、発達性てんかん性脳症(DEE)、大田原症候群)5と関係しており、αII-スペクトリンはギラン・バレー症候群と乳児の先天性心疾患のバイオマーカーとして有用である可能性がある。
構造
αII-スペクトリンは選択的スプライシングが行われることが記載されており、複数の転写産物バリアントが生じる。具体的には、心筋細胞(英語版)では4種類のスプライスバリアントが同定されている[8][9]。主に赤血球に存在するαI-スペクトリンとは異なり[10]、αII-スペクトリンはほとんどの組織で発現している。αII-スペクトリンは心筋では筋細胞のZ線構造、コスタメア、筋鞘に存在し[11][12][13]、心臓線維芽細胞では細胞骨格ネットワークの表面に沿って存在している[14]。αII-スペクトリンはβII-スペクトリン(英語版)とのヘテロ二量体として存在するのが最も一般的であり、二量体は自己重合してヘテロ四量体を形成する[5][15][16]。
機能
スペクトリンは広範囲に分布する細胞骨格タンパク質で、アクチンの架橋、細胞接着、細胞間コミュニケーション、細胞周期の調節に関与する[17][18][19]。心筋におけるαII-スペクトリンの役割はあまり理解されていないが、筋鞘下のドメインの組織化と、連続的な心筋収縮と関係したストレスに対する筋鞘の安定化に関与していると考えられている[16]。αII-スペクトリンの機能的多様性は4種類のスプライスバリアントから明らかである。1つ目はαII-cardi+と呼ばれる心臓特異的バリアントで、21番目のスペクトリンリピートに21アミノ酸が挿入されている。挿入はβ-スペクトリンに対する結合親和性を調節し、筋細胞の成長と分化を調節している[8]。2つ目のバリアントはSH3i+と呼ばれるもので、10番目のスペクトリンリピートに20アミノ酸が挿入されている。プロテインキナーゼAとプロテインキナーゼC(英語版)によるリン酸化部位を含み、スペクトリンのCa2+依存的切断とタンパク質間相互作用を調節する[20]。3つ目は15番目のスペクトリンリピートに5アミノ酸が挿入されており、挿入部位は抗原性の高いエピトープやp53のアンキリン様p53結合タンパク質に対する結合部位と類似している[8][21]。4つ目は21番目のスペクトリンリピートに6アミノ酸が挿入されており、その機能は明らかにされていない[11][22]。
アンジオテンシンIIによって誘導される心臓のリモデリングに応答して、心臓線維芽細胞でαII-スペクトリンの遺伝子発現がアップレギュレーションされることが示されている[23]。
疾患と損傷の動物モデルからは、αII-スペクトリンが多様な機能に関与していることが示唆されている。超低体温循環停止のイヌモデルでは、αII-スペクトリンの分解産物が心臓手術後の神経損傷と関連したマーカーであることが示されている[24]。
臨床的意義
SPTAN1遺伝子の変異は、早期乳児てんかん性脳症(EIEE、発達性てんかん性脳症(DEE)、大田原症候群)5の原因となる[25]。
αII-スペクトリンは、先天性心疾患を抱える乳児で脳の壊死とアポトーシスのバイオマーカーとしての有用性が示されている。αII-スペクトリンの分解産物は、開心術周術期と術後の新生児の血清中に検出される[26]。ギラン・バレー症候群の患者の脳脊髄液では、αII-スペクトリンのタンパク質レベルの上昇が検出される[27]。
相互作用
αII-スペクトリン(SPTAN1)は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
- Abl[28]
- FANCA(英語版)[29][30][31]
- FANCC(英語版)[29][30]
- GRIA2[32]
- プレクチン[33][34]
- SHANK1(英語版)[35]
- ビメンチン[33]
出典
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関連項目