由岐城(ゆきじょう)は、徳島県海部郡美波町にあった日本の城。
築城年代は不明[1]。戦国期には由岐有興がいたことが知られる[2]。
1575年(天正3年)に海部城が土佐国の長宗我部元親に攻め落とされると、まもなく降伏した[2]。1582年(天正10年)に中富川の戦いが行われた際、由岐有興は討死したと言われる[2]。