Катепсин L2 |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
1FH0, 3H6S, 3KFQ |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CTSV, cathepsin V, CATL2, CTSL2, CTSU |
---|
Внешние ID | OMIM: 603308 MGI: 88564 HomoloGene: 76699 GeneCards: CTSV |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
| Хр. | 13-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 13 B3|13 33.26 cM | Начало | 64,507,151 bp[2] |
---|
Конец | 64,518,704 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - skin of arm
- skin of thigh
- secondary oocyte
|
| Наибольшая экспрессия в | - stroma of bone marrow
- epithelium of lens
- decidua
- endothelial cell of lymphatic vessel
- efferent ductule
- cumulus cell
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - cysteine-type peptidase activity
- peptide binding
- peptidase activity
- связывание с белками плазмы
- aminopeptidase activity
- гидролазная активность
- serine-type endopeptidase activity
- cysteine-type endopeptidase activity
- cysteine-type carboxypeptidase activity
- histone binding
- kininogen binding
- protein-containing complex binding
| Компонент клетки | - цитоплазма
- перикарион
- apical part of cell
- secretory granule
- внеклеточная область
- Микроворсинка
- вакуоль
- lysosomal lumen
- neuron projection
- лизосома
- наружная сторона клеточной мембраны
- внеклеточное пространство
- клеточное ядро
- ядрышко
- цитоплазматическая везикула
| Биологический процесс | - развитие яичек
- response to organic cyclic compound
- antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
- cellular response to starvation
- extracellular matrix disassembly
- response to glucocorticoid
- response to glucose
- Sertoli cell differentiation
- response to gonadotropin
- протеолиз
- cell communication
- decidualization
- Сперматогенез
- multicellular organism aging
- proteolysis involved in cellular protein catabolic process
- nerve development
- autophagic cell death
- response to odorant
- regulation of keratinocyte differentiation
- negative regulation of keratinocyte proliferation
- protein processing
- protein autoprocessing
- hair follicle morphogenesis
- regulation of actin cytoskeleton reorganization
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 9: 97.03 – 97.16 Mb | Chr 13: 64.51 – 64.52 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
Катепсин L2 (также катепсин V, иногда именуется катепсин V/L2) - катепсин человека, кодируемый геном CTSL2 на 9-й хромосоме[5]. Впервые описан в 1998 году; индекс L2 говорит о высоком сходстве белка с катепсином L[6]. Экспрессия белка отмечается преимущественно в многослойном эпителии и особенно сильна в эпителии роговицы[7]. Катепсин L2 является цистеиновой протеазой.
Исследования на животных
При искусственно вызванном недостатке катепсина L2 у грызунов отмечаются изменения ряда тканей - тимуса, эпидермиса, фолликулов, развивается дилатационная кардиомиопатия.
Клиническое значение
Повышенная экспрессия катепсина L2, наряду с повышенной экспрессией других катепсинов, может играть роль в патогенезе кератоконуса, в частности, как предполагают авторы исследования, в формировании H2O2, инициации апоптоза клеток, разрушении Боуменовой мембраны[8].
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136943 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021477 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Itoh R., Kawamoto S., Adachi W., Kinoshita S., Okubo K. Genomic organization and chromosomal localization of the human cathepsin L2 gene. (англ.) // DNA Research : An International Journal For Rapid Publication Of Reports On Genes And Genomes. — 1999. — 30 April (vol. 6, no. 2). — P. 137—140. — doi:10.1093/dnares/6.2.137. — PMID 10382972. [исправить]
- ↑ Santamaría I., Velasco G., Cazorla M., Fueyo A., Campo E., López-Otín C. Cathepsin L2, a novel human cysteine proteinase produced by breast and colorectal carcinomas. (англ.) // Cancer Research. — 1998. — 15 April (vol. 58, no. 8). — P. 1624—1630. — PMID 9563472. [исправить]
- ↑ Adachi W., Kawamoto S., Ohno I., Nishida K., Kinoshita S., Matsubara K., Okubo K. Isolation and characterization of human cathepsin V: a major proteinase in corneal epithelium. (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science. — 1998. — September (vol. 39, no. 10). — P. 1789—1796. — PMID 9727401. [исправить]
- ↑ Kenney M. C., Chwa M., Atilano S. R., Tran A., Carballo M., Saghizadeh M., Vasiliou V., Adachi W., Brown D. J. Increased levels of catalase and cathepsin V/L2 but decreased TIMP-1 in keratoconus corneas: evidence that oxidative stress plays a role in this disorder. (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science. — 2005. — March (vol. 46, no. 3). — P. 823—832. — doi:10.1167/iovs.04-0549. — PMID 15728537. [исправить]
|
---|
Кальпаин | - CAPN1
- CAPN2
- CAPN3
- CAPN5
- CAPN6
- CAPN7
- CAPN8
- CAPN9
- CAPN10
- CAPN11
- CAPN12
- CAPN13
- CAPN14
- CAPNS1
- CAPNS2
|
---|
Каспазы | |
---|
Катепсин | - B
- C
- F
- H
- K
- L1
- V/L2
- O
- S
- W
- Z
|
---|
Полученные из растений (плодов) | |
---|
Остальные | |
---|