PROX1

PROX1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2LMD

Идентификаторы
ПсевдонимыPROX1, prospero homeobox 1
Внешние IDOMIM: 601546 MGI: 97772 HomoloGene: 2069 GeneCards: PROX1
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме PROX1
Расположение в геноме PROX1
Локус1q32.3Начало213,983,181 bp[1]
Конец214,041,510 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме PROX1
Расположение в геноме PROX1
Локус1 H6|1 95.85 cMНачало189,850,232 bp[2]
Конец189,902,911 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • sural nerve

  • right lobe of liver

  • buccal mucosa cell

  • Skeletal muscle tissue of biceps brachii

  • body of pancreas
Наибольшая экспрессия в
  • neural layer of retina

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • nucleus reuniens

  • lumbar subsegment of spinal cord
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • ДНК-связывающий
  • sequence-specific DNA binding
  • transcription corepressor activity
  • DNA binding domain binding
  • DNA-binding transcription factor activity
  • LBD domain binding
  • DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
  • core promoter sequence-specific DNA binding
  • связывание с белками плазмы
  • nuclear receptor binding
  • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • клеточное ядро
Биологический процесс
  • dorsal spinal cord development
  • olfactory placode formation
  • ДНК-зависимая регуляция транскрипции
  • positive regulation of endothelial cell proliferation
  • venous blood vessel morphogenesis
  • нефрогенез
  • lymphangiogenesis
  • развитие лёгких
  • развитие зубчатой извилины
  • ритмический процесс
  • ventricular septum morphogenesis
  • cardiac muscle cell differentiation
  • lymphatic endothelial cell differentiation
  • positive regulation of sarcomere organization
  • positive regulation of forebrain neuron differentiation
  • endocardium formation
  • hepatocyte differentiation
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
  • lymph vessel development
  • hepatocyte cell migration
  • транскрипция, ДНК-зависимая
  • lens placode formation involved in camera-type eye formation
  • skeletal muscle thin filament assembly
  • neuronal stem cell population maintenance
  • positive regulation of endothelial cell migration
  • ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции
  • positive regulation of heart growth
  • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis
  • positive regulation of neural precursor cell proliferation
  • retina morphogenesis in camera-type eye
  • multicellular organism development
  • negative regulation of viral genome replication
  • развитие мозга
  • branching involved in pancreas morphogenesis
  • positive regulation of cell cycle
  • lens development in camera-type eye
  • response to nutrient levels
  • hepatocyte proliferation
  • positive regulation of cell cycle checkpoint
  • regulation of circadian rhythm
  • циркадный ритм
  • acinar cell differentiation
  • развитие нервной трубки
  • neuron differentiation
  • позитивная регуляция пролиферации клеток
  • lens morphogenesis in camera-type eye
  • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
  • negative regulation of bile acid biosynthetic process
  • embryonic retina morphogenesis in camera-type eye
  • Регуляция экспрессии генов
  • cell fate determination
  • развитие поджелудочной железы
  • развитие печени
  • atrial cardiac muscle tissue morphogenesis
  • endothelial cell differentiation
  • inner ear development
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • ventricular cardiac myofibril assembly
  • otic placode formation
  • aorta smooth muscle tissue morphogenesis
  • cerebellar granule cell differentiation
  • негативная регуляция пролиферации клеток
  • положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
  • lens fiber cell morphogenesis
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

5629

19130

Ensembl

ENSG00000117707

ENSMUSG00000010175

UniProt

Q92786

P48437

RefSeq (мРНК)

NM_001270616
NM_002763

NM_008937
NM_001360827

RefSeq (белок)

NP_001257545
NP_002754

NP_032963
NP_001347756

Локус (UCSC)Chr 1: 213.98 – 214.04 MbChr 1: 189.85 – 189.9 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

PROX1 (англ. Prospero homeobox protein 1) — белок, являющийся гомеобоксным транскрипционным фактором, который участвует в развитии лимфатической системы и сетчатки глаза[5][6].

Белок PROX1 экспрессируется в поверхностных лимфатических сосудах вместе с рецепторами фактора роста эндотелия VEGF. Направляет в митохондрии фермент CPT1A, который ускоряет окислительную обработку жирных кислот для ускоренного строительства новых лимфатических сосудов. Одновременно CPT1A увеличивает продукцию ацетилкофермента А в зависимости от объёма β-окисления жирных кислот. Ацетилкофермент А с помощью ацилирования модифицирует гистоны в лимфангиогенных генах для возможности cчитывания[7][8].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000117707 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000010175 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Elsir T. et al. Transcription factor PROX1: its role in development and cancer (англ.) // Cancer and metastasis reviews. — 2012. — Vol. 31, no. 3—4. — P. 793—805. — doi:10.1007/s10555-012-9390-8. Архивировано 20 января 2022 года.
  6. Dyer M. A. et al. Prox1 function controls progenitor cell proliferation and horizontal cell genesis in the mammalian retina (англ.) // Nature genetics. — 2003. — Vol. 34, no. 1. — P. 53—58. — doi:10.1038/ng1144. Архивировано 21 января 2022 года.
  7. Tumor Angiogenesis: Basic Mechanisms and Cancer Therapy (англ.) / Dieter Marmé, Norbert Fusenig. — Berlin: Springer, 2007. — ISBN 978-3-540-33176.
  8. Wong B. W. et al. The role of fatty acid β-oxidation in lymphangiogenesis (англ.) // Nature. — 2017. — Vol. 542, no. 7639. — P. 49—54. — doi:10.1038/nature21028. Архивировано 20 октября 2021 года.

Видеоматериалы

  • Логотип YouTube Видеоролик с описанием работы PROX1 при росте лимфатического сосуда.