SLC3A2

SLC3A2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2DH2, 2DH3

Идентификаторы
ПсевдонимыSLC3A2, 4F2, 4F2HC, 4T2HC, CD98, CD98HC, MDU1, NACAE, solute carrier family 3 member 2
Внешние IDOMIM: 158070 MGI: 96955 HomoloGene: 1795 GeneCards: SLC3A2
Расположение гена (человек)
11-я хромосома человека
Хр.11-я хромосома человека[1]
11-я хромосома человека
Расположение в геноме SLC3A2
Расположение в геноме SLC3A2
Локус11q12.3Начало62,856,004 bp[1]
Конец62,888,880 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
19-я хромосома мыши
Хр.19-я хромосома мыши[2]
19-я хромосома мыши
Расположение в геноме SLC3A2
Расположение в геноме SLC3A2
Локус19 A|19 5.44 cMНачало8,684,246 bp[2]
Конец8,700,733 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • ventricular zone

  • stromal cell of endometrium

  • right lobe of thyroid gland

  • left lobe of thyroid gland

  • upper lobe of left lung

  • skin of abdomen

  • skin of leg
Наибольшая экспрессия в
  • epithelium of lens

  • choroid plexus of fourth ventricle

  • stroma of bone marrow

  • neural layer of retina
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • calcium:sodium antiporter activity
  • neutral amino acid transmembrane transporter activity
  • активность катализатора
  • связывание с белками плазмы
  • double-stranded RNA binding
  • RNA binding
  • cadherin binding
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • мембрана
  • меланосома
  • клеточная мембрана
  • поверхность клетки
  • apical plasma membrane
  • экзосома
  • клеточное ядро
  • цитозоль
Биологический процесс
  • response to exogenous dsRNA
  • пролиферация
  • amino acid transport
  • leukocyte migration
  • calcium ion transport
  • tryptophan transport
  • sodium ion transmembrane transport
  • L-alpha-amino acid transmembrane transport
  • перенос
  • Углеводный обмен
  • L-leucine import across plasma membrane
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

6520

17254

Ensembl

ENSG00000168003

ENSMUSG00000010095

UniProt

P08195

P10852

RefSeq (мРНК)
NM_001012661
NM_001012662
NM_001012663
NM_001012664
NM_001013251

NM_002394

NM_001161413
NM_008577

RefSeq (белок)

NP_001012680
NP_001012682
NP_001013269
NP_002385

NP_001154885
NP_032603

Локус (UCSC)Chr 11: 62.86 – 62.89 MbChr 19: 8.68 – 8.7 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

SLC3A2 (solute carrier family 3 member 2) — мембранный белок семейства транспортёров растворённых веществ. Продукт гена человека SLC3A2[5][6]. SLC3A2 является тяжёлой субъединицей «большого транспортёра нейтральных аминокислот» LAT1, или CD98[7][8].

Функции

SLC3A2 — член семейства транспортёров растворённых веществ, трансмембранный белок с альфа-амилазным доменом. Является тяжёлой цепью гетеродимера, ковалентно связанной дисульфидной связью с одним из нескольких возможных белков, составляющих лёгкую цепь комплекса. Белок ассоциирован с интегринами и опосредует интегрин-зависимый сигнальный путь, связанный с ростом клеток и онкогенезом[6]. LAT1 является мембранным белком-переносчиком, переносящий главным образом аминокислоты с разветвлёнными боковыми цепями (лейцин, изолейцин и валин) и ароматические аминокислоты (триптофан, тирозин, фенилаланин)[9]. Особенно высокий уровень экспрессии LAT1 обнаружен в мозге в капиллярах гематоэнцефалического барьера[9].

Активный LAT1 состоит из двух субъединиц, продуктов двух различных генов:

  • Тяжёлая субъединица 4F2hc/CD98, продукт гена SLC3A2[10];
  • Лёгкая субъединица CD98, продукт гена SLC7A5[11].

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168003 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000010095 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Teixeira S, Di Grandi S, Kühn LC (Aug 1987). "Primary structure of the human 4F2 antigen heavy chain predicts a transmembrane protein with a cytoplasmic NH2 terminus". J Biol Chem. 262 (20): 9574—80. doi:10.1016/S0021-9258(18)47972-0. PMID 3036867.
  6. ↑ 1 2 Entrez Gene: SLC3A2 solute carrier family 3 (activators of dibasic and neutral amino acid transport), member 2  (неопр.).
  7. ↑ Kucharzik T, Lugering A, Yan Y, Driss A, Charrier L, Sitaraman S, Merlin D (2005). "Activation of epithelial CD98 glycoprotein perpetuates colonic inflammation". Lab. Invest. 85 (7): 932—41. doi:10.1038/labinvest.3700289. PMID 15880135.
  8. ↑ Lemaître G, Gonnet F, Vaigot P, Gidrol X, Martin MT, Tortajada J, Waksman G (2005). "CD98, a novel marker of transient amplifying human keratinocytes". Proteomics. 5 (14): 3637—45. doi:10.1002/pmic.200401224. PMID 16097038. S2CID 31954787.
  9. ↑ 1 2 Boado RJ, Li JY, Nagaya M, Zhang C, Pardridge WM (1999). "Selective expression of the large neutral amino acid transporter at the blood–brain barrier". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (21): 12079—84. Bibcode:1999PNAS...9612079B. doi:10.1073/pnas.96.21.12079. PMC 18415. PMID 10518579.
  10. ↑ Palacin M, Kanai Y (2004). "The ancillary proteins of HATs: SLC3 family of amino acid transporters". Pflügers Arch. 447 (5): 490—494. doi:10.1007/s00424-003-1062-7. PMID 14770309. S2CID 25808108.
  11. ↑ Verrey F, Closs EI, Wagner CA, Palacin M, Endou H, Kanai Y (2004). "CATs and HATs: the SLC7 family of amino acid transporters" (PDF). Pflügers Arch. 447 (5): 532—542. doi:10.1007/s00424-003-1086-z. PMID 14770310. S2CID 11670040. Архивировано (PDF) 19 января 2022. Дата обращения: 19 января 2022.

Литература

  • Rochelle JM, Watson ML, Oakey RJ, Seldin MF (1992). "A linkage map of mouse chromosome 19: definition of comparative mapping relationships with human chromosomes 10 and 11 including the MEN1 locus". Genomics. 14 (1): 26—31. doi:10.1016/S0888-7543(05)80278-2. PMID 1358795.
  • Michalak M, Quackenbush EJ, Letarte M (1986). "Inhibition of Na+/Ca2+ exchanger activity in cardiac and skeletal muscle sarcolemmal vesicles by monoclonal antibody 44D7". J. Biol. Chem. 261 (1): 92—5. doi:10.1016/S0021-9258(17)42436-7. PMID 2416754.
  • Gottesdiener KM, Karpinski BA, Lindsten T, Strominger JL, Jones NH, Thompson CB, Leiden JM (1989). "Isolation and structural characterization of the human 4F2 heavy-chain gene, an inducible gene involved in T-lymphocyte activation". Mol. Cell. Biol. 8 (9): 3809—19. doi:10.1128/mcb.8.9.3809. PMC 365439. PMID 3265470.
  • Lindsten T, June CH, Thompson CB, Leiden JM (1989). "Regulation of 4F2 heavy-chain gene expression during normal human T-cell activation can be mediated by multiple distinct molecular mechanisms". Mol. Cell. Biol. 8 (9): 3820—6. doi:10.1128/mcb.8.9.3820. PMC 365440. PMID 3265471.
  • Quackenbush E, Clabby M, Gottesdiener KM, Barbosa J, Jones NH, Strominger JL, Speck S, Leiden JM (1987). "Molecular cloning of complementary DNAs encoding the heavy chain of the human 4F2 cell-surface antigen: a type II membrane glycoprotein involved in normal and neoplastic cell growth". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84 (18): 6526—30. Bibcode:1987PNAS...84.6526Q. doi:10.1073/pnas.84.18.6526. PMC 299110. PMID 3476959.
  • Lumadue JA, Glick AB, Ruddle FH (1988). "Cloning, sequence analysis, and expression of the large subunit of the human lymphocyte activation antigen 4F2". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84 (24): 9204—8. doi:10.1073/pnas.84.24.9204. PMC 299721. PMID 3480538.
  • Posillico JT, Srikanta S, Eisenbarth G, Quaranta V, Kajiji S, Brown EM (1987). "Binding of monoclonal antibody (4F2) to its cell surface antigen on dispersed adenomatous parathyroid cells raises cytosolic calcium and inhibits parathyroid hormone secretion". J. Clin. Endocrinol. Metab. 64 (1): 43—50. doi:10.1210/jcem-64-1-43. PMID 3782435.
  • Hemler ME, Strominger JL (1982). "Characterization of antigen recognized by the monoclonal antibody (4F2): different molecular forms on human T and B lymphoblastoid cell lines". J. Immunol. 129 (2): 623—8. PMID 6177771.
  • Peters PG, Kamarck ME, Hemler ME, Strominger JL, Ruddle FH (1983). "Genetic and biochemical characterization of a human surface determinant on somatic cell hybrids: the 4F2 antigen". Somatic Cell Genet. 8 (6): 825—34. doi:10.1007/BF01543022. PMID 6187076. S2CID 19788137.
  • Francke U, Foellmer BE, Haynes BF (1983). "Chromosome mapping of human cell surface molecules: monoclonal anti-human lymphocyte antibodies 4F2, A3D8, and A1G3 define antigens controlled by different regions of chromosome 11". Somatic Cell Genet. 9 (3): 333—44. doi:10.1007/BF01539142. PMID 6190235. S2CID 22972681.
  • Haynes BF, Hemler ME, Mann DL, Eisenbarth GS, Shelhamer J, Mostowski HS, Thomas CA, Strominger JL, Fauci AS (1981). "Characterization of a monoclonal antibody (4F2) that binds to human monocytes and to a subset of activated lymphocytes". J. Immunol. 126 (4): 1409—14. PMID 7204970.
  • Ohgimoto S, Tabata N, Suga S, Nishio M, Ohta H, Tsurudome M, Komada H, Kawano M, Watanabe N, Ito Y (1995). "Molecular characterization of fusion regulatory protein-1 (FRP-1) that induces multinucleated giant cell formation of monocytes and HIV gp160-mediated cell fusion. FRP-1 and 4F2/CD98 are identical molecules". J. Immunol. 155 (7): 3585—92. PMID 7561057.
  • Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1—2): 171—4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
  • Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). "A "double adaptor" method for improved shotgun library construction". Anal. Biochem. 236 (1): 107—13. doi:10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
  • Ohgimoto S, Tabata N, Suga S, Tsurudome M, Kawano M, Nishio M, Okamoto K, Komada H, Watanabe N, Ito Y (1996). "Regulation of human immunodeficiency virus gp160-mediated cell fusion by antibodies against fusion regulatory protein 1". J. Gen. Virol. 77 (11): 2747—56. doi:10.1099/0022-1317-77-11-2747. PMID 8922468.
  • Courseaux A, Grosgeorge J, Gaudray P, Pannett AA, Forbes SA, Williamson C, Bassett D, Thakker RV, Teh BT, Farnebo F, Shepherd J, Skogseid B, Larsson C, Giraud S, Zhang CX, Salandre J, Calender A (1997). "Definition of the minimal MEN1 candidate area based on a 5-Mb integrated map of proximal 11q13. The European Consortium on Men1, (GENEM 1; Groupe d'Etude des Néoplasies Endocriniennes Multiples de type 1)". Genomics. 37 (3): 354—65. doi:10.1006/geno.1996.0570. PMID 8938448.
  • Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Large-Scale Concatenation cDNA Sequencing". Genome Res. 7 (4): 353—8. doi:10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1—2): 149—56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
  • Tabata N, Ido M, Suga S, Ohgimoto S, Tsurudome M, Kawano M, Nishio M, Watanabe N, Okamoto K, Komada H, Sakurai M, Ito Y (1998). "Protein tyrosine kinase activation provides an early and obligatory signal in anti-FRP-1/CD98/4F2 monoclonal antibody induced cell fusion mediated by HIV gp160". Med. Microbiol. Immunol. 186 (2—3): 115—23. doi:10.1007/s004300050053. PMID 9403839. S2CID 7693336.

Ссылки

  • MeSH Large+Neutral+Amino+Acid-Transporter+1
  • MeSH Amino+Acid+Transport+System+L