DNK stega
DNK stega, poznata i kao klizeća stega, je proteinska struktura koja služi kao faktor progresije DNK replikacije. Ona je kritična komponenta DNK polimeraze III. Klamfa se vezuje za DNK polimerazu i sprečava disocijaciju tog enzima sa templata DNK lanca. Protein–protein interakcije između stege i proteaze su jače i specifičnije nego direktne interakcije između polimeraze i templeta, DNK lanca. Jedan od korak koji ogračava brzinu reakcije DNK sinteze je vezivanje polimeraze sa DNK templetom, te prisustvo klizeće stege dramatično povećava broj nukleotida koje polimeraza može da doda u rastući lanac tokom pojedinačnog vezivanja. Prisustvo DNK stege može da povisi brzinu DNK sinteze oko 1.000 puta.[2]
Reference
- ↑ PDB 1W60; Kontopidis G, Wu SY, Zheleva DI, Taylor P, McInnes C, Lane DP, Fischer PM, Walkinshaw MD (February 2005). „Structural and biochemical studies of human proliferating cell nuclear antigen complexes provide a rationale for cyclin association and inhibitor design”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (6): 1871–6. DOI:10.1073/pnas.0406540102. PMC 548533. PMID 15681588.
- ↑ V. Mizrahi, R. N. Henrie, J. F. Marlier, K. A. Johnson, S. J. Benkovic (1985). „Rate-limiting steps in the DNA polymerase I reaction pathway”. Biochemistry 24 (15): 4010–4018. DOI:10.1021/bi00336a031.
Literatura
- Clamping down on pathogenic bacteria[mrtav link] – how to shut down a key DNA polymerase complex. Quips at PDBe
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R (2004). Molecular Biology of the Gene. San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings.
Spoljašnje veze
- SCOP - DNK stega Arhivirano 2011-05-16 na Wayback Machine-u
- MeSH clamp+protein+DnaN,+E+coli
- p
- r
- u
i inicijacija
Prokariotska (inicijacija) | |
---|---|
Eukariotska (priprema u G1 fazi) | |
Oba | Početak replikacije/Ori/Replikon Replikaciona viljuška (zaostajući i vodeći lanci) • Okazakijev fragment • Prajmer |
Prokariotska (elongacija) | DNK polimeraza III holoenzim (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) • Replizom • DNK ligaza • DNK stega • Topoizomeraza (DNK giraza) Prokariotska DNK polimeraza: DNK polimeraza I (Klenov fragment) |
---|---|
Eukariotska (sinteza u S fazi) | Replikacioni faktor C (RFC1, RFC2, RFC3, RFC4, RFC5) • Endonukleaza prepusta (FEN1) • Topoizomeraza • Replikacioni protein A (RPA1) Eukariotska DNK polimeraza: delta (POLD1, POLD2, POLD3, POLD4) DNK stega (PCNA) |
Oba |