LIG1

Ligaza I, DNK, ATP zavisna
PDB prikaz baziran na 1x9n​.
Dostupne strukture
1X9N
Identifikatori
Simboli LIG1; MGC117397; MGC130025
Vanjski ID OMIM: 126391 MGI: 101789 HomoloGene: 197 GeneCards: LIG1 Gene
EC broj 6.5.1.1
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje nukleotida
DNK vezivanje
aktivnost DNK ligaze
aktivnost DNK ligaze (ATP)
ATP vezivanje
aktivnost ligaze
vezivanje metalnih jona
Celularna komponenta nukleus
nukleoplazma
Biološki proces S faza mitotičkog ćelijskog ciklusa
mitotički ćelijski ciklus
održavanje telomera rekombinacijom
održavanje telomera
popravka dvolančanih prekida homolognom rekombinacijom
DNA metabolički proces
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez 3978 16881
Ensembl ENSG00000105486 ENSMUSG00000056394
UniProt P18858 P37913
RefSeq (mRNA) NM_000234.1 NM_001083188.1
RefSeq (protein) NP_000225.1 NP_001076657.1
Lokacija (UCSC) Chr 19:
48.62 - 48.67 Mb
Chr 7:
13.86 - 13.9 Mb
PubMed pretraga [1] [2]

DNK ligaza 1 je enzim koji je kod ljudi kodiran LIG1 genom. On učestvuje u replikaciji DNK i procesu popravke. Mutacije LIG1 koje proizvode deficijenciju DNK ligaze I rezultuju u imunodeficijenciji i povećanoj senzitivnosti na agense koji oštećuju DNK.[1]

Reference

  1. ^ „Entrez Gene: LIG1 ligase I, DNA, ATP-dependent”. 

Literatura

  • Leonhardt H, Cardoso MC (1996). „Targeting and association of proteins with functional domains in the nucleus: the insoluble solution.”. Int. Rev. Cytol. 162B: 303—35. PMID 8557490. doi:10.1016/S0074-7696(08)62620-0. 
  • Tomkinson AE, Mackey ZB (1998). „Structure and function of mammalian DNA ligases.”. Mutat. Res. 407 (1): 1—9. PMID 9539976. 
  • Perrigot M, Pierrot-Deseilligny E, Bussel B, Held JP (1976). „[Paralysis following Dimer X radiculography]”. La Nouvelle presse médicale. 5 (17): 1120—2. PMID 934827. 
  • Webster AD; Barnes DE; Arlett CF; et al. (1992). „Growth retardation and immunodeficiency in a patient with mutations in the DNA ligase I gene.”. Lancet. 339 (8808): 1508—9. PMID 1351188. doi:10.1016/0140-6736(92)91266-B. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Barnes DE; Tomkinson AE; Lehmann AR; et al. (1992). „Mutations in the DNA ligase I gene of an individual with immunodeficiencies and cellular hypersensitivity to DNA-damaging agents.”. Cell. 69 (3): 495—503. PMID 1581963. doi:10.1016/0092-8674(92)90450-Q. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Barnes DE; Kodama K; Tynan K; et al. (1992). „Assignment of the gene encoding DNA ligase I to human chromosome 19q13.2-13.3.”. Genomics. 12 (1): 164—6. PMID 1733856. doi:10.1016/0888-7543(92)90422-O. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Petrini JH, Huwiler KG, Weaver DT (1991). „A wild-type DNA ligase I gene is expressed in Bloom's syndrome cells.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88 (17): 7615—9. PMC 52352 Слободан приступ. PMID 1881902. doi:10.1073/pnas.88.17.7615. 
  • Lasko DD, Tomkinson AE, Lindahl T (1990). „Mammalian DNA ligases. Biosynthesis and intracellular localization of DNA ligase I.”. J. Biol. Chem. 265 (21): 12618—22. PMID 2197279. 
  • Barnes DE; Johnston LH; Kodama K; et al. (1990). „Human DNA ligase I cDNA: cloning and functional expression in Saccharomyces cerevisiae.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (17): 6679—83. PMC 54600 Слободан приступ. PMID 2204063. doi:10.1073/pnas.87.17.6679. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Montecucco A; Savini E; Weighardt F; et al. (1996). „The N-terminal domain of human DNA ligase I contains the nuclear localization signal and directs the enzyme to sites of DNA replication.”. EMBO J. 14 (21): 5379—86. PMC 394647 Слободан приступ. PMID 7489727. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides.”. Gene. 138 (1-2): 171—4. PMID 8125298. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. 
  • Trask B; Fertitta A; Christensen M; et al. (1993). „Fluorescence in situ hybridization mapping of human chromosome 19: cytogenetic band location of 540 cosmids and 70 genes or DNA markers.”. Genomics. 15 (1): 133—45. PMID 8432525. doi:10.1006/geno.1993.1021. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Petrini JH; Walsh ME; DiMare C; et al. (1996). „Isolation and characterization of the human MRE11 homologue.”. Genomics. 29 (1): 80—6. PMID 8530104. doi:10.1006/geno.1995.1217. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Bentley D; Selfridge J; Millar JK; et al. (1996). „DNA ligase I is required for fetal liver erythropoiesis but is not essential for mammalian cell viability.”. Nat. Genet. 13 (4): 489—91. PMID 8696349. doi:10.1038/ng0896-489. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; et al. (1997). „Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library.”. Gene. 200 (1-2): 149—56. PMID 9373149. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Rossi R; Villa A; Negri C; et al. (1999). „The replication factory targeting sequence/PCNA-binding site is required in G(1) to control the phosphorylation status of DNA ligase I.”. EMBO J. 18 (20): 5745—54. PMC 1171641 Слободан приступ. PMID 10523317. doi:10.1093/emboj/18.20.5745. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Matsumoto Y; Kim K; Hurwitz J; et al. (1999). „Reconstitution of proliferating cell nuclear antigen-dependent repair of apurinic/apyrimidinic sites with purified human proteins.”. J. Biol. Chem. 274 (47): 33703—8. PMID 10559261. doi:10.1074/jbc.274.47.33703. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Vispé S, Satoh MS (2000). „DNA repair patch-mediated double strand DNA break formation in human cells.”. J. Biol. Chem. 275 (35): 27386—92. PMID 10827190. doi:10.1074/jbc.M003126200. 
  • Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 

Vidi još

Spoljašnje veze

  • п
  • р
  • у
PDB Galerija
  • 1x9n​: Kristalna struktura ljudske DNK ligaze I vezane za 5'-adenilisanu, oštećenu DNK
    1x9n: Kristalna struktura ljudske DNK ligaze I vezane za 5'-adenilisanu, oštećenu DNK
  • п
  • р
  • у
6.1: Ugljenik-Kiseonik
6.2: Ugljenik-Sumpor
Sukcinil koenzim A sintetaza - Acetil Co-A sintetaza - Dugačka masna acil CoA sintetaza
6.3: Ugljenik-Azot
Glutamin sintetaza - Ubikvitin ligaza (Von Hippel-Lindau tumor supresor, UBE3A, Mdm2, Anafaza-promovišući kompleks) - Glutation sintetaza - CTP sintetaza - Adenilosukcinat sintetaza - Argininosukcinat sintetaza - Sintetaza holokarboksilaze - GMP sintetaza - Asparagin sintetaza - Karbamoil fosfat sintetaza (I, II) - Gama-glutamilcistein sintetaza
6.4: Ugljenik-Ugljenik
Ugljenik-ugljenik ligaze
6.5: Fosforni Estar
6.6: Azot-Metal
  • p
  • r
  • u
Separacija
i inicijacija
Prokariotska
(inicijacija)
Eukariotska
(priprema u
G1 fazi)
Oba
Replikacija
Prokariotska
(elongacija)
Eukariotska
(sinteza u
S fazi)
Oba
Kretanje: Procesivnost · DNK ligaza
Terminacija
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) · tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) · tltn (risu, pttl, nexn) · dnab, rnab/runp · stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)