ACAP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3JUE, 3T9K, 4CKG, 4CKH, 4F1P, 4NSW

Ідентифікатори

Символи

ACAP1, CENTB1, ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607763 MGI: 2388270 HomoloGene: 22835 GeneCards: ACAP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• ендосома • recycling endosome membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9744


216859

Ensembl


ENSG00000072818 ENSG00000288169


ENSMUSG00000001588

UniProt


Q15027


Q8K2H4

RefSeq (мРНК)


NM_014716


NM_153788

RefSeq (білок)


NP_055531


NP_722483

Локус (UCSC)

Хр. 17: 7.34 – 7.35 Mb

Хр. 11: 69.77 – 69.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ACAP1 (англ. ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 81 536^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVKLDFEEC	LKDSPRFRAS	IELVEAEVSE	LETRLEKLLK	LGTGLLESGR
HYLAASRAFV	VGICDLARLG	PPEPMMAECL	EKFTVSLNHK	LDSHAELLDA
TQHTLQQQIQ	TLVKEGLRGF	REARRDFWRG	AESLEAALTH	NAEVPRRRAQ
EAEEAGAALR	TARAGYRGRA	LDYALQINVI	EDKRKFDIME	FVLRLVEAQA
THFQQGHEEL	SRLSQYRKEL	GAQLHQLVLN	SAREKRDMEQ	RHVLLKQKEL
GGEEPEPSLR	EGPGGLVMEG	HLFKRASNAF	KTWSRRWFTI	QSNQLVYQKK
YKDPVTVVVD	DLRLCTVKLC	PDSERRFCFE	VVSTSKSCLL	QADSERLLQL
WVSAVQSSIA	SAFSQARLDD	SPRGPGQGSG	HLAIGSAATL	GSGGMARGRE
PGGVGHVVAQ	VQSVDGNAQC	CDCREPAPEW	ASINLGVTLC	IQCSGIHRSL
GVHFSKVRSL	TLDSWEPELV	KLMCELGNVI	INQIYEARVE	AMAVKKPGPS
CSRQEKEAWI	HAKYVEKKFL	TKLPEIRGRR	GGRGRPRGQP	PVPPKPSIRP
RPGSLRSKPE	PPSEDLGSLH	PGALLFRASG	HPPSLPTMAD	ALAHGADVNW
VNGGQDNATP	LIQATAANSL	LACEFLLQNG	ANVNQADSAG	RGPLHHATIL
GHTGLACLFL	KRGADLGARD	SEGRDPLTIA	METANADIVT	LLRLAKMREA
EAAQGQAGDE	TYLDIFRDFS	LMASDDPEKL	SRRSHDLHTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhan X., Desiderio D.M. (2006). Nitroproteins from a human pituitary adenoma tissue discovered with a nitrotyrosine affinity column and tandem mass spectrometry. Anal. Biochem. 354: 279—289. PMID 16777052 DOI:10.1016/j.ab.2006.05.024
Shinozaki-Narikawa N., Kodama T., Shibasaki Y. (2006). Cooperation of phosphoinositides and BAR domain proteins in endosomal tubulation. Traffic. 7: 1539—1550. PMID 17010122 DOI:10.1111/j.1600-0854.2006.00480.x
Ma Z., Nie Z., Luo R., Casanova J.E., Ravichandran K.S. (2007). Regulation of Arf6 and ACAP1 signaling by the PTB-domain-containing adaptor protein GULP. Curr. Biol. 17: 722—727. PMID 17398097 DOI:10.1016/j.cub.2007.03.014

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16467 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15027 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.