AFAP1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | AFAP1, AFAP, AFAP-110, AFAP110, actin filament associated protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608252 MGI: 1917542 HomoloGene: 11009 GeneCards: AFAP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin binding • SH3 domain binding • SH2 domain binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • цитоскелет • focal adhesion • гіалоплазма • actin cytoskeleton |
---|
Біологічний процес | • regulation of signal transduction • regulation of cytoskeleton organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001134647 NM_021638 NM_198595 NM_001371090 NM_001371091 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001128119 NP_940997 NP_001358019 NP_001358020 |
| | NP_081649 NP_001390348 NP_001390349 NP_001390350 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 7.76 – 7.94 Mb | Хр. 5: 36.05 – 36.16 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
AFAP1 (англ. Actin filament associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 730 амінокислот, а молекулярна маса — 80 725[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEELIVELRL | | FLELLDHEYL | | TSTVREKKAV | | ITNILLRIQS | | SKGFDVKDHA |
QKQETANSLP | | APPQMPLPEI | | PQPWLPPDSG | | PPPLPTSSLP | | EGYYEEAVPL |
SPGKAPEYIT | | SNYDSDAMSS | | SYESYDEEEE | | DGKGKKTRHQ | | WPSEEASMDL |
VKDAKICAFL | | LRKKRFGQWT | | KLLCVIKDTK | | LLCYKSSKDQ | | QPQMELPLQG |
CNITYIPKDS | | KKKKHELKIT | | QQGTDPLVLA | | VQSKEQAEQW | | LKVIKEAYSG |
CSGPVDSECP | | PPPSSPVHKA | | ELEKKLSSER | | PSSDGEGVVE | | NGITTCNGKE |
QVKRKKSSKS | | EAKGTVSKVT | | GKKITKIISL | | GKKKPSTDEQ | | TSSAEEDVPT |
CGYLNVLSNS | | RWRERWCRVK | | DNKLIFHKDR | | TDLKTHIVSI | | PLRGCEVIPG |
LDSKHPLTFR | | LLRNGQEVAV | | LEASSSEDMG | | RWIGILLAET | | GSSTDPEALH |
YDYIDVEMSA | | SVIQTAKQTF | | CFMNRRVISA | | NPYLGGTSNG | | YAHPSGTALH |
YDDVPCINGS | | LKGKKPPVAS | | NGVTGKGKTL | | SSQPKKADPA | | AVVKRTGSNA |
AQYKYGKNRV | | EADAKRLQTK | | EEELLKRKEA | | LRNRLAQLRK | | ERKDLRAAIE |
VNAGRKPQAI | | LEEKLKQLEE | | ECRQKEAERV | | SLELELTEVK | | ESLKKALAGG |
VTLGLAIEPK | | SGTSSPQSPV | | FRHRTLENSP | | ISSCDTSDTE | | GPVPVNSAAV |
LKKSQAAPGS | | SPCRGHVLRK | | AKEWELKNGT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dorfleutner A., Stehlik C., Zhang J., Gallick G.E., Flynn D.C. (2007). AFAP-110 is required for actin stress fiber formation and cell adhesion in MDA-MB-231 breast cancer cells. J. Cell. Physiol. 213: 740—749. PMID 17520695 DOI:10.1002/jcp.21143
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24017 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8N556 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |