AGAP3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3IHW

Ідентифікатори

Символи

AGAP3, AGAP-3, CENTG3, CRAG, MRIP-1, cnt-g3, ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3

Зовнішні ІД

OMIM: 616813 MGI: 2183446 HomoloGene: 23742 GeneCards: AGAP3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity • polyubiquitin modification-dependent protein binding
Клітинна компонента	• мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • cell periphery
Біологічний процес	• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


116988


213990

Ensembl


ENSG00000133612


ENSMUSG00000023353

UniProt


Q96P47 Q86ST5


Q8VHH5

RefSeq (мРНК)

NM_001042535 NM_001281300 NM_001308304 NM_001308305 NM_031946
NM_001350102 NM_001350103 NM_001350104


NM_001256431 NM_139153 NM_001359881

RefSeq (білок)

NP_001036000 NP_001268229 NP_001295233 NP_001295234 NP_114152
NP_001337031 NP_001337032 NP_001337033 NP_001036000.1 NP_001295233.1 NP_001295234.1


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 7: 151.09 – 151.14 Mb

Хр. 5: 24.66 – 24.71 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AGAP3 (англ. ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 875 амінокислот, а молекулярна маса — 95 044^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNFQAGGGQS	PQQQQQLAGG	PPQQFALSNS	AAIRAEIQRF	ESVHPNIYAI
YDLIERIEDL	ALQNQIREHV	ISIEDSFVNS	QEWTLSRSVP	ELKVGIVGNL
SSGKSALVHR	YLTGTYVQEE	SPEGGRFKKE	IVVDGQSYLL	LIRDEGGPPE
LQFAAWVDAV	VFVFSLEDEI	SFQTVYNYFL	RLCSFRNASE	VPMVLVGTQD
AISAANPRVI	DDSRARKLST	DLKRCTYYET	CATYGLNVER	VFQDVAQKVV
ALRKKQQLAI	GPCKSLPNSP	SHSAVSAASI	PAVHINQATN	GGGSAFSDYS
SSVPSTPSIS	QRELRIETIA	ASSTPTPIRK	QSKRRSNIFT	SRKGADLDRE
KKAAECKVDS	IGSGRAIPIK	QGILLKRSGK	SLNKEWKKKY	VTLCDNGLLT
YHPSLHDYMQ	NIHGKEIDLL	RTTVKVPGKR	LPRATPATAP	GTSPRANGLS
VERSNTQLGG	GTGAPHSASS	ASLHSERPLS	SSAWAGPRPE	GLHQRSCSVS
SADQWSEATT	SLPPGMQHPA	SGPAEVLSSS	PKLDPPPSPH	SNRKKHRRKK
STGTPRPDGP	SSATEEAEES	FEFVVVSLTG	QTWHFEASTA	EERELWVQSV
QAQILASLQG	CRSAKDKTRL	GNQNAALAVQ	AVRTVRGNSF	CIDCDAPNPD
WASLNLGALM	CIECSGIHRH	LGAHLSRVRS	LDLDDWPPEL	LAVMTAMGNA
LANSVWEGAL	GGYSKPGPDA	CREEKERWIR	AKYEQKLFLA	PLPSSDVPLG
QQLLRAVVED	DLRLLVMLLA	HGSKEEVNET	YGDGDGRTAL	HLSSAMANVV
FTQLLIWYGV	DVRSRDARGL	TPLAYARRAG	SQECADILIQ	HGCPGEGCGL
APTPNREPAN	GTNPSAELHR	SPSLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Meurer S., Pioch S., Wagner K., Mueller-Esterl W., Gross S. (2004). AGAP1, a novel binding partner of nitric oxide-sensitive guanylyl cyclase. J. Biol. Chem. 279: 49346—49354. PMID 15381706 DOI:10.1074/jbc.M410565200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16923 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96P47 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.