AIM2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3RN2, 3RN5, 3VD8, 4O7Q | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | AIM2, PYHIN4, absent in melanoma 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604578 MGI: 2686159 HomoloGene: 83226 GeneCards: AIM2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • double-stranded DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • AIM2 inflammasome complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • мітохондрія • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity • Піроптоз • cellular response to interferon-beta • процес імунної системи • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of interleukin-1 beta production • positive regulation of protein oligomerization • activation of innate immune response • inflammatory response • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of defense response to virus by host • GO:0097285 апоптоз • вроджений імунітет |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 159.06 – 159.19 Mb | Хр. 1: 173.35 – 173.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
AIM2 (англ. Absent in melanoma 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот, а молекулярна маса — 38 954[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESKYKEILL | | LTGLDNITDE | | ELDRFKFFLS | | DEFNIATGKL | | HTANRIQVAT |
LMIQNAGAVS | | AVMKTIRIFQ | | KLNYMLLAKR | | LQEEKEKVDK | | QYKSVTKPKP |
LSQAEMSPAA | | SAAIRNDVAK | | QRAAPKVSPH | | VKPEQKQMVA | | QQESIREGFQ |
KRCLPVMVLK | | AKKPFTFETQ | | EGKQEMFHAT | | VATEKEFFFV | | KVFNTLLKDK |
FIPKRIIIIA | | RYYRHSGFLE | | VNSASRVLDA | | ESDQKVNVPL | | NIIRKAGETP |
KINTLQTQPL | | GTIVNGLFVV | | QKVTEKKKNI | | LFDLSDNTGK | | MEVLGVRNED |
TMKCKEGDKV | | RLTFFTLSKN | | GEKLQLTSGV | | HSTIKVIKAK | | KKT |
Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fernandes-Alnemri T., Yu J.W., Datta P., Wu J., Alnemri E.S. (2009). AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA. Nature. 458: 509—513. PMID 19158676 DOI:10.1038/nature07710
- Veeranki S., Duan X., Panchanathan R., Liu H., Choubey D. (2011). IFI16 protein mediates the anti-inflammatory actions of the type-I interferons through suppression of activation of caspase-1 by inflammasomes. PLoS ONE. 6: E27040—E27040. PMID 22046441 DOI:10.1371/journal.pone.0027040
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:357 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O14862 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |