APOBEC3D |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | APOBEC3D, A3D, APOBEC3DE, APOBEC3E, ARP6, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D, A3DE |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609900 HomoloGene: 122788 GeneCards: APOBEC3D |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • zinc ion binding • каталітична активність • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding • cytidine deaminase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • P-body • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of transposition • вроджений імунітет • defense response to virus • DNA cytosine deamination • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate • процес імунної системи • cytidine deamination • cytidine to uridine editing • DNA demethylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 39.02 – 39.03 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | н/д |
---|
Вікідані |
|
APOBEC3D (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 46 598[3].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNPQIRNPME | | RMYRDTFYDN | | FENEPILYGR | | SYTWLCYEVK | | IKRGRSNLLW |
DTGVFRGPVL | | PKRQSNHRQE | | VYFRFENHAE | | MCFLSWFCGN | | RLPANRRFQI |
TWFVSWNPCL | | PCVVKVTKFL | | AEHPNVTLTI | | SAARLYYYRD | | RDWRWVLLRL |
HKAGARVKIM | | DYEDFAYCWE | | NFVCNEGQPF | | MPWYKFDDNY | | ASLHRTLKEI |
LRNPMEAMYP | | HIFYFHFKNL | | LKACGRNESW | | LCFTMEVTKH | | HSAVFRKRGV |
FRNQVDPETH | | CHAERCFLSW | | FCDDILSPNT | | NYEVTWYTSW | | SPCPECAGEV |
AEFLARHSNV | | NLTIFTARLC | | YFWDTDYQEG | | LCSLSQEGAS | | VKIMGYKDFV |
SCWKNFVYSD | | DEPFKPWKGL | | QTNFRLLKRR | | LREILQ |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
- Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
- Stenglein M.D., Burns M.B., Li M., Lengyel J., Harris R.S. (2010). APOBEC3 proteins mediate the clearance of foreign DNA from human cells. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 222—229. PMID 20062055 DOI:10.1038/nsmb.1744
- Arias J.F., Koyama T., Kinomoto M., Tokunaga K. (2012). Retroelements versus APOBEC3 family members: No great escape from the magnificent seven. Front. Microbiol. 3: 275—275. PMID 22912627 DOI:10.3389/fmicb.2012.00275
- Phalora P.K., Sherer N.M., Wolinsky S.M., Swanson C.M., Malim M.H. (2012). HIV-1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies. J. Virol. 86: 11712—11724. PMID 22915799 DOI:10.1128/JVI.00595-12
- Refsland E.W., Hultquist J.F., Harris R.S. (2012). Endogenous origins of HIV-1 G-to-A hypermutation and restriction in the nonpermissive T cell line CEM2n. PLoS Pathog. 8: E1002800—E1002800. PMID 22807680 DOI:10.1371/journal.ppat.1002800
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17354 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96AK3 (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |