ARHGEF2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ARHGEF2, GEF, GEF-H1, GEFH1, LFP40, P40, Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 2, NEDMHM, Lfc |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607560 MGI: 103264 HomoloGene: 3468 GeneCards: ARHGEF2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
бічний аміотрофічний склероз[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule binding • zinc ion binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • везикула • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • focal adhesion • bicellular tight junction • веретено поділу • клітинна мембрана • dendritic shaft • ruffle membrane • міжклітинні контакти • neuronal cell body • мікротрубочка • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • podosome • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • GO:0009327 protein-containing complex • glutamatergic synapse • postsynaptic density, intracellular component |
---|
Біологічний процес | • GO:0007243 intracellular signal transduction • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to osmotic stress • negative regulation of necroptotic process • actin filament organization • процес імунної системи • negative regulation of neurogenesis • cellular response to tumor necrosis factor • поділ клітини • cellular response to muramyl dipeptide • cellular hyperosmotic response • negative regulation of microtubule depolymerization • regulation of cell population proliferation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:0000767 cell morphogenesis • establishment of mitotic spindle orientation • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • клітинний цикл • regulation of Rho protein signal transduction • intracellular protein transport • вроджений імунітет • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of podosome assembly • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of neuron differentiation • asymmetric neuroblast division • positive regulation of neuron migration • multicellular organism development • нейробіологія розвитку • диференціація клітин |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001162383 NM_001162384 NM_004723 NM_001350110 NM_001350111
| NM_001350112 |
| | NM_001198911 NM_001198912 NM_001198913 NM_008487 NM_001377126 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001155855 NP_001155856 NP_004714 NP_001337039 NP_001337040
| NP_001337041 |
| | NP_001185840 NP_001185841 NP_001185842 NP_032513 NP_001364055 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 155.95 – 156.01 Mb | Хр. 3: 88.51 – 88.56 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARHGEF2 (англ. Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 986 амінокислот, а молекулярна маса — 111 543[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSRIESLTRA | | RIDRSRELAS | | KTREKEKMKE | | AKDARYTNGH | | LFTTISVSGM |
TMCYACNKSI | | TAKEALICPT | | CNVTIHNRCK | | DTLANCTKVK | | QKQQKAALLK |
NNTALQSVSL | | RSKTTIRERP | | SSAIYPSDSF | | RQSLLGSRRG | | RSSLSLAKSV |
STTNIAGHFN | | DESPLGLRRI | | LSQSTDSLNM | | RNRTLSVESL | | IDEAEVIYSE |
LMSDFEMDEK | | DFAADSWSLA | | VDSSFLQQHK | | KEVMKQQDVI | | YELIQTELHH |
VRTLKIMTRL | | FRTGMLEELH | | LEPGVVQGLF | | PCVDELSDIH | | TRFLSQLLER |
RRQALCPGST | | RNFVIHRLGD | | LLISQFSGPS | | AEQMCKTYSE | | FCSRHSKALK |
LYKELYARDK | | RFQQFIRKVT | | RPAVLKRHGV | | QECILLVTQR | | ITKYPLLISR |
ILQHSHGIEE | | ERQDLTTALG | | LVKELLSNVD | | EGIYQLEKGA | | RLQEIYNRMD |
PRAQTPVPGK | | GPFGREELLR | | RKLIHDGCLL | | WKTATGRFKD | | VLVLLMTDVL |
VFLQEKDQKY | | IFPTLDKPSV | | VSLQNLIVRD | | IANQEKGMFL | | ISAAPPEMYE |
VHTASRDDRS | | TWIRVIQQSV | | RTCPSREDFP | | LIETEDEAYL | | RRIKMELQQK |
DRALVELLRE | | KVGLFAEMTH | | FQAEEDGGSG | | MALPTLPRGL | | FRSESLESPR |
GERLLQDAIR | | EVEGLKDLLV | | GPGVELLLTP | | REPALPLEPD | | SGGNTSPGVT |
ANGEARTFNG | | SIELCRADSD | | SSQRDRNGNQ | | LRSPQEEALQ | | RLVNLYGLLH |
GLQAAVAQQD | | TLMEARFPEG | | PERREKLCRA | | NSRDGEAGRA | | GAAPVAPEKQ |
ATELALLQRQ | | HALLQEELRR | | CRRLGEERAT | | EAGSLEARLR | | ESEQARALLE |
REAEEARRQL | | AALGQTEPLP | | AEAPWARRPV | | DPRRRSLPAG | | DALYLSFNPP |
QPSRGTDRLD | | LPVTTRSVHR | | NFEDRERQEL | | GSPEERLQDS | | SDPDTGSEEE |
GSSRLSPPHS | | PRDFTRMQDI | | PEETESRDGE | | AVASES |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, щільних контактах.
Література
- Ren Y., Li R., Zheng Y., Busch H. (1998). Cloning and characterization of GEF-H1, a microtubule-associated guanine nucleotide exchange factor for Rac and Rho GTPases. J. Biol. Chem. 273: 34954—34960. PMID 9857026 DOI:10.1074/jbc.273.52.34954
- Krendel M., Zenke F.T., Bokoch G.M. (2002). Nucleotide exchange factor GEF-H1 mediates cross-talk between microtubules and the actin cytoskeleton. Nat. Cell Biol. 4: 294—301. PMID 11912491 DOI:10.1038/ncb773
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Callow M.G., Zozulya S., Gishizky M.L., Jallal B., Smeal T. (2005). PAK4 mediates morphological changes through the regulation of GEF-H1. J. Cell Sci. 118: 1861—1872. PMID 15827085 DOI:10.1242/jcs.02313
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Birkenfeld J., Nalbant P., Yoon S.-H., Bokoch G.M. (2008). Cellular functions of GEF-H1, a microtubule-regulated Rho-GEF: is altered GEF-H1 activity a crucial determinant of disease pathogenesis?. Trends Cell Biol. 18: 210—219. PMID 18394899 DOI:10.1016/j.tcb.2008.02.006
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARHGEF2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:682 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q92974 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |