BCAN

Ідентифікатори

Символи

BCAN, BEHAB, CSPG7, Brevican

Зовнішні ІД

OMIM: 600347 MGI: 1096385 HomoloGene: 7244 GeneCards: BCAN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• hyaluronic acid binding • carbohydrate binding • extracellular matrix structural constituent
Клітинна компонента	• мембрана • extracellular region • lysosomal lumen • Golgi lumen • anchored component of membrane • GO:0005578 Позаклітинна матриця • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• skeletal system development • chondroitin sulfate biosynthetic process • extracellular matrix organization • central nervous system development • chondroitin sulfate catabolic process • dermatan sulfate biosynthetic process • hippocampus development • адгезія клітин • synapse maturation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


63827


12032

Ensembl


ENSG00000132692


ENSMUSG00000004892

UniProt


Q96GW7


Q61361

RefSeq (мРНК)


NM_021948 NM_198427


NM_001109758 NM_007529

RefSeq (білок)


NP_068767 NP_940819


NP_001103228 NP_031555

Локус (UCSC)

Хр. 1: 156.64 – 156.66 Mb

Хр. 3: 87.99 – 88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BCAN (англ. Brevican) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 911 амінокислот, а молекулярна маса — 99 118^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQLFLPLLA	ALVLAQAPAA	LADVLEGDSS	EDRAFRVRIA	GDAPLQGVLG
GALTIPCHVH	YLRPPPSRRA	VLGSPRVKWT	FLSRGREAEV	LVARGVRVKV
NEAYRFRVAL	PAYPASLTDV	SLALSELRPN	DSGIYRCEVQ	HGIDDSSDAV
EVKVKGVVFL	YREGSARYAF	SFSGAQEACA	RIGAHIATPE	QLYAAYLGGY
EQCDAGWLSD	QTVRYPIQTP	REACYGDMDG	FPGVRNYGVV	DPDDLYDVYC
YAEDLNGELF	LGDPPEKLTL	EEARAYCQER	GAEIATTGQL	YAAWDGGLDH
CSPGWLADGS	VRYPIVTPSQ	RCGGGLPGVK	TLFLFPNQTG	FPNKHSRFNV
YCFRDSAQPS	AIPEASNPAS	NPASDGLEAI	VTVTETLEEL	QLPQEATESE
SRGAIYSIPI	MEDGGGGSST	PEDPAEAPRT	LLEFETQSMV	PPTGFSEEEG
KALEEEEKYE	DEEEKEEEEE	EEEVEDEALW	AWPSELSSPG	PEASLPTEPA
AQEESLSQAP	ARAVLQPGAS	PLPDGESEAS	RPPRVHGPPT	ETLPTPRERN
LASPSPSTLV	EAREVGEATG	GPELSGVPRG	ESEETGSSEG	APSLLPATRA
PEGTRELEAP	SEDNSGRTAP	AGTSVQAQPV	LPTDSASRGG	VAVVPASGDC
VPSPCHNGGT	CLEEEEGVRC	LCLPGYGGDL	CDVGLRFCNP	GWDAFQGACY
KHFSTRRSWE	EAETQCRMYG	AHLASISTPE	EQDFINNRYR	EYQWIGLNDR
TIEGDFLWSD	GVPLLYENWN	PGQPDSYFLS	GENCVVMVWH	DQGQWSDVPC
NYHLSYTCKM	GLVSCGPPPE	LPLAQVFGRP	RLRYEVDTVL	RYRCREGLAQ
RNLPLIRCQE	NGRWEAPQIS	CVPRRPARAL	HPEEDPEGRQ	GRLLGRWKAL
LIPPSSPMPG	P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23059 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96GW7 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.