C16orf62 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS35L, chromosome 16 open reading frame 62, VPS35 endosomal protein sorting factor like, C16orf62, EC97, RTSC3 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1918767 HomoloGene: 10659 GeneCards: VPS35L |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • ендосома • early endosome • мембрана • клітинна мембрана • ficolin-1-rich granule membrane |
---|
Біологічний процес | • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • neutrophil degranulation • endocytic recycling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001300743 NM_020314 NM_001365293 NM_001365294 NM_001365295 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001287672 NP_064710 NP_001352222 NP_001352223 NP_001352224 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 19.56 – 19.71 Mb | Хр. 7: 118.34 – 118.44 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
C16orf62 (англ. Chromosome 16 open reading frame 62) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 109 563[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAVFPWHSRN | | RNYKAEFASC | | RLEAVPLEFG | | DYHPLKPITV | | TESKTKKVNR |
KGSTSSTSSS | | SSSSVVDPLS | | SVLDGTDPLS | | MFAATADPAA | | LAAAMDSSRR |
KRDRDDNSVV | | GSDFEPWTNK | | RGEILARYTT | | TEKLSINLFM | | GSEKGKAGTA |
TLAMSEKVRT | | RLEELDDFEE | | GSQKELLNLT | | QQDYVNRIEE | | LNQSLKDAWA |
SDQKVKALKI | | VIQCSKLLSD | | TSVIQFYPSK | | FVLITDILDT | | FGKLVYERIF |
SMCVDSRSVL | | PDHFSPENAN | | DTAKETCLNW | | FFKIASIREL | | IPRFYVEASI |
LKCNKFLSKT | | GISECLPRLT | | CMIRGIGDPL | | VSVYARAYLC | | RVGMEVAPHL |
KETLNKNFFD | | FLLTFKQIHG | | DTVQNQLVVQ | | GVELPSYLPL | | YPPAMDWIFQ |
CISYHAPEAL | | LTEMMERCKK | | LGNNALLLNS | | VMSAFRAEFI | | ATRSMDFIGM |
IKECDESGFP | | KHLLFRSLGL | | NLALADPPES | | DRLQILNEAW | | KVITKLKNPQ |
DYINCAEVWV | | EYTCKHFTKR | | EVNTVLADVI | | KHMTPDRAFE | | DSYPQLQLII |
KKVIAHFHDF | | SVLFSVEKFL | | PFLDMFQKES | | VRVEVCKCIM | | DAFIKHQQEP |
TKDPVILNAL | | LHVCKTMHDS | | VNALTLEDEK | | RMLSYLINGF | | IKMVSFGRDF |
EQQLSFYVES | | RSMFCNLEPV | | LVQLIHSVNR | | LAMETRKVMK | | GNHSRKTAAF |
VRACVAYCFI | | TIPSLAGIFT | | RLNLYLHSGQ | | VALANQCLSQ | | ADAFFKAAIS |
LVPEVPKMIN | | IDGKMRPSES | | FLLEFLCNFF | | STLLIVPDHP | | EHGVLFLVRE |
LLNVIQDYTW | | EDNSDEKIRI | | YTCVLHLLSA | | MSQETYLYHI | | DKVDSNDSLY |
GGDSKFLAEN | | NKLCETVMAQ | | ILEHLKTLAK | | DEALKRQSSL | | GLSFFNSILA |
HGDLRNNKLN | | QLSVNLWHLA | | QRHGCADTRT | | MVKTLEYIKK | | QSKQPDMTHL |
TELALRLPLQ | | TRT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24641 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q7Z3J2 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |