CCAR2

CCAR2
Ідентифікатори
Символи CCAR2, DBC-1, DBC1, KIAA1967, NET35, p30 DBC, p30DBC, cell cycle and apoptosis regulator 2
Зовнішні ІД OMIM: 607359 MGI: 2444228 HomoloGene: 10910 GeneCards: CCAR2
Онтологія гена
Молекулярна функція

RNA polymerase II complex binding
GO:0048551 enzyme inhibitor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
enzyme binding
RNA binding
nuclear receptor coactivator activity

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
DBIRD complex
мітохондріальний матрикс
spliceosomal complex
клітинне ядро

Біологічний процес

mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process
GO:0048553 negative regulation of catalytic activity
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
regulation of protein stability
positive regulation of DNA damage checkpoint
ритмічний процес
positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
mRNA processing
regulation of DNA-templated transcription, elongation
regulation of protein deacetylation
negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
Wnt signaling pathway
transcription, DNA-templated
cellular response to DNA damage stimulus
regulation of circadian rhythm
negative regulation of cell growth
Сплайсинг РНК
negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
positive regulation of apoptotic process
regulation of cellular response to heat
клітинний цикл
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
response to UV
GO:0097285 апоптоз
positive regulation of nucleic acid-templated transcription

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
57805
219158
Ensembl
ENSG00000158941
ENSMUSG00000033712
UniProt
Q8N163
Q8VDP4
RefSeq (мРНК)
NM_021174
NM_199205
NM_001363068
NM_001363069
NM_001393997
NM_146055
RefSeq (білок)
NP_066997
NP_001349997
NP_001349998
NP_666167
Локус (UCSC) Хр. 8: 22.6 – 22.62 Mb Хр. 14: 70.38 – 70.39 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CCAR2 (англ. Cell cycle and apoptosis regulator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 923 амінокислот, а молекулярна маса — 102 902[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSQFKRQRINPLPGGRNFSGTASTSLLGPPPGLLTPPVATELSQNARHLQ
GGEKQRVFTGIVTSLHDYFGVVDEEVFFQLSVVKGRLPQLGEKVLVKAAY
NPGQAVPWNAVKVQTLSNQPLLKSPAPPLLHVAALGQKQGILGAQPQLIF
QPHRIPPLFPQKPLSLFQTSHTLHLSHLNRFPARGPHGRLDQGRSDDYDS
KKRKQRAGGEPWGAKKPRHDLPPYRVHLTPYTVDSPICDFLELQRRYRSL
LVPSDFLSVHLSWLSAFPLSQPFSLHHPSRIQVSSEKEAAPDAGAEPITA
DSDPAYSSKVLLLSSPGLEELYRCCMLFVDDMAEPRETPEHPLKQIKFLL
GRKEEEAVLVGGEWSPSLDGLDPQADPQVLVRTAIRCAQAQTGIDLSGCT
KWWRFAEFQYLQPGPPRRLQTVVVYLPDVWTIMPTLEEWEALCQQKAAEA
APPTQEAQGETEPTEQAPDALEQAADTSRRNAETPEATTQQETDTDLPEA
PPPPLEPAVIARPGCVNLSLHGIVEDRRPKERISFEVMVLAELFLEMLQR
DFGYRVYKMLLSLPEKVVSPPEPEKEEAAKEEATKEEEAIKEEVVKEPKD
EAQNEGPATESEAPLKEDGLLPKPLSSGGEEEEKPRGEASEDLCEMALDP
ELLLLRDDGEEEFAGAKLEDSEVRSVASNQSEMEFSSLQDMPKELDPSAV
LPLDCLLAFVFFDANWCGYLHRRDLERILLTLGIRLSAEQAKQLVSRVVT
QNICQYRSLQYSRQEGLDGGLPEEVLFGNLDLLPPPGKSTKPGAAPTEHK
ALVSHNGSLINVGSLLQRAEQQDSGRLYLENKIHTLELKLEESHNRFSAT
EVTNKTLAAEMQELRVRLAEAEETARTAERQKSQLQRLLQELRRRLTPLQ
LEIQRVVEKADSWVEKEEPAPSN

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, інгібіторів металоферментів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, пошкодження ДНК, біологічні ритми, сигнальний шлях Wnt. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
  • Kim J.-E., Chen J., Lou Z. (2008). DBC1 is a negative regulator of SIRT1. Nature. 451: 583—586. PMID 18235501 DOI:10.1038/nature06500
  • Chini C.C., Escande C., Nin V., Chini E.N. (2010). HDAC3 is negatively regulated by the nuclear protein DBC1. J. Biol. Chem. 285: 40830—40837. PMID 21030595 DOI:10.1074/jbc.M110.153270
  • Zannini L., Buscemi G., Kim J.E., Fontanella E., Delia D. (2012). DBC1 phosphorylation by ATM/ATR inhibits SIRT1 deacetylase in response to DNA damage. J. Mol. Cell Biol. 4: 294—303. PMID 22735644 DOI:10.1093/jmcb/mjs035
  • Chini C.C., Escande C., Nin V., Chini E.N. (2013). DBC1 (Deleted in Breast Cancer 1) modulates the stability and function of the nuclear receptor Rev-erbalpha. Biochem. J. 451: 453—461. PMID 23398316 DOI:10.1042/BJ20121085

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23360 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q8N163 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»