CCL20 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2JYO, 1M8A, 2HCI | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CCL20, CKb4, Exodus, LARC, MIP-3-alpha, MIP-3a, MIP3A, SCYA20, ST38, chemokine (C-C motif) ligand 20, C-C motif chemokine ligand 20 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601960 MGI: 1329031 HomoloGene: 3375 GeneCards: CCL20 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cytokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CCR6 chemokine receptor binding • chemokine activity • CCR chemokine receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • внутрішньоклітинний • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • monocyte chemotaxis • positive regulation of T cell migration • neutrophil chemotaxis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • defense response to bacterium • cell-cell signaling • lymphocyte chemotaxis • Загоєння ран • cellular response to lipoteichoic acid • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to organic substance • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to interleukin-1 • cellular response to interferon-gamma • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to lipopolysaccharide • хемотаксис • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • cell chemotaxis • T cell migration • thymocyte migration • inflammatory response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • cytokine-mediated signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 227.81 – 227.82 Mb | Хр. 1: 83.09 – 83.1 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CCL20 (англ. C-C motif chemokine ligand 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 96 амінокислот, а молекулярна маса — 10 762[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCCTKSLLLA | | ALMSVLLLHL | | CGESEAASNF | | DCCLGYTDRI | | LHPKFIVGFT |
RQLANEGCDI | | NAIIFHTKKK | | LSVCANPKQT | | WVKYIVRLLS | | KKVKNM |
Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як запальна відповідь, хемотаксис, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Roehrl J., Yang D., Oppenheim J.J., Hehlgans T. (2010). Specific binding and chemotactic activity of mBD4 and its functional orthologue hBD2 to CCR6-expressing cells. J. Biol. Chem. 285: 7028—7034. PMID 20068036 DOI:10.1074/jbc.M109.091090
- Ito T., Carson W.F. IV, Cavassani K.A., Connett J.M., Kunkel S.L. (2011). CCR6 as a mediator of immunity in the lung and gut. Exp. Cell Res. 317: 613—619. PMID 21376174 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.12.018
- Rossi D.L., Vicari A.P., Franz-Bacon K., McClanahan T.K., Zlotnik A. (1997). Identification through bioinformatics of two new macrophage proinflammatory human chemokines: MIP-3alpha and MIP-3beta. J. Immunol. 158: 1033—1036. PMID 9013939
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10619 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P78556 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |