CD1B

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1GZP, 1GZQ, 1UQS, 2H26, 3OV6, 3T8X, 4ONO

Ідентифікатори

Символи

CD1B, CD1, CD1A, R1, CD1b molecule

Зовнішні ІД

OMIM: 188360 HomoloGene: 129921 GeneCards: CD1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-2-microglobulin binding • endogenous lipid antigen binding • ліпопептидний зв'язок • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • exogenous lipid antigen binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • cell surface • lysosomal membrane • ендосома • лізосома • endosome membrane • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинний простір • external side of plasma membrane
Біологічний процес	• antigen processing and presentation, exogenous lipid antigen via MHC class Ib • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • regulation of immune response • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • antigen processing and presentation, endogenous lipid antigen via MHC class Ib
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


910


н/д

Ensembl


ENSG00000158485


н/д

UniProt


P29016


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001764


н/д

RefSeq (білок)


NP_001755


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 158.33 – 158.33 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

CD1B (англ. CD1b molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 333 амінокислот, а молекулярна маса — 36 939^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLLPFQLLA	VLFPGGNSEH	AFQGPTSFHV	IQTSSFTNST	WAQTQGSGWL
DDLQIHGWDS	DSGTAIFLKP	WSKGNFSDKE	VAELEEIFRV	YIFGFAREVQ
DFAGDFQMKY	PFEIQGIAGC	ELHSGGAIVS	FLRGALGGLD	FLSVKNASCV
PSPEGGSRAQ	KFCALIIQYQ	GIMETVRILL	YETCPRYLLG	VLNAGKADLQ
RQVKPEAWLS	SGPSPGPGRL	QLVCHVSGFY	PKPVWVMWMR	GEQEQQGTQL
GDILPNANWT	WYLRATLDVA	DGEAAGLSCR	VKHSSLEGQD	IILYWRNPTS
IGSIVLAIIV	PSLLLLLCLA	LWYMRRRSYQ	NIP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

Martin L.H., Calabi F., Lefebvre F.-A., Bilsland C.A.G., Milstein C. (1987). Structure and expression of the human thymocyte antigens CD1a, CD1b, and CD1c. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 9189—9193. PMID 2447586 DOI:10.1073/pnas.84.24.9189
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin L.H., Calabi F., Milstein C. (1986). Isolation of CD1 genes: a family of major histocompatibility complex-related differentiation antigens. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9154—9158. PMID 3097645 DOI:10.1073/pnas.83.23.9154
Briken V., Jackman R.M., Watts G.F.M., Rogers R.A., Porcelli S.A. (2000). Human CD1b and CD1c isoforms survey different intracellular compartments for the presentation of microbial lipid antigens. J. Exp. Med. 192: 281—288. PMID 10899914 DOI:10.1084/jem.192.2.281
Aruffo A., Seed B. (1989). Expression of cDNA clones encoding the thymocyte antigens CD1a, b, c demonstrates a hierarchy of exclusion in fibroblasts. J. Immunol. 143: 1723—1730. PMID 2701945

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1635 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.
↑ UniProt, P29016 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.