CDK5R1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1H4L, 1UNG, 1UNH, 1UNL, 3O0G | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDK5R1, CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603460 MGI: 101764 HomoloGene: 31200 GeneCards: CDK5R1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein kinase activity • calcium ion binding • ephrin receptor binding • cadherin binding • GO:0016534 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • protein serine/threonine kinase activator activity • protease binding • actin binding • ionotropic glutamate receptor binding • alpha-tubulin binding • beta-tubulin binding • actin filament binding • protein kinase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • внутрішньоклітинна мембранна органела • growth cone • neuromuscular junction • dendritic spine • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • protein kinase 5 complex • perinuclear region of cytoplasm • contractile fiber • клітинне ядро • нуклеоплазма • клітинна мембрана • мікротрубочка • neuron projection • presynapse |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of protein kinase activity • regulation of neuron differentiation • G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • regulation of actin cytoskeleton organization • embryo development • ритмічний процес • ephrin receptor signaling pathway • neuron cell-cell adhesion • regulation of microtubule cytoskeleton organization • neuron migration • cerebellum development • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of neuron apoptotic process • brain development • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • layer formation in cerebral cortex • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • neuron differentiation • проліферація • peptidyl-threonine phosphorylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • neuron projection development • cerebral cortex radially oriented cell migration • axonal fasciculation • hippocampus development • negative regulation of axon extension • regulation of dendritic spine morphogenesis • regulation of macroautophagy • superior olivary nucleus maturation • positive regulation of protein targeting to membrane • axon guidance • regulation of signal transduction by p53 class mediator • serine phosphorylation of STAT protein • microtubule cytoskeleton organization • embryo development ending in birth or egg hatching • positive regulation of microtubule polymerization • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • regulation of synaptic vesicle cycle • activation of protein kinase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 32.49 – 32.49 Mb | Хр. 11: 80.37 – 80.37 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDK5R1 (англ. Cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 307 амінокислот, а молекулярна маса — 34 060[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGTVLSLSPS | | YRKATLFEDG | | AATVGHYTAV | | QNSKNAKDKN | | LKRHSIISVL |
PWKRIVAVSA | | KKKNSKKVQP | | NSSYQNNITH | | LNNENLKKSL | | SCANLSTFAQ |
PPPAQPPAPP | | ASQLSGSQTG | | GSSSVKKAPH | | PAVTSAGTPK | | RVIVQASTSE |
LLRCLGEFLC | | RRCYRLKHLS | | PTDPVLWLRS | | VDRSLLLQGW | | QDQGFITPAN |
VVFLYMLCRD | | VISSEVGSDH | | ELQAVLLTCL | | YLSYSYMGNE | | ISYPLKPFLV |
ESCKEAFWDR | | CLSVINLMSS | | KMLQINADPH | | YFTQVFSDLK | | NESGQEDKKR |
LLLGLDR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як біологічні ритми. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.
Література
- Tsai L.-H., Delalle I., Caviness V.S. Jr., Chae T., Harlow E. (1994). p35 is a neural-specific regulatory subunit of cyclin-dependent kinase 5. Nature. 371: 419—423. PMID 8090221 DOI:10.1038/371419a0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kerokoski P., Suuronen T., Salminen A., Soininen H., Pirttilae T. (2002). Influence of phosphorylation of p35, an activator of cyclin-dependent kinase 5 (cdk5), on the proteolysis of p35. Brain Res. Mol. Brain Res. 106: 50—56. PMID 12393264 DOI:10.1016/S0169-328X(02)00409-6
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1775 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q15078 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |