CDKL1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CDKL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4AGU

Ідентифікатори

Символи

CDKL1, KKIALRE, P42, cyclin dependent kinase like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603441 MGI: 1918341 HomoloGene: 55805 GeneCards: CDKL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ATP binding • kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • ciliary transition zone
Біологічний процес	• heart development • фосфорилювання • regulation of cell cycle • protein phosphorylation • regulation of cilium assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8814


71091

Ensembl


ENSG00000100490


ENSMUSG00000020990

UniProt


Q00532


Q8CEQ0

RefSeq (мРНК)


NM_001282236 NM_004196 NM_001367064 NM_001367065


NM_183294

RefSeq (білок)


NP_001269165 NP_004187 NP_001353993 NP_001353994


NP_899117

Локус (UCSC)

Хр. 14: 50.33 – 50.42 Mb

Хр. 12: 69.79 – 69.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDKL1 (англ. Cyclin dependent kinase like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 357 амінокислот, а молекулярна маса — 41 671^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEKYEKIGKI	GEGSYGVVFK	CRNRDTGQIV	AIKKFLESED	DPVIKKIALR
EIRMLKQLKH	PNLVNLLEVF	RRKRRLHLVF	EYCDHTVLHE	LDRYQRGVPE
HLVKSITWQT	LQAVNFCHKH	NCIHRDVKPE	NILITKHSVI	KLCDFGFARL
LAGPSDYYTD	YVATRWYRSP	ELLVGDTQYG	PPVDVWAIGC	VFAELLSGVP
LWPGKSDVDQ	LYLIRKTLGD	LIPRHQQVFS	TNQYFSGVKI	PDPEDMEPLE
LKFPNISYPA	LGLLKGCLHM	DPTQRLTCEQ	LLHHPYFENI	REIEDLAKEH
NKPTRKTLRK	SRKHHCFTET	SKLQYLPQLT	GSSILPALDN	KKYYCDTKKL
NYRFPNI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Taglienti C.A., Wysk M., Davis R.J. (1996). Molecular cloning of the epidermal growth factor-stimulated protein kinase p56 KKIAMRE. Oncogene. 13: 2563—2574. PMID 9000130

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1781 (англ.) . Архів оригіналу за 3 червня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q00532 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.