CDO1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2IC1

Ідентифікатори

Символи

CDO1, CDO-I, cysteine dioxygenase type 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603943 MGI: 105925 HomoloGene: 1365 GeneCards: CDO1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • oxidoreductase activity • ferrous iron binding • oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen • cysteine dioxygenase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма
Біологічний процес	• response to amino acid • response to glucagon • taurine biosynthetic process • cysteine metabolic process • response to glucocorticoid • response to organonitrogen compound • response to cAMP • лактація • response to ethanol • sulfur amino acid biosynthetic process • inflammatory response • L-cysteine catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1036


12583

Ensembl


ENSG00000129596


ENSMUSG00000033022

UniProt


Q16878


P60334

RefSeq (мРНК)


NM_001801 NM_001323565 NM_001323566 NM_001323567


NM_033037

RefSeq (білок)


NP_001310494 NP_001310495 NP_001310496 NP_001792


NP_149026

Локус (UCSC)

Хр. 5: 115.8 – 115.82 Mb

Хр. 18: 46.85 – 46.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDO1 (англ. Cysteine dioxygenase type 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 22 972^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQTEVLKPR	TLADLIRILH	QLFAGDEVNV	EEVQAIMEAY	ESDPTEWAMY
AKFDQYRYTR	NLVDQGNGKF	NLMILCWGEG	HGSSIHDHTN	SHCFLKMLQG
NLKETLFAWP	DKKSNEMVKK	SERVLRENQC	AYINDSIGLH	RVENISHTEP
AVSLHLYSPP	FDTCHAFDQR	TGHKNKVTMT	FHSKFGIRTP	NATSGSLENN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза.

Література

McCann K.P., Akbari M.T., Williams A.C., Ramsden D.B. (1994). Human cysteine dioxygenase type I: primary structure derived from base sequencing of cDNA. Biochim. Biophys. Acta. 1209: 107—110. PMID 7524679 DOI:10.1016/0167-4838(94)90144-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1795 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16878 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.