CERK

Ідентифікатори

Символи

CERK, LK4, dA59H18.2, dA59H18.3, hceramide kinase

Зовнішні ІД

OMIM: 610307 MGI: 2386052 HomoloGene: 11247 GeneCards: CERK

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • magnesium ion binding • kinase activity • ceramide kinase activity • NAD+ kinase activity • dihydroceramide kinase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • мітохондрія
Біологічний процес	• glycosphingolipid metabolic process • ceramide metabolic process • фосфорилювання • lipid phosphorylation • обмін речовин
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64781


223753

Ensembl


ENSG00000100422


ENSMUSG00000035891

UniProt


Q8TCT0


Q8K4Q7

RefSeq (мРНК)


NM_022766 NM_182661


NM_145475

RefSeq (білок)


NP_073603 NP_073603.2


NP_663450

Локус (UCSC)

Хр. 22: 46.68 – 46.74 Mb

Хр. 15: 86.14 – 86.19 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CERK (англ. Ceramide kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 537 амінокислот, а молекулярна маса — 59 977^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGATGAAEPL	QSVLWVKQQR	CAVSLEPARA	LLRWWRSPGP	GAGAPGADAC
SVPVSEIIAV	EETDVHGKHQ	GSGKWQKMEK	PYAFTVHCVK	RARRHRWKWA
QVTFWCPEEQ	LCHLWLQTLR	EMLEKLTSRP	KHLLVFINPF	GGKGQGKRIY
ERKVAPLFTL	ASITTDIIVT	EHANQAKETL	YEINIDKYDG	IVCVGGDGMF
SEVLHGLIGR	TQRSAGVDQN	HPRAVLVPSS	LRIGIIPAGS	TDCVCYSTVG
TSDAETSALH	IVVGDSLAMD	VSSVHHNSTL	LRYSVSLLGY	GFYGDIIKDS
EKKRWLGLAR	YDFSGLKTFL	SHHCYEGTVS	FLPAQHTVGS	PRDRKPCRAG
CFVCRQSKQQ	LEEEQKKALY	GLEAAEDVEE	WQVVCGKFLA	INATNMSCAC
RRSPRGLSPA	AHLGDGSSDL	ILIRKCSRFN	FLRFLIRHTN	QQDQFDFTFV
EVYRVKKFQF	TSKHMEDEDS	DLKEGGKKRF	GHICSSHPSC	CCTVSNSSWN
CDGEVLHSPA	IEVRVHCQLV	RLFARGIEEN	PKPDSHS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
Kim T.J., Mitsutake S., Kato M., Igarashi Y. (2005). The leucine 10 residue in the pleckstrin homology domain of ceramide kinase is crucial for its catalytic activity. FEBS Lett. 579: 4383—4388. PMID 16081073 DOI:10.1016/j.febslet.2005.06.079
Don A.S., Rosen H. (2009). A lipid binding domain in sphingosine kinase 2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 380: 87—92. PMID 19168031 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.01.075

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19256 (англ.) . Архів оригіналу за 25 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TCT0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.