CHD4
CHD4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CHD4, CHD-4, Mi-2b, Mi2-BETA, chromodomain helicase DNA binding protein 4, SIHIWES | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603277 MGI: 1344380 HomoloGene: 68175 GeneCards: CHD4 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Sifrim-Hitz-Weiss syndrome[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 6.57 – 6.61 Mb | Хр. 6: 125.07 – 125.11 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
CHD4 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 912 амінокислот, а молекулярна маса — 218 005[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASGLGSPSP | CSAGSEEEDM | DALLNNSLPP | PHPENEEDPE | EDLSETETPK | ||||
LKKKKKPKKP | RDPKIPKSKR | QKKERMLLCR | QLGDSSGEGP | EFVEEEEEVA | ||||
LRSDSEGSDY | TPGKKKKKKL | GPKKEKKSKS | KRKEEEEEED | DDDDSKEPKS | ||||
SAQLLEDWGM | EDIDHVFSEE | DYRTLTNYKA | FSQFVRPLIA | AKNPKIAVSK | ||||
MMMVLGAKWR | EFSTNNPFKG | SSGASVAAAA | AAAVAVVESM | VTATEVAPPP | ||||
PPVEVPIRKA | KTKEGKGPNA | RRKPKGSPRV | PDAKKPKPKK | VAPLKIKLGG | ||||
FGSKRKRSSS | EDDDLDVESD | FDDASINSYS | VSDGSTSRSS | RSRKKLRTTK | ||||
KKKKGEEEVT | AVDGYETDHQ | DYCEVCQQGG | EIILCDTCPR | AYHMVCLDPD | ||||
MEKAPEGKWS | CPHCEKEGIQ | WEAKEDNSEG | EEILEEVGGD | LEEEDDHHME | ||||
FCRVCKDGGE | LLCCDTCPSS | YHIHCLNPPL | PEIPNGEWLC | PRCTCPALKG | ||||
KVQKILIWKW | GQPPSPTPVP | RPPDADPNTP | SPKPLEGRPE | RQFFVKWQGM | ||||
SYWHCSWVSE | LQLELHCQVM | FRNYQRKNDM | DEPPSGDFGG | DEEKSRKRKN | ||||
KDPKFAEMEE | RFYRYGIKPE | WMMIHRILNH | SVDKKGHVHY | LIKWRDLPYD | ||||
QASWESEDVE | IQDYDLFKQS | YWNHRELMRG | EEGRPGKKLK | KVKLRKLERP | ||||
PETPTVDPTV | KYERQPEYLD | ATGGTLHPYQ | MEGLNWLRFS | WAQGTDTILA | ||||
DEMGLGKTVQ | TAVFLYSLYK | EGHSKGPFLV | SAPLSTIINW | EREFEMWAPD | ||||
MYVVTYVGDK | DSRAIIRENE | FSFEDNAIRG | GKKASRMKKE | ASVKFHVLLT | ||||
SYELITIDMA | ILGSIDWACL | IVDEAHRLKN | NQSKFFRVLN | GYSLQHKLLL | ||||
TGTPLQNNLE | ELFHLLNFLT | PERFHNLEGF | LEEFADIAKE | DQIKKLHDML | ||||
GPHMLRRLKA | DVFKNMPSKT | ELIVRVELSP | MQKKYYKYIL | TRNFEALNAR | ||||
GGGNQVSLLN | VVMDLKKCCN | HPYLFPVAAM | EAPKMPNGMY | DGSALIRASG | ||||
KLLLLQKMLK | NLKEGGHRVL | IFSQMTKMLD | LLEDFLEHEG | YKYERIDGGI | ||||
TGNMRQEAID | RFNAPGAQQF | CFLLSTRAGG | LGINLATADT | VIIYDSDWNP | ||||
HNDIQAFSRA | HRIGQNKKVM | IYRFVTRASV | EERITQVAKK | KMMLTHLVVR | ||||
PGLGSKTGSM | SKQELDDILK | FGTEELFKDE | ATDGGGDNKE | GEDSSVIHYD | ||||
DKAIERLLDR | NQDETEDTEL | QGMNEYLSSF | KVAQYVVREE | EMGEEEEVER | ||||
EIIKQEESVD | PDYWEKLLRH | HYEQQQEDLA | RNLGKGKRIR | KQVNYNDGSQ | ||||
EDRDWQDDQS | DNQSDYSVAS | EEGDEDFDER | SEAPRRPSRK | GLRNDKDKPL | ||||
PPLLARVGGN | IEVLGFNARQ | RKAFLNAIMR | YGMPPQDAFT | TQWLVRDLRG | ||||
KSEKEFKAYV | SLFMRHLCEP | GADGAETFAD | GVPREGLSRQ | HVLTRIGVMS | ||||
LIRKKVQEFE | HVNGRWSMPE | LAEVEENKKM | SQPGSPSPKT | PTPSTPGDTQ | ||||
PNTPAPVPPA | EDGIKIEENS | LKEEESIEGE | KEVKSTAPET | AIECTQAPAP | ||||
ASEDEKVVVE | PPEGEEKVEK | AEVKERTEEP | METEPKGAAD | VEKVEEKSAI | ||||
DLTPIVVEDK | EEKKEEEEKK | EVMLQNGETP | KDLNDEKQKK | NIKQRFMFNI | ||||
ADGGFTELHS | LWQNEERAAT | VTKKTYEIWH | RRHDYWLLAG | IINHGYARWQ | ||||
DIQNDPRYAI | LNEPFKGEMN | RGNFLEIKNK | FLARRFKLLE | QALVIEEQLR | ||||
RAAYLNMSED | PSHPSMALNT | RFAEVECLAE | SHQHLSKESM | AGNKPANAVL | ||||
HKVLKQLEEL | LSDMKADVTR | LPATIARIPP | VAVRLQMSER | NILSRLANRA | ||||
PEPTPQQVAQ |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. (1998). Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. Nature. 395: 917—921. PMID 9804427 DOI:10.1038/27699
- Schmidt D.R., Schreiber S.L. (1999). Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4. Biochemistry. 38: 14711—14717. PMID 10545197 DOI:10.1021/bi991614n
- Sillibourne J.E., Delaval B., Redick S., Sinha M., Doxsey S.J. (2007). Chromatin remodeling proteins interact with pericentrin to regulate centrosome integrity. Mol. Biol. Cell. 18: 3667—3680. PMID 17626165 DOI:10.1091/mbc.E06-07-0604
- Yuce O., West S.C. (2013). Senataxin, defective in the neurodegenerative disorder ataxia with oculomotor apraxia 2, lies at the interface of transcription and the DNA damage response. Mol. Cell. Biol. 33: 406—417. PMID 23149945 DOI:10.1128/MCB.01195-12
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHD4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1919 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14839 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 12
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |