CTBP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2OME, 4LCJ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CTBP2, C-terminal binding protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602619 MGI: 1201686 HomoloGene: 75187 GeneCards: CTBP2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
рак простати[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • NAD binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • hydroxypyruvate reductase activity • protein kinase binding • glyoxylate reductase (NADP+) activity • protein homodimerization activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • chromatin binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • retinoic acid receptor binding • structural constituent of presynaptic active zone |
---|
Клітинна компонента | • синапс • міжклітинні контакти • клітинне ядро • гіалоплазма • transcription repressor complex • ribbon synapse • presynaptic active zone cytoplasmic component • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • presynaptic cytosol • photoreceptor ribbon synapse |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • viral genome replication • transcription, DNA-templated • обмін речовин • GO:0022415 viral process • negative regulation of cell population proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway • white fat cell differentiation • positive regulation of chromatin binding • cellular response to leukemia inhibitory factor • synaptic vesicle docking • maintenance of presynaptic active zone structure |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001083914 NM_001290214 NM_001290215 NM_001329 NM_022802
| NM_001321012 NM_001321013 NM_001321014 NM_001363508 |
| | NM_001170744 NM_009980 NM_001347623 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001077383 NP_001277143 NP_001277144 NP_001307941 NP_001307942
| NP_001307943 NP_001320 NP_073713 NP_001350437 |
| | NP_001164215 NP_001334552 NP_034110 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 124.98 – 125.16 Mb | Хр. 7: 132.99 – 133.12 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CTBP2 (англ. C-terminal binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 48 945[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALVDKHKVK | | RQRLDRICEG | | IRPQIMNGPL | | HPRPLVALLD | | GRDCTVEMPI |
LKDLATVAFC | | DAQSTQEIHE | | KVLNEAVGAM | | MYHTITLTRE | | DLEKFKALRV |
IVRIGSGYDN | | VDIKAAGELG | | IAVCNIPSAA | | VEETADSTIC | | HILNLYRRNT |
WLYQALREGT | | RVQSVEQIRE | | VASGAARIRG | | ETLGLIGFGR | | TGQAVAVRAK |
AFGFSVIFYD | | PYLQDGIERS | | LGVQRVYTLQ | | DLLYQSDCVS | | LHCNLNEHNH |
HLINDFTIKQ | | MRQGAFLVNA | | ARGGLVDEKA | | LAQALKEGRI | | RGAALDVHES |
EPFSFAQGPL | | KDAPNLICTP | | HTAWYSEQAS | | LEMREAAATE | | IRRAITGRIP |
ESLRNCVNKE | | FFVTSAPWSV | | IDQQAIHPEL | | NGATYRYPPG | | IVGVAPGGLP |
AAMEGIIPGG | | IPVTHNLPTV | | AHPSQAPSPN | | QPTKHGDNRE | | HPNEQ |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у ядрі, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Katsanis N., Fisher E.M.C. (1998). A novel C-terminal binding protein (CTBP2) is closely related to CTBP1, an adenovirus E1A-binding protein, and maps to human chromosome 21q21.3. Genomics. 47: 294—299. PMID 9479502 DOI:10.1006/geno.1997.5115
- Schmitz F., Koenigstorfer A., Suedhof T.C. (2000). RIBEYE, a component of synaptic ribbons: a protein's journey through evolution provides insight into synaptic ribbon function. Neuron. 28: 857—872. PMID 11163272 DOI:10.1016/S0896-6273(00)00159-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ueda J., Tachibana M., Ikura T., Shinkai Y. (2006). Zinc finger protein Wiz links G9a/GLP histone methyltransferases to the co-repressor molecule CtBP. J. Biol. Chem. 281: 20120—20128. PMID 16702210 DOI:10.1074/jbc.M603087200
- Subramanian T., Zhao L.J., Chinnadurai G. (2013). Interaction of CtBP with adenovirus E1A suppresses immortalization of primary epithelial cells and enhances virus replication during productive infection. Virology. 443: 313—320. PMID 23747199 DOI:10.1016/j.virol.2013.05.018
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CTBP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2495 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P56545 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |