CXXC5 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CXXC5

Ідентифікатори

Символи

CXXC5, CF5, RINF, WID, HSPC195, CXXC finger protein 5

Зовнішні ІД

OMIM: 612752 MGI: 1914643 HomoloGene: 9517 GeneCards: CXXC5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • DNA binding • zinc ion binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51523


67393

Ensembl


ENSG00000171604


ENSMUSG00000046668

UniProt


Q7LFL8


Q91WA4

RefSeq (мРНК)

NM_016463 NM_001317199 NM_001317200 NM_001317201 NM_001317202
NM_001317203 NM_001317204 NM_001317205 NM_001317206 NM_001317207 NM_001317208 NM_001317209 NM_001317210 NM_001317211


NM_133687 NM_001357458 NM_001357459

RefSeq (білок)

NP_001304128 NP_001304129 NP_001304130 NP_001304131 NP_001304132
NP_001304133 NP_001304134 NP_001304135 NP_001304136 NP_001304137 NP_001304138 NP_001304139 NP_001304140 NP_057547


NP_598448 NP_001344387 NP_001344388

Локус (UCSC)

Хр. 5: 139.65 – 139.68 Mb

Хр. 18: 35.96 – 35.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CXXC5 (англ. CXXC finger protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 32 977^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSLGGGSQD	AGGSSSSSTN	GSGGSGSSGP	KAGAADKSAV	VAAAAPASVA
DDTPPPERRN	KSGIISEPLN	KSLRRSRPLS	HYSSFGSSGG	SGGGSMMGGE
SADKATAAAA	AASLLANGHD	LAAAMAVDKS	NPTSKHKSGA	VASLLSKAER
ATELAAEGQL	TLQQFAQSTE	MLKRVVQEHL	PLMSEAGAGL	PDMEAVAGAE
ALNGQSDFPY	LGAFPINPGL	FIMTPAGVFL	AESALHMAGL	AEYPMQGELA
SAISSGKKKR	KRCGMCAPCR	RRINCEQCSS	CRNRKTGHQI	CKFRKCEELK
KKPSAALEKV	MLPTGAAFRW	FQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26943 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7LFL8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.