CYP1B1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CYP1B1, CP1B, CYPIB1, GLC3A, P4501B1, cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1, ASGD6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601771 MGI: 88590 HomoloGene: 68035 GeneCards: CYP1B1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
anterior segment dysgenesis 6, juvenile glaucoma[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
chrysin[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • iron ion binding • oxygen binding • зв'язування з іоном металу • heme binding • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • oxidoreductase activity • aromatase activity • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen • monooxygenase activity |
---|
Клітинна компонента | • organelle membrane • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія |
---|
Біологічний процес | • toxin metabolic process • steroid metabolic process • retina vasculature development in camera-type eye • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • epoxygenase P450 pathway • endothelial cell-cell adhesion • omega-hydroxylase P450 pathway • Ангіогенез • cellular aromatic compound metabolic process • sterol metabolic process • response to toxic substance • зір • blood vessel morphogenesis • trabecular meshwork development • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • retinal metabolic process • endothelial cell migration • nitric oxide biosynthetic process • retinol metabolic process • адгезія клітин • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • negative regulation of cell adhesion mediated by integrin • xenobiotic metabolic process • cellular response to hydrogen peroxide • membrane lipid catabolic process • retinal blood vessel morphogenesis • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress • arachidonic acid metabolic process • negative regulation of cell migration • estrogen metabolic process • collagen fibril organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 38.07 – 38.11 Mb | Хр. 17: 80.01 – 80.02 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CYP1B1 (англ. Cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 60 846[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGTSLSPNDP | | WPLNPLSIQQ | | TTLLLLLSVL | | ATVHVGQRLL | | RQRRRQLRSA |
PPGPFAWPLI | | GNAAAVGQAA | | HLSFARLARR | | YGDVFQIRLG | | SCPIVVLNGE |
RAIHQALVQQ | | GSAFADRPAF | | ASFRVVSGGR | | SMAFGHYSEH | | WKVQRRAAHS |
MMRNFFTRQP | | RSRQVLEGHV | | LSEARELVAL | | LVRGSADGAF | | LDPRPLTVVA |
VANVMSAVCF | | GCRYSHDDPE | | FRELLSHNEE | | FGRTVGAGSL | | VDVMPWLQYF |
PNPVRTVFRE | | FEQLNRNFSN | | FILDKFLRHC | | ESLRPGAAPR | | DMMDAFILSA |
EKKAAGDSHG | | GGARLDLENV | | PATITDIFGA | | SQDTLSTALQ | | WLLLLFTRYP |
DVQTRVQAEL | | DQVVGRDRLP | | CMGDQPNLPY | | VLAFLYEAMR | | FSSFVPVTIP |
HATTANTSVL | | GYHIPKDTVV | | FVNQWSVNHD | | PLKWPNPENF | | DPARFLDKDG |
LINKDLTSRV | | MIFSVGKRRC | | IGEELSKMQL | | FLFISILAHQ | | CDFRANPNEP |
AKMNFSYGLT | | IKPKSFKVNV | | TLRESMELLD | | SAVQNLQAKE | | TCQ |
Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Choudhary D., Jansson I., Stoilov I., Sarfarazi M., Schenkman J.B. (2004). Metabolism of retinoids and arachidonic acid by human and mouse cytochrome P450 1b1. Drug Metab. Dispos. 32: 840—847. PMID 15258110 DOI:10.1124/dmd.32.8.840
- Nishida C.R., Everett S., Ortiz de Montellano P.R. (2013). Specificity determinants of CYP1B1 estradiol hydroxylation. Mol. Pharmacol. 84: 451—458. PMID 23821647 DOI:10.1124/mol.113.087700
- Wang A., Savas U., Stout C.D., Johnson E.F. (2011). Structural characterization of the complex between alpha-naphthoflavone and human cytochrome P450 1B1. J. Biol. Chem. 286: 5736—5743. PMID 21147782 DOI:10.1074/jbc.M110.204420
- Ohtake Y., Kubota R., Tanino T., Miyata H., Mashima Y. (2000). Novel compound heterozygous mutations in the cytochrome P4501B1 gene (CYP1B1) in a Japanese patient with primary congenital glaucoma. Ophthalmic Genet. 21: 191—193. PMID 11184479 DOI:10.1076/1381-6810(200009)2131-ZFT191
- Chakrabarti S., Komatireddy S., Mandal A.K., Balasubramanian D. (2003). Gene symbol: CYP1B1. Disease: glaucoma, primary congenital. Hum. Genet. 113: 556—558. PMID 14640114 DOI:10.1007/s00439-003-1035-0
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CYP1B1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2597 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q16678 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |