DCLRE1A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4B87, 5AHR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DCLRE1A, PSO2, SNM1, SNM1A, DNA cross-link repair 1A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609682 MGI: 1930042 HomoloGene: 8920 GeneCards: DCLRE1A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • damaged DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • fibrillar center • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • cellular response to DNA damage stimulus • клітинний цикл • double-strand break repair via nonhomologous end joining • interstrand cross-link repair • protection from non-homologous end joining at telomere • поділ клітини • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0100026 Репарація ДНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_018831 NM_001360437 NM_001360438 NM_001360439 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 113.83 – 113.85 Mb | Хр. 19: 56.52 – 56.54 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DCLRE1A (англ. DNA cross-link repair 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 116 400[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLEDISEEDI | | WEYKSKRKPK | | RVDPNNGSKN | | ILKSVEKATD | | GKYQSKRSRN |
RKRAAEAKEV | | KDHEVPLGNA | | GCQTSVASSQ | | NSSCGDGIQQ | | TQDKETTPGK |
LCRTQKSQHV | | SPKIRPVYDG | | YCPNCQMPFS | | SLIGQTPRWH | | VFECLDSPPR |
SETECPDGLL | | CTSTIPFHYK | | RYTHFLLAQS | | RAGDHPFSSP | | SPASGGSFSE |
TKSGVLCSLE | | ERWSSYQNQT | | DNSVSNDPLL | | MTQYFKKSPS | | LTEASEKIST |
HIQTSQQALQ | | FTDFVENDKL | | VGVALRLANN | | SEHINLPLPE | | NDFSDCEISY |
SPLQSDEDTH | | DIDEKPDDSQ | | EQLFFTESSK | | DGSLEEDDDS | | CGFFKKRHGP |
LLKDQDESCP | | KVNSFLTRDK | | YDEGLYRFNS | | LNDLSQPISQ | | NNESTLPYDL |
ACTGGDFVLF | | PPALAGKLAA | | SVHQATKAKP | | DEPEFHSAQS | | NKQKQVIEES |
SVYNQVSLPL | | VKSLMLKPFE | | SQVEGYLSSQ | | PTQNTIRKLS | | SENLNAKNNT |
NSACFCRKAL | | EGVPVGKATI | | LNTENLSSTP | | APKYLKILPS | | GLKYNARHPS |
TKVMKQMDIG | | VYFGLPPKRK | | EEKLLGESAL | | EGINLNPVPS | | PNQKRSSQCK |
RKAEKSLSDL | | EFDASTLHES | | QLSVELSSER | | SQRQKKRCRK | | SNSLQEGACQ |
KRSDHLINTE | | SEAVNLSKVK | | VFTKSAHGGL | | QRGNKKIPES | | SNVGGSRKKT |
CPFYKKIPGT | | GFTVDAFQYG | | VVEGCTAYFL | | THFHSDHYAG | | LSKHFTFPVY |
CSEITGNLLK | | NKLHVQEQYI | | HPLPLDTECI | | VNGVKVVLLD | | ANHCPGAVMI |
LFYLPNGTVI | | LHTGDFRADP | | SMERSLLADQ | | KVHMLYLDTT | | YCSPEYTFPS |
QQEVIRFAIN | | TAFEAVTLNP | | HALVVCGTYS | | IGKEKVFLAI | | ADVLGSKVGM |
SQEKYKTLQC | | LNIPEINSLI | | TTDMCSSLVH | | LLPMMQINFK | | GLQSHLKKCG |
GKYNQILAFR | | PTGWTHSNKF | | TRIADVIPQT | | KGNISIYGIP | | YSEHSSYLEM |
KRFVQWLKPQ | | KIIPTVNVGT | | WKSRSTMEKY | | FREWKLEAGY |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang X., Richie C., Legerski R.J. (2002). Translation of hSNM1 is mediated by an internal ribosome entry site that upregulates expression during mitosis. DNA Repair. 1: 379—390. PMID 12509242
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17660 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q6PJP8 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |