EIF2AK2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3UIU, 1QU6, 2A19, 2A1A | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF2AK2, PKR, PPP1R83, PRKR, eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2, LEUDEN, DYT33 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 176871 MGI: 1353449 HomoloGene: 48134 GeneCards: EIF2AK2 |
---|
шифр КФ | 2.7.10.2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
PKR inhibitor[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded RNA binding • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • eukaryotic translation initiation factor 2alpha kinase activity • protein phosphatase regulator activity • RNA binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • рибосома • мембрана • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • гіалоплазма • cytosolic ribosome |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of translation • regulation of hematopoietic stem cell proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Біосинтез білків • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • процес імунної системи • фосфорилювання • cellular response to amino acid starvation • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • transcription, DNA-templated • Відповідь на незгорнуті білки • protein phosphorylation • negative regulation of viral genome replication • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • regulation of hematopoietic progenitor cell differentiation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • defense response to virus • response to interferon-alpha • positive regulation of chemokine production • negative regulation of osteoblast proliferation • protein autophosphorylation • regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • peptidyl-tyrosine phosphorylation • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • response to toxic substance • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • response to virus • regulation of translational initiation by eIF2 alpha phosphorylation • regulation of apoptotic process • negative regulation of cell population proliferation • regulation of phosphoprotein phosphatase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001135651 NM_001135652 NM_002759 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001129123 NP_001129124 NP_002750 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 37.1 – 37.16 Mb | Хр. 17: 79.16 – 79.19 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF2AK2 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 551 амінокислот, а молекулярна маса — 62 094[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGDLSAGFF | | MEELNTYRQK | | QGVVLKYQEL | | PNSGPPHDRR | | FTFQVIIDGR |
EFPEGEGRSK | | KEAKNAAAKL | | AVEILNKEKK | | AVSPLLLTTT | | NSSEGLSMGN |
YIGLINRIAQ | | KKRLTVNYEQ | | CASGVHGPEG | | FHYKCKMGQK | | EYSIGTGSTK |
QEAKQLAAKL | | AYLQILSEET | | SVKSDYLSSG | | SFATTCESQS | | NSLVTSTLAS |
ESSSEGDFSA | | DTSEINSNSD | | SLNSSSLLMN | | GLRNNQRKAK | | RSLAPRFDLP |
DMKETKYTVD | | KRFGMDFKEI | | ELIGSGGFGQ | | VFKAKHRIDG | | KTYVIKRVKY |
NNEKAEREVK | | ALAKLDHVNI | | VHYNGCWDGF | | DYDPETSDDS | | LESSDYDPEN |
SKNSSRSKTK | | CLFIQMEFCD | | KGTLEQWIEK | | RRGEKLDKVL | | ALELFEQITK |
GVDYIHSKKL | | IHRDLKPSNI | | FLVDTKQVKI | | GDFGLVTSLK | | NDGKRTRSKG |
TLRYMSPEQI | | SSQDYGKEVD | | LYALGLILAE | | LLHVCDTAFE | | TSKFFTDLRD |
GIISDIFDKK | | EKTLLQKLLS | | KKPEDRPNTS | | EILRTLTVWK | | KSPEKNERHT |
C |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, антивірусний захист, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Thomis D.C., Doohan J.P., Samuel C.E. (1992). Mechanism of interferon action: cDNA structure, expression, and regulation of the interferon-induced, RNA-dependent P1/eIF-2 alpha protein kinase from human cells. Virology. 188: 33—46. PMID 1373553 DOI:10.1016/0042-6822(92)90732-5
- Kuhen K.L., Shen X., Samuel C.E. (1996). Mechanism of interferon action sequence of the human interferon-inducible RNA-dependent protein kinase (PKR) deduced from genomic clones. Gene. 178: 191—193. PMID 8921913 DOI:10.1016/0378-1119(96)00314-9
- Xu Z., Williams B.R. (1998). Genomic features of human PKR: alternative splicing and a polymorphic CGG repeat in the 5'-untranslated region. J. Interferon Cytokine Res. 18: 609—616. PMID 9726442 DOI:10.1089/jir.1998.18.609
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Polyak S.J., Tang N., Wambach M., Barber G.N., Katze M.G. (1996). The P58 cellular inhibitor complexes with the interferon-induced, double-stranded RNA-dependent protein kinase, PKR, to regulate its autophosphorylation and activity. J. Biol. Chem. 271: 1702—1707. PMID 8576172 DOI:10.1074/jbc.271.3.1702
- Brand S.R., Kobayashi R., Mathews M.B. (1997). The Tat protein of human immunodeficiency virus type 1 is a substrate and inhibitor of the interferon-induced, virally activated protein kinase, PKR. J. Biol. Chem. 272: 8388—8395. PMID 9079663 DOI:10.1074/jbc.272.13.8388
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9437 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P19525 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |