EPHB4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2BBA, 2E7H, 2QKQ, 2VWU, 2VWV, 2VWW, 2VWX, 2VWY, 2VWZ, 2VX0, 2VX1, 2X9F, 2XVD, 2YN8, 3ZEW, 4AW5, 4BB4, 2HLE

Ідентифікатори

Символи

EPHB4, Ephb4, AI042935, Htk, MDK2, Myk1, Tyro11, EPH receptor B4, HTK, MYK1, TYRO11, HFASD, CMAVM2, LMPHM7

Зовнішні ІД

OMIM: 600011 MGI: 104757 HomoloGene: 20939 GeneCards: EPHB4

Пов'язані генетичні захворювання

capillary malformation-arteriovenous malformation syndrome^[1]

Реагує на сполуку

tesevatinib^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • ephrin receptor activity • transmembrane-ephrin receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • екзосома • neuron projection • receptor complex
Біологічний процес	• фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • heart morphogenesis • cell migration involved in sprouting angiogenesis • multicellular organism development • protein phosphorylation • адгезія клітин • Ангіогенез • protein autophosphorylation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • ephrin receptor signaling pathway • axon guidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2050


13846

Ensembl


ENSG00000196411


ENSMUSG00000029710

UniProt


P54760


P54761

RefSeq (мРНК)


NM_004444


NM_001159571 NM_010144

RefSeq (білок)


NP_004435


NP_001153043 NP_034274

Локус (UCSC)

Хр. 7: 100.8 – 100.83 Mb

Хр. 5: 137.35 – 137.38 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EPHB4 (англ. EPH receptor B4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 987 амінокислот, а молекулярна маса — 108 270^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELRVLLCWA	SLAAALEETL	LNTKLETADL	KWVTFPQVDG	QWEELSGLDE
EQHSVRTYEV	CDVQRAPGQA	HWLRTGWVPR	RGAVHVYATL	RFTMLECLSL
PRAGRSCKET	FTVFYYESDA	DTATALTPAW	MENPYIKVDT	VAAEHLTRKR
PGAEATGKVN	VKTLRLGPLS	KAGFYLAFQD	QGACMALLSL	HLFYKKCAQL
TVNLTRFPET	VPRELVVPVA	GSCVVDAVPA	PGPSPSLYCR	EDGQWAEQPV
TGCSCAPGFE	AAEGNTKCRA	CAQGTFKPLS	GEGSCQPCPA	NSHSNTIGSA
VCQCRVGYFR	ARTDPRGAPC	TTPPSAPRSV	VSRLNGSSLH	LEWSAPLESG
GREDLTYALR	CRECRPGGSC	APCGGDLTFD	PGPRDLVEPW	VVVRGLRPDF
TYTFEVTALN	GVSSLATGPV	PFEPVNVTTD	REVPPAVSDI	RVTRSSPSSL
SLAWAVPRAP	SGAVLDYEVK	YHEKGAEGPS	SVRFLKTSEN	RAELRGLKRG
ASYLVQVRAR	SEAGYGPFGQ	EHHSQTQLDE	SEGWREQLAL	IAGTAVVGVV
LVLVVIVVAV	LCLRKQSNGR	EAEYSDKHGQ	YLIGHGTKVY	IDPFTYEDPN
EAVREFAKEI	DVSYVKIEEV	IGAGEFGEVC	RGRLKAPGKK	ESCVAIKTLK
GGYTERQRRE	FLSEASIMGQ	FEHPNIIRLE	GVVTNSMPVM	ILTEFMENGA
LDSFLRLNDG	QFTVIQLVGM	LRGIASGMRY	LAEMSYVHRD	LAARNILVNS
NLVCKVSDFG	LSRFLEENSS	DPTYTSSLGG	KIPIRWTAPE	AIAFRKFTSA
SDAWSYGIVM	WEVMSFGERP	YWDMSNQDVI	NAIEQDYRLP	PPPDCPTSLH
QLMLDCWQKD	RNARPRFPQV	VSALDKMIRN	PASLKIVARE	NGGASHPLLD
QRQPHYSAFG	SVGEWLRAIK	MGRYEESFAA	AGFGSFELVS	QISAEDLLRI
GVTLAGHQKK	ILASVQHMKS	QAKPGTPGGT	GGPAPQY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fueller T., Korff T., Kilian A., Dandekar G., Augustin H.G. (2003). Forward EphB4 signaling in endothelial cells controls cellular repulsion and segregation from ephrinB2 positive cells. J. Cell Sci. 116: 2461—2470. PMID 12734395 DOI:10.1242/jcs.00426
Unified nomenclature for Eph family receptors and their ligands, the ephrins. Cell. 90: 403—404. 1997. PMID 9267020

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EPHB4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з EPH receptor B4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3395 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P54760 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.