EPHB6

Ідентифікатори

Символи

EPHB6, HEP, EPH receptor B6

Зовнішні ІД

OMIM: 602757 MGI: 1096338 HomoloGene: 20940 GeneCards: EPHB6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ephrin receptor activity • signaling receptor activity • protein tyrosine kinase activity • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity • transmembrane-ephrin receptor activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • гіалоплазма • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • цитоплазма • neuron projection • receptor complex
Біологічний процес	• protein phosphorylation • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • ephrin receptor signaling pathway • peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of signal transduction • диференціація клітин • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • axon guidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2051


13848

Ensembl


ENSG00000106123 ENSG00000275482


ENSMUSG00000029869

UniProt


O15197


O08644

RefSeq (мРНК)


NM_001280794 NM_001280795 NM_004445


NM_001146351 NM_007680

RefSeq (білок)


NP_001267723 NP_001267724 NP_004436


NP_001139823 NP_031706

Локус (UCSC)

Хр. 7: 142.86 – 142.87 Mb

Хр. 6: 41.58 – 41.6 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EPHB6 (англ. EPH receptor B6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 021 амінокислот, а молекулярна маса — 110 700^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATEGAAQLG	NRVAGMVCSL	WVLLLVSSVL	ALEEVLLDTT	GETSEIGWLT
YPPGGWDEVS	VLDDQRRLTR	TFEACHVAGA	PPGTGQDNWL	QTHFVERRGA
QRAHIRLHFS	VRACSSLGVS	GGTCRETFTL	YYRQAEEPDS	PDSVSSWHLK
RWTKVDTIAA	DESFPSSSSS	SSSSSSAAWA	VGPHGAGQRA	GLQLNVKERS
FGPLTQRGFY	VAFQDTGACL	ALVAVRLFSY	TCPAVLRSFA	SFPETQASGA
GGASLVAAVG	TCVAHAEPEE	DGVGGQAGGS	PPRLHCNGEG	KWMVAVGGCR
CQPGYQPARG	DKACQACPRG	LYKSSAGNAP	CSPCPARSHA	PNPAAPVCPC
LEGFYRASSD	PPEAPCTGPP	SAPQELWFEV	QGSALMLHWR	LPRELGGRGD
LLFNVVCKEC	EGRQEPASGG	GGTCHRCRDE	VHFDPRQRGL	TESRVLVGGL
RAHVPYILEV	QAVNGVSELS	PDPPQAAAIN	VSTSHEVPSA	VPVVHQVSRA
SNSITVSWPQ	PDQTNGNILD	YQLRYYDQAE	DESHSFTLTS	ETNTATVTQL
SPGHIYGFQV	RARTAAGHGP	YGGKVYFQTL	PQGELSSQLP	ERLSLVIGSI
LGALAFLLLA	AITVLAVVFQ	RKRRGTGYTE	QLQQYSSPGL	GVKYYIDPST
YEDPCQAIRE	LAREVDPAYI	KIEEVIGTGS	FGEVRQGRLQ	PRGRREQTVA
IQALWAGGAE	SLQMTFLGRA	AVLGQFQHPN	ILRLEGVVTK	SRPLMVLTEF
MELGPLDSFL	RQREGQFSSL	QLVAMQRGVA	AAMQYLSSFA	FVHRSLSAHS
VLVNSHLVCK	VARLGHSPQG	PSCLLRWAAP	EVIAHGKHTT	SSDVWSFGIL
MWEVMSYGER	PYWDMSEQEV	LNAIEQEFRL	PPPPGCPPGL	HLLMLDTWQK
DRARRPHFDQ	LVAAFDKMIR	KPDTLQAGGD	PGERPSQALL	TPVALDFPCL
DSPQAWLSAI	GLECYQDNFS	KFGLCTFSDV	AQLSLEDLPA	LGITLAGHQK
KLLHHIQLLQ	QHLRQQGSVE	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Freywald A., Sharfe N., Roifman C.M. (2002). The kinase-null EphB6 receptor undergoes transphosphorylation in a complex with EphB1. J. Biol. Chem. 277: 3823—3828. PMID 11713248 DOI:10.1074/jbc.M108011200
Freywald A., Sharfe N., Rashotte C., Grunberger T., Roifman C.M. (2003). The EphB6 receptor inhibits JNK activation in T lymphocytes and modulates T cell receptor-mediated responses. J. Biol. Chem. 278: 10150—10156. PMID 12517763 DOI:10.1074/jbc.M208179200
Matsuoka H., Obama H., Kelly M.L., Matsui T., Nakamoto M. (2005). Biphasic functions of the kinase-defective Ephb6 receptor in cell adhesion and migration. J. Biol. Chem. 280: 29355—29363. PMID 15955811 DOI:10.1074/jbc.M500010200
Fox B.P., Kandpal R.P. (2009). EphB6 receptor significantly alters invasiveness and other phenotypic characteristics of human breast carcinoma cells. Oncogene. 28: 1706—1713. PMID 19234485 DOI:10.1038/onc.2009.18

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3396 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O15197 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.