ERAP1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/99/3QNF.pdb.png/250px-3QNF.pdb.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2YD0, 3MDJ, 3QNF, 3RJO | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ERAP1, A-LAP, ALAP, APPILS, ARTS-1, ARTS1, ERAAP, ERAAP1, PILS-AP, PILSAP, endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606832 MGI: 1933403 HomoloGene: 140581 GeneCards: ERAP1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
анкілозуючий спондилоартрит[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • interleukin-6 receptor binding • пептидний зв'язок • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • interleukin-1, type II receptor binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • aminopeptidase activity • metalloexopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • endopeptidase activity • metalloaminopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • extracellular region • ендоплазматичний ретикулум • екзосома • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • regulation of innate immune response • адаптивна імунна відповідь • response to bacterium • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • протеоліз • positive regulation of angiogenesis • membrane protein ectodomain proteolysis • Ангіогенез • fat cell differentiation • peptide catabolic process • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I • regulation of blood pressure • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cell-cell signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4e/PBB_GE_ARTS-1_214034_at_fs.png/250px-PBB_GE_ARTS-1_214034_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f2/PBB_GE_ARTS-1_214012_at_fs.png/250px-PBB_GE_ARTS-1_214012_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001040458 NM_001198541 NM_016442 NM_001349244 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001035548 NP_001185470 NP_057526 NP_001336173 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 96.76 – 96.81 Mb | Хр. 13: 74.79 – 74.84 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ERAP1 (англ. Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 107 235[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVFLPLKWSL | | ATMSFLLSSL | | LALLTVSTPS | | WCQSTEASPK | | RSDGTPFPWN |
KIRLPEYVIP | | VHYDLLIHAN | | LTTLTFWGTT | | KVEITASQPT | | STIILHSHHL |
QISRATLRKG | | AGERLSEEPL | | QVLEHPRQEQ | | IALLAPEPLL | | VGLPYTVVIH |
YAGNLSETFH | | GFYKSTYRTK | | EGELRILAST | | QFEPTAARMA | | FPCFDEPAFK |
ASFSIKIRRE | | PRHLAISNMP | | LVKSVTVAEG | | LIEDHFDVTV | | KMSTYLVAFI |
ISDFESVSKI | | TKSGVKVSVY | | AVPDKINQAD | | YALDAAVTLL | | EFYEDYFSIP |
YPLPKQDLAA | | IPDFQSGAME | | NWGLTTYRES | | ALLFDAEKSS | | ASSKLGITMT |
VAHELAHQWF | | GNLVTMEWWN | | DLWLNEGFAK | | FMEFVSVSVT | | HPELKVGDYF |
FGKCFDAMEV | | DALNSSHPVS | | TPVENPAQIR | | EMFDDVSYDK | | GACILNMLRE |
YLSADAFKSG | | IVQYLQKHSY | | KNTKNEDLWD | | SMASICPTDG | | VKGMDGFCSR |
SQHSSSSSHW | | HQEGVDVKTM | | MNTWTLQKGF | | PLITITVRGR | | NVHMKQEHYM |
KGSDGAPDTG | | YLWHVPLTFI | | TSKSDMVHRF | | LLKTKTDVLI | | LPEEVEWIKF |
NVGMNGYYIV | | HYEDDGWDSL | | TGLLKGTHTA | | VSSNDRASLI | | NNAFQLVSIG |
KLSIEKALDL | | SLYLKHETEI | | MPVFQGLNEL | | IPMYKLMEKR | | DMNEVETQFK |
AFLIRLLRDL | | IDKQTWTDEG | | SVSERMLRSQ | | LLLLACVHNY | | QPCVQRAEGY |
FRKWKESNGN | | LSLPVDVTLA | | VFAVGAQSTE | | GWDFLYSKYQ | | FSLSSTEKSQ |
IEFALCRTQN | | KEKLQWLLDE | | SFKGDKIKTQ | | EFPQILTLIG | | RNPVGYPLAW |
QFLRKNWNKL | | VQKFELGSSS | | IAHMVMGTTN | | QFSTRTRLEE | | VKGFFSSLKE |
NGSQLRCVQQ | | TIETIEENIG | | WMDKNFDKIR | | VWLQSEKLER | | M |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, амінопептидаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Hattori A., Matsumoto H., Mizutani S., Tsujimoto M. (1999). Molecular cloning of adipocyte-derived leucine aminopeptidase highly related to placental leucine aminopeptidase/oxytocinase. J. Biochem. 125: 931—938. PMID 10220586 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022371
- Hattori A., Matsumoto K., Mizutani S., Tsujimoto M. (2001). Genomic organization of the human adipocyte-derived leucine aminopeptidase gene and its relationship to the placental leucine aminopeptidase/oxytocinase gene. J. Biochem. 130: 235—241. PMID 11481040 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002977
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chang S.-C., Momburg F., Bhutani N., Goldberg A.L. (2005). The ER aminopeptidase, ERAP1, trims precursors to lengths of MHC class I peptides by a 'molecular ruler' mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 17107—17112. PMID 16286653 DOI:10.1073/pnas.0500721102
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ERAP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18173 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9NZ08 (англ.) . Архів оригіналу за 20 листопада 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |