EXOSC5

EXOSC5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2NN6

Ідентифікатори
Символи EXOSC5, RRP41B, RRP46, Rrp46p, hRrp46p, p12B, Exosome component 5, CABAC
Зовнішні ІД OMIM: 606492 MGI: 107889 HomoloGene: 5981 GeneCards: EXOSC5
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• 3'-5'-exoribonuclease activity
• exoribonuclease activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• RNA binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• Екзосома
• nuclear exosome (RNase complex)
• cytoplasmic exosome (RNase complex)
• ядерце
• клітинне ядро
• нуклеоплазма

Біологічний процес

• regulation of mRNA stability
• nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'
• rRNA 3'-end processing
• rRNA catabolic process
• DNA deamination
• GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance
• defense response to virus
• exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA
• U4 snRNA 3'-end processing
• polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing
• Деградація РНК
• rRNA processing
• RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
56915
27998
Ensembl
ENSG00000077348
ENSMUSG00000061286
UniProt
Q9NQT4
Q9CRA8
RefSeq (мРНК)
NM_020158
NM_138586
RefSeq (білок)
NP_064543
NP_613052
Локус (UCSC) Хр. 19: 41.39 – 41.4 Mb Хр. 7: 25.36 – 25.37 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EXOSC5 (англ. Exosome component 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот, а молекулярна маса — 25 249[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEEETHTDAKIRAENGTGSSPRGPGCSLRHFACEQNLLSRPDGSASFLQG
DTSVLAGVYGPAEVKVSKEIFNKATLEVILRPKIGLPGVAEKSRERLIRN
TCEAVVLGTLHPRTSITVVLQVVSDAGSLLACCLNAACMALVDAGVPMRA
LFCGVACALDSDGTLVLDPTSKQEKEARAVLTFALDSVERKLLMSSTKGL
YSDTELQQCLAAAQAASQHVFRFYRESLQRRYSKS

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Raijmakers R., Noordman Y.E., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions of hCsl4p with other human exosome subunits. J. Mol. Biol. 315: 809—818. PMID 11812149 DOI:10.1006/jmbi.2001.5265
  • Guo X., Ma J., Sun J., Gao G. (2007). The zinc-finger antiviral protein recruits the RNA processing exosome to degrade the target mRNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 151—156. PMID 17185417 DOI:10.1073/pnas.0607063104
  • Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105
  • Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
  • Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Exosome component 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24662 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. ↑ UniProt, Q9NQT4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»