GPBP1

Ідентифікатори

Символи

GPBP1, GPBP, SSH6, VASCULIN, GC-rich promoter binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608412 MGI: 1920524 HomoloGene: 11292 GeneCards: GPBP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • гіалоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


65056


73274

Ensembl


ENSG00000062194


ENSMUSG00000032745

UniProt


Q86WP2


Q6NXH3

RefSeq (мРНК)


NM_001127235 NM_001127236 NM_001203246 NM_022913 NM_001331037

NM_001122963 NM_028487 NM_001361923 NM_001361924 NM_001361925
NM_001361926

RefSeq (білок)


NP_001120707 NP_001120708 NP_001190175 NP_001317966 NP_075064

NP_001116435 NP_082763 NP_001348852 NP_001348853 NP_001348854
NP_001348855

Локус (UCSC)

Хр. 5: 57.17 – 57.26 Mb

Хр. 13: 111.56 – 111.63 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GPBP1 (англ. GC-rich promoter binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 53 339^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQHDFAPAW	LNFPTPPSST	KSSLNFEKHS	ENFAWTENRY	DVNRRRHNSS
DGFDSAIGRP	NGGNFGRKEK	NGWRTHGRNG	TENINHRGGY	HGGSSRSRSS
IFHAGKSQGL	HENNIPDNET	GRKEDKRERK	QFEAEDFPSL	NPEYEREPNH
NKSLAAGVWE	YPPNPKSRAP	RMLVIKKGNT	KDLQLSGFPV	VGNLPSQPVK
NGTGPSVYKG	LVPKPAAPPT	KPTQWKSQTK	ENKVGTSFPH	ESTFGVGNFN
AFKSTAKNFS	PSTNSVKECN	RSNSSSPVDK	LNQQPRLTKL	TRMRTDKKSE
FLKALKRDRV	EEEHEDESRA	GSEKDDDSFN	LHNSNSTHQE	RDINRNFDEN
EIPQENGNAS	VISQQIIRSS	TFPQTDVLSS	SLEAEHRLLK	EMGWQEDSEN
DETCAPLTED	EMREFQVISE	QLQKNGLRKN	GILKNGLICD	FKFGPWKNST
FKPTTENDDT	ETSSSDTSDD	DDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29520 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q86WP2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.