HIRA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2I32

Ідентифікатори

Символи

HIRA, DGCR1, TUP1, TUPLE1, histone cell cycle regulator

Зовнішні ІД

OMIM: 600237 MGI: 99430 HomoloGene: 48172 GeneCards: HIRA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • nucleosome binding • DNA binding
Клітинна компонента	• PML body • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • HIR complex • центромера • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle cell differentiation • anatomical structure morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • гаструляція • osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • mitotic sister chromatid segregation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7290


15260

Ensembl


ENSG00000100084


ENSMUSG00000022702

UniProt


P54198


Q61666

RefSeq (мРНК)


NM_003325


NM_001005228 NM_010435

RefSeq (білок)


NP_003316


NP_034565

Локус (UCSC)

Хр. 22: 19.33 – 19.45 Mb

Хр. 16: 18.7 – 18.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HIRA (англ. Histone cell cycle regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 017 амінокислот, а молекулярна маса — 111 835^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKLLKPTWVN	HNGKPIFSVD	IHPDGTKFAT	GGQGQDSGKV	VIWNMSPVLQ
EDDEKDENIP	KMLCQMDNHL	ACVNCVRWSN	SGMYLASGGD	DKLIMVWKRA
TYIGPSTVFG	SSGKLANVEQ	WRCVSILRNH	SGDVMDVAWS	PHDAWLASCS
VDNTVVIWNA	VKFPEILATL	RGHSGLVKGL	TWDPVGKYIA	SQADDRSLKV
WRTLDWQLET	SITKPFDECG	GTTHVLRLSW	SPDGHYLVSA	HAMNNSGPTA
QIIEREGWKT	NMDFVGHRKA	VTVVKFNPKI	FKKKQKNGSS	AKPSCPYCCC
AVGSKDRSLS	VWLTCLKRPL	VVIHELFDKS	IMDISWTLNG	LGILVCSMDG
SVAFLDFSQD	ELGDPLSEEE	KSRIHQSTYG	KSLAIMTEAQ	LSTAVIENPE
MLKYQRRQQQ	QQLDQKSAAT	REMGSATSVA	GVVNGESLED	IRKNLLKKQV
ETRTADGRRR	ITPLCIAQLD	TGDFSTAFFN	SIPLSGSLAG	TMLSSHSSPQ
LLPLDSSTPN	SFGASKPCTE	PVVAASARPA	GDSVNKDSMN	ATSTPAALSP
SVLTTPSKIE	PMKAFDSRFT	ERSKATPGAP	ALTSMTPTAV	ERLKEQNLVK
ELRPRDLLES	SSDSDEKVPL	AKASSLSKRK	LELEVETVEK	KKKGRPRKDS
RLMPVSLSVQ	SPAALTAEKE	AMCLSAPALA	LKLPIPSPQR	AFTLQVSSDP
SMYIEVENEV	TVVGGVKLSR	LKCNREGKEW	ETVLTSRILT	AAGSCDVVCV
ACEKRMLSVF	STCGRRLLSP	ILLPSPISTL	HCTGSYVMAL	TAAATLSVWD
VHRQVVVVKE	ESLHSILAGS	DMTVSQILLT	QHGIPVMNLS	DGKAYCFNPS
LSTWNLVSDK	QDSLAQCADF	RSSLPSQDAM	LCSGPLAIIQ	GRTSNSGRQA
ARLFSVPHVV	QQETTLAYLE	NQVAAALTLQ	SSHEYRHWLL	VYARYLVNEG
FEYRLREICK	DLLGPVHYST	GSQWESTVVG	LRKRELLKEL	LPVIGQNLRF
QRLFTECQEQ	LDILRDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wilming L.G., Snoeren C.A.S., van Rijswijk A., Grosveld F., Meijers C. (1997). The murine homologue of HIRA, a DiGeorge syndrome candidate gene, is expressed in embryonic structures affected in human CATCH22 patients. Hum. Mol. Genet. 6: 247—258. PMID 9063745 DOI:10.1093/hmg/6.2.247
Tagami H., Ray-Gallet D., Almouzni G., Nakatani Y. (2004). Histone H3.1 and H3.3 complexes mediate nucleosome assembly pathways dependent or independent of DNA synthesis. Cell. 116: 51—61. PMID 14718166 DOI:10.1016/S0092-8674(03)01064-X
Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4916 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P54198 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.