IFIT3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | IFIT3, CIG-49, GARG-49, IFI60, IFIT4, IRG2, ISG60, P60, RIG-G, cig41, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604650 MGI: 1101055 HomoloGene: 1189 GeneCards: IFIT3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мітохондрія • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • процес імунної системи • response to virus • вроджений імунітет • negative regulation of apoptotic process • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to interferon-alpha • response to bacterium • cellular response to interferon-beta |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001549 NM_001031683 NM_001289758 NM_001289759 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001026853 NP_001276687 NP_001276688 NP_001540 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 89.33 – 89.38 Mb | Хр. 19: 34.56 – 34.57 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IFIT3 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 55 985[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSEVTKNSLE | | KILPQLKCHF | | TWNLFKEDSV | | SRDLEDRVCN | | QIEFLNTEFK |
ATMYNLLAYI | | KHLDGNNEAA | | LECLRQAEEL | | IQQEHADQAE | | IRSLVTWGNY |
AWVYYHLGRL | | SDAQIYVDKV | | KQTCKKFSNP | | YSIEYSELDC | | EEGWTQLKCG |
RNERAKVCFE | | KALEEKPNNP | | EFSSGLAIAM | | YHLDNHPEKQ | | FSTDVLKQAI |
ELSPDNQYVK | | VLLGLKLQKM | | NKEAEGEQFV | | EEALEKSPCQ | | TDVLRSAAKF |
YRRKGDLDKA | | IELFQRVLES | | TPNNGYLYHQ | | IGCCYKAKVR | | QMQNTGESEA |
SGNKEMIEAL | | KQYAMDYSNK | | ALEKGLNPLN | | AYSDLAEFLE | | TECYQTPFNK |
EVPDAEKQQS | | HQRYCNLQKY | | NGKSEDTAVQ | | HGLEGLSISK | | KSTDKEEIKD |
QPQNVSENLL | | PQNAPNYWYL | | QGLIHKQNGD | | LLQAAKCYEK | | ELGRLLRDAP |
SGIGSIFLSA | | SELEDGSEEM | | GQGAVSSSPR | | ELLSNSEQLN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.
Література
- Zhu H., Cong J.-P., Shenk T. (1997). Use of differential display analysis to assess the effect of human cytomegalovirus infection on the accumulation of cellular RNAs: induction of interferon-responsive RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 13985—13990. PMID 9391139 DOI:10.1073/pnas.94.25.13985
- de Veer M.J., Sim H., Whisstock J.C., Devenish R.J., Ralph S.J. (1998). IFI60/ISG60/IFIT4, a new member of the human IFI54/IFIT2 family of interferon-stimulated genes. Genomics. 54: 267—277. PMID 9828129 DOI:10.1006/geno.1998.5555
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Stawowczyk M., Van Scoy S., Kumar K.P., Reich N.C. (2011). The interferon stimulated gene 54 promotes apoptosis. J. Biol. Chem. 286: 7257—7266. PMID 21190939 DOI:10.1074/jbc.M110.207068
- Liu X.Y., Chen W., Wei B., Shan Y.F., Wang C. (2011). IFN-induced TPR protein IFIT3 potentiates antiviral signaling by bridging MAVS and TBK1. J. Immunol. 187: 2559—2568. PMID 21813773 DOI:10.4049/jimmunol.1100963
- Fensterl V., Sen G.C. (2011). The ISG56/IFIT1 gene family. J. Interferon Cytokine Res. 31: 71—78. PMID 20950130 DOI:10.1089/jir.2010.0101
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5411 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O14879 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |