IFNW1

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3SE4

Ідентифікатори

Символи

IFNW1, interferon omega 1

Зовнішні ІД

OMIM: 147553 HomoloGene: 105922 GeneCards: IFNW1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • type I interferon receptor binding • GO:0005145 cytokine receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• natural killer cell activation involved in immune response • B cell differentiation • defense response • B cell proliferation • response to virus • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein • humoral immune response • адаптивна імунна відповідь • defense response to virus • response to exogenous dsRNA • cytokine-mediated signaling pathway • T cell activation involved in immune response • вроджений імунітет • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3467


н/д

Ensembl


ENSG00000177047


н/д

UniProt


P05000


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_002177


н/д

RefSeq (білок)


NP_002168


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 9: 21.14 – 21.14 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

IFNW1 (англ. Interferon omega 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 195 амінокислот, а молекулярна маса — 22 319^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALLFPLLAA	LVMTSYSPVG	SLGCDLPQNH	GLLSRNTLVL	LHQMRRISPF
LCLKDRRDFR	FPQEMVKGSQ	LQKAHVMSVL	HEMLQQIFSL	FHTERSSAAW
NMTLLDQLHT	GLHQQLQHLE	TCLLQVVGEG	ESAGAISSPA	LTLRRYFQGI
RVYLKEKKYS	DCAWEVVRME	IMKSLFLSTN	MQERLRSKDR	DLGSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як противірусний захист. Секретований назовні.

Література

Capon D.J., Shepard H.M., Goeddel D.V. (1985). Two distinct families of human and bovine interferon-alpha genes are coordinately expressed and encode functional polypeptides. Mol. Cell. Biol. 5: 768—779. PMID 2985969 DOI:10.1128/MCB.5.4.768
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hauptmann R., Swetly P. (1985). A novel class of human type I interferons. Nucleic Acids Res. 13: 4739—4749. PMID 3895159 DOI:10.1093/nar/13.13.4739
Shirono H., Koga J., Uemura H., Matsuo A. (1994). Identification of glycosylated subtypes of interferon-alpha produced by human leukocytes. Biosci. Biotechnol. Biochem. 58: 1714—1715. PMID 7765487 DOI:10.1271/bbb.58.1714
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Li M.F., Zeng Q., Zhou Y., Guo H.Y., Hou Y.D. (1993). Cloning, sequencing and expression in E. coli of interferon-omega 1 gene. Sci. China, Ser. B, Chem. Life Sci. Earth Sci. 36: 1361—1366. PMID 8142025

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5448 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P05000 (англ.) . Архів оригіналу за 22 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.