IRF9

Ідентифікатори

Символи

IRF9, IRF-9, ISGF3, ISGF3G, p48, interferon regulatory factor 9

Зовнішні ІД

OMIM: 147574 MGI: 107587 HomoloGene: 4436 GeneCards: IRF9

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• cell surface receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • transcription, DNA-templated • interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • процес імунної системи
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10379


16391

Ensembl


ENSG00000213928 ENSG00000285048


ENSMUSG00000002325

UniProt


Q00978


Q61179

RefSeq (мРНК)


NM_006084 NM_001385400 NM_001385401 NM_001385402


NM_001159417 NM_001159418 NM_008394

RefSeq (білок)


NP_006075


NP_001152889 NP_001152890 NP_032420

Локус (UCSC)

Хр. 14: 24.16 – 24.17 Mb

Хр. 14: 55.84 – 55.85 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IRF9 (англ. Interferon regulatory factor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 43 696^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASGRARCTR	KLRNWVVEQV	ESGQFPGVCW	DDTAKTMFRI	PWKHAGKQDF
REDQDAAFFK	AWAIFKGKYK	EGDTGGPAVW	KTRLRCALNK	SSEFKEVPER
GRMDVAEPYK	VYQLLPPGIV	SGQPGTQKVP	SKRQHSSVSS	ERKEEEDAMQ
NCTLSPSVLQ	DSLNNEEEGA	SGGAVHSDIG	SSSSSSSPEP	QEVTDTTEAP
FQGDQRSLEF	LLPPEPDYSL	LLTFIYNGRV	VGEAQVQSLD	CRLVAEPSGS
ESSMEQVLFP	KPGPLEPTQR	LLSQLERGIL	VASNPRGLFV	QRLCPIPISW
NAPQAPPGPG	PHLLPSNECV	ELFRTAYFCR	DLVRYFQGLG	PPPKFQVTLN
FWEESHGSSH	TPQNLITVKM	EQAFARYLLE	QTPEQQAAIL	SLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Reich N.C. (2002). Nuclear/cytoplasmic localization of IRFs in response to viral infection or interferon stimulation. J. Interferon Cytokine Res. 22: 103—109. PMID 11846981 DOI:10.1089/107999002753452719
Cebulla C.M., Miller D.M., Sedmak D.D. (1999). Viral inhibition of interferon signal transduction. Intervirology. 42: 325—330. PMID 10702714 DOI:10.1159/000053968

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6131 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q00978 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.