KAT6B

KAT6B
Ідентифікатори
Символи KAT6B, GTPTS, MORF, MOZ2, MYST4, ZC2HC6B, qkf, querkopf, lysine acetyltransferase 6B
Зовнішні ІД OMIM: 605880 HomoloGene: 49310 GeneCards: KAT6B
Пов'язані генетичні захворювання
Young-Simpson syndrome, Genitopatellar syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• transferase activity
• DNA binding
• transcription factor binding
• зв'язування з іоном металу
• histone acetyltransferase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• acetyltransferase activity
• acyltransferase activity
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• H4 histone acetyltransferase activity
• GO:0031493 histone binding

Клітинна компонента

• нуклеоплазма
• Нуклеосома
• MOZ/MORF histone acetyltransferase complex
• клітинне ядро
• histone acetyltransferase complex

Біологічний процес

• nucleosome assembly
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• transcription, DNA-templated
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• histone acetylation
• histone H3 acetylation
• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• cellular response to leukemia inhibitory factor
• GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
• histone H4 acetylation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23522
568932
Ensembl
ENSG00000156650
ENSG00000281813
н/д
UniProt
Q8WYB5
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_001256468
NM_001256469
NM_012330
XM_009307391
XM_009307392
XM_009307393
XM_009307394
XM_009307395
XM_009307396
XM_692291
RefSeq (білок)
NP_001243397
NP_001243398
NP_036462
н/д
Локус (UCSC) Хр. 10: 74.82 – 75.03 Mb н/д
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KAT6B (англ. Lysine acetyltransferase 6B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 073 амінокислот, а молекулярна маса — 231 378[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVKLANPLYTEWILEAIQKIKKQKQRPSEERICHAVSTSHGLDKKTVSEQ
LELSVQDGSVLKVTNKGLASYKDPDNPGRFSSVKPGTFPKSAKGSRGSCN
DLRNVDWNKLLRRAIEGLEEPNGSSLKNIEKYLRSQSDLTSTTNNPAFQQ
RLRLGAKRAVNNGRLLKDGPQYRVNYGSLDGKGAPQYPSAFPSSLPPVSL
LPHEKDQPRADPIPICSFCLGTKESNREKKPEELLSCADCGSSGHPSCLK
FCPELTTNVKALRWQCIECKTCSACRVQGRNADNMLFCDSCDRGFHMECC
DPPLSRMPKGMWICQVCRPKKKGRKLLHEKAAQIKRRYAKPIGRPKNKLK
QRLLSVTSDEGSMNAFTGRGSPGRGQKTKVCTTPSSGHAASGKDSSSRLA
VTDPTRPGATTKITTTSTYISASTLKVNKKTKGLIDGLTKFFTPSPDGRR
SRGEIIDFSKHYRPRKKVSQKQSCTSHVLATGTTQKLKPPPSSLPPPTPI
SGQSPSSQKSSTATSSPSPQSSSSQCSVPSLSSLTTNSQLKALFDGLSHI
YTTQGQSRKKGHPSYAPPKRMRRKTELSSTAKSKAHFFGKRDIRSRFISH
SSSSSWGMARGSIFKAIAHFKRTTFLKKHRMLGRLKYKVTPQMGTPSPGK
GSLTDGRIKPDQDDDTEIKINIKQESADVNVIGNKDVVTEEDLDVFKQAQ
ELSWEKIECESGVEDCGRYPSVIEFGKYEIQTWYSSPYPQEYARLPKLYL
CEFCLKYMKSKNILLRHSKKCGWFHPPANEIYRRKDLSVFEVDGNMSKIY
CQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTKNDEKGCHLVGYFSKEKLCQ
QKYNVSCIMIMPQHQRQGFGRFLIDFSYLLSRREGQAGSPEKPLSDLGRL
SYLAYWKSVILEYLYHHHERHISIKAISRATGMCPHDIATTLQHLHMIDK
RDGRFVIIRREKLILSHMEKLKTCSRANELDPDSLRWTPILISNAAVSEE
EREAEKEAERLMEQASCWEKEEQEILSTRANSRQSPAKVQSKNKYLHSPE
SRPVTGERGQLLELSKESSEEEEEEEDEEEEEEEEEEEEDEEEEEEEEEE
EEEENIQSSPPRLTKPQSVAIKRKRPFVLKKKRGRKRRRINSSVTTETIS
ETTEVLNEPFDNSDEERPMPQLEPTCEIEVEEDGRKPVLRKAFQHQPGKK
RQTEEEEGKDNHCFKNADPCRNNMNDDSSNLKEGSKDNPEPLKCKQVWPK
GTKRGLSKWRQNKERKTGFKLNLYTPPETPMEPDEQVTVEEQKETSEGKT
SPSPIRIEEEVKETGEALLPQEENRREETCAPVSPNTSPGEKPEDDLIKP
EEEEEEEEEEEEEEEEEEGEEEEGGGNVEKDPDGAKSQEKEEPEISTEKE
DSARLDDHEEEEEEDEEPSHNEDHDADDEDDSHMESAEVEKEELPRESFK
EVLENQETFLDLNVQPGHSNPEVLMDCGVDLTASCNSEPKELAGDPEAVP
ESDEEPPPGEQAQKQDQKNSKEVDTEFKEGNPATMEIDSETVQAVQSLTQ
ESSEQDDTFQDCAETQEACRSLQNYTRADQSPQIATTLDDCQQSDHSSPV
SSVHSHPGQSVRSVNSPSVPALENSYAQISPDQSAISVPSLQNMETSPMM
DVPSVSDHSQQVVDSGFSDLGSIESTTENYENPSSYDSTMGGSICGNGSS
QNSCSYSNLTSSSLTQSSCAVTQQMSNISGSCSMLQQTSISSPPTCSVKS
PQGCVVERPPSSSQQLAQCSMAANFTPPMQLAEIPETSNANIGLYERMGQ
SDFGAGHYPQPSATFSLAKLQQLTNTLIDHSLPYSHSAAVTSYANSASLS
TPLSNTGLVQLSQSPHSVPGGPQAQATMTPPPNLTPPPMNLPPPLLQRNM
AASNIGISHSQRLQTQIASKGHISMRTKSASLSPAAATHQSQIYGRSQTV
AMQGPARTLTMQRGMNMSVNLMPAPAYNVNSVNMNMNTLNAMNGYSMSQP
MMNSGYHSNHGYMNQTPQYPMQMQMGMMGTQPYAQQPMQTPPHGNMMYTA
PGHHGYMNTGMSKQSLNGSYMRR

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, активаторів, ацилтрансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pelletier N., Champagne N., Stifani S., Yang X.-J. (2002). MOZ and MORF histone acetyltransferases interact with the Runt-domain transcription factor Runx2. Oncogene. 21: 2729—2740. PMID 11965546 DOI:10.1038/sj.onc.1205367
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KAT6B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17582 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. ↑ UniProt, Q8WYB5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 10
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»