L3MBTL2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2W0T, 3CEY, 3F70

Ідентифікатори

Символи

L3MBTL2, H-l(3)mbt-l, L3MBT, L3MBTL2 polycomb repressive complex 1 subunit, polycomb repressive complex 1 subunit, L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 611865 MGI: 2443584 HomoloGene: 12882 GeneCards: L3MBTL2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0031493 histone binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


83746


214669

Ensembl


ENSG00000100395


ENSMUSG00000022394

UniProt


Q969R5


P59178

RefSeq (мРНК)


NM_001003689 NM_031488


NM_001289711 NM_001289712 NM_145993

RefSeq (білок)


NP_113676


NP_001276640 NP_001276641 NP_666105

Локус (UCSC)

Хр. 22: 41.21 – 41.23 Mb

Хр. 15: 81.55 – 81.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

L3MBTL2 (англ. L3MBTL2, polycomb repressive complex 1 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 705 амінокислот, а молекулярна маса — 79 110^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEKPRSIEET	PSSEPMEEEE	DDDLELFGGY	DSFRSYNSSV	GSESSSYLEE
SSEAENEDRE	AGELPTSPLH	LLSPGTPRSL	DGSGSEPAVC	EMCGIVGTRE
AFFSKTKRFC	SVSCSRSYSS	NSKKASILAR	LQGKPPTKKA	KVLHKAAWSA
KIGAFLHSQG	TGQLADGTPT	GQDALVLGFD	WGKFLKDHSY	KAAPVSCFKH
VPLYDQWEDV	MKGMKVEVLN	SDAVLPSRVY	WIASVIQTAG	YRVLLRYEGF
ENDASHDFWC	NLGTVDVHPI	GWCAINSKIL	VPPRTIHAKF	TDWKGYLMKR
LVGSRTLPVD	FHIKMVESMK	YPFRQGMRLE	VVDKSQVSRT	RMAVVDTVIG
GRLRLLYEDG	DSDDDFWCHM	WSPLIHPVGW	SRRVGHGIKM	SERRSDMAHH
PTFRKIYCDA	VPYLFKKVRA	VYTEGGWFEE	GMKLEAIDPL	NLGNICVATV
CKVLLDGYLM	ICVDGGPSTD	GLDWFCYHAS	SHAIFPATFC	QKNDIELTPP
KGYEAQTFNW	ENYLEKTKSK	AAPSRLFNMD	CPNHGFKVGM	KLEAVDLMEP
RLICVATVKR	VVHRLLSIHF	DGWDSEYDQW	VDCESPDIYP	VGWCELTGYQ
LQPPVAAEPA	TPLKAKEATK	KKKKQFGKKR	KRIPPTKTRP	LRQGSKKPLL
EDDPQGARKI	SSEPVPGEII	AVRVKEEHLD	VASPDKASSP	ELPVSVENIK
QETDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Wismar J. (2001). Molecular characterization of h-l(3)mbt-like: a new member of the human mbt family. FEBS Lett. 507: 119—121. PMID 11682070 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02959-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ogawa H., Ishiguro K., Gaubatz S., Livingston D.M., Nakatani Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science. 296: 1132—1136. PMID 12004135 DOI:10.1126/science.1069861
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Lechtenberg B.C., Allen M.D., Rutherford T.J., Freund S.M., Bycroft M. (2009). Solution structure of the FCS zinc finger domain of the human polycomb group protein L(3)mbt-like 2. Protein Sci. 18: 657—661. PMID 19241375 DOI:10.1002/pro.51

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18594 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q969R5 (англ.) . Архів оригіналу за 1 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.