LGR4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4KT1, 4QXE, 4QXF | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LGR4, BNMD17, GPR48, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, DPSL |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606666 MGI: 1891468 HomoloGene: 10226 GeneCards: LGR4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
остеопороз[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • G protein-coupled receptor activity • protein-hormone receptor activity • G protein-coupled peptide receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • hair follicle development • G protein-coupled receptor signaling pathway • диференціація клітин • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • male genitalia development • metanephric nephron tubule morphogenesis • ритмічний процес • metanephric glomerulus development • процес імунної системи • epithelial cell proliferation • Wnt signaling pathway • tube morphogenesis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • cell differentiation involved in metanephros development • intestinal stem cell homeostasis • epithelial cell proliferation involved in renal tubule morphogenesis • циркадний ритм • canonical Wnt signaling pathway involved in metanephric kidney development • digestive tract development • вроджений імунітет • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • bone remodeling • circadian regulation of gene expression • Сперматогенез • osteoblast differentiation • bone mineralization • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • activation of adenylate cyclase activity • hormone-mediated signaling pathway • negative regulation of cold-induced thermogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 27.37 – 27.47 Mb | Хр. 2: 109.75 – 109.84 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LGR4 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 951 амінокислот, а молекулярна маса — 104 475[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPGPLGLLCF | | LALGLLGSAG | | PSGAAPPLCA | | APCSCDGDRR | | VDCSGKGLTA |
VPEGLSAFTQ | | ALDISMNNIT | | QLPEDAFKNF | | PFLEELQLAG | | NDLSFIHPKA |
LSGLKELKVL | | TLQNNQLKTV | | PSEAIRGLSA | | LQSLRLDANH | | ITSVPEDSFE |
GLVQLRHLWL | | DDNSLTEVPV | | HPLSNLPTLQ | | ALTLALNKIS | | SIPDFAFTNL |
SSLVVLHLHN | | NKIRSLSQHC | | FDGLDNLETL | | DLNYNNLGEF | | PQAIKALPSL |
KELGFHSNSI | | SVIPDGAFDG | | NPLLRTIHLY | | DNPLSFVGNS | | AFHNLSDLHS |
LVIRGASMVQ | | QFPNLTGTVH | | LESLTLTGTK | | ISSIPNNLCQ | | EQKMLRTLDL |
SYNNIRDLPS | | FNGCHALEEI | | SLQRNQIYQI | | KEGTFQGLIS | | LRILDLSRNL |
IHEIHSRAFA | | TLGPITNLDV | | SFNELTSFPT | | EGLNGLNQLK | | LVGNFKLKEA |
LAAKDFVNLR | | SLSVPYAYQC | | CAFWGCDSYA | | NLNTEDNSLQ | | DHSVAQEKGT |
ADAANVTSTL | | ENEEHSQIII | | HCTPSTGAFK | | PCEYLLGSWM | | IRLTVWFIFL |
VALFFNLLVI | | LTTFASCTSL | | PSSKLFIGLI | | SVSNLFMGIY | | TGILTFLDAV |
SWGRFAEFGI | | WWETGSGCKV | | AGFLAVFSSE | | SAIFLLMLAT | | VERSLSAKDI |
MKNGKSNHLK | | QFRVAALLAF | | LGATVAGCFP | | LFHRGEYSAS | | PLCLPFPTGE |
TPSLGFTVTL | | VLLNSLAFLL | | MAVIYTKLYC | | NLEKEDLSEN | | SQSSMIKHVA |
WLIFTNCIFF | | CPVAFFSFAP | | LITAISISPE | | IMKSVTLIFF | | PLPACLNPVL |
YVFFNPKFKE | | DWKLLKRRVT | | KKSGSVSVSI | | SSQGGCLEQD | | FYYDCGMYSH |
LQGNLTVCDC | | CESFLLTKPV | | SCKHLIKSHS | | CPALAVASCQ | | RPEGYWSDCG |
TQSAHSDYAD | | EEDSFVSDSS | | DQVQACGRAC | | FYQSRGFPLV | | RYAYNLPRVK |
D |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, біологічні ритми, диференціація клітин, сигнальний шлях Wnt, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Loh E.D., Broussard S.R., Kolakowski L.F. Jr. (2001). Molecular characterization of a novel glycoprotein hormone G-protein-coupled receptor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 282: 757—764. PMID 11401528 DOI:10.1006/bbrc.2001.4625
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Carmon K.S., Gong X., Lin Q., Thomas A., Liu Q. (2011). R-spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt/beta-catenin signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 11452—11457. PMID 21693646 DOI:10.1073/pnas.1106083108
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LGR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13299 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BXB1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |