LGR6

Ідентифікатори

Символи

LGR6, GPCR, VTS20631, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 6, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6

Зовнішні ІД

OMIM: 606653 MGI: 2441805 HomoloGene: 49680 GeneCards: LGR6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor activity • transmembrane signaling receptor activity • signal transducer activity • protein-hormone receptor activity • heparin binding • Roundabout binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • везикула • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • trans-Golgi network membrane • мембрана • міжклітинний простір
Біологічний процес	• positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of Wnt signaling pathway • G protein-coupled receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell migration • tissue regeneration • bone regeneration • axon guidance • negative chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


59352


329252

Ensembl


ENSG00000133067


ENSMUSG00000042793

UniProt


Q9HBX8


Q3UVD5

RefSeq (мРНК)


NM_001017403 NM_001017404 NM_021636


NM_001033409

RefSeq (білок)


NP_001017403 NP_001017404 NP_067649


NP_001028581

Локус (UCSC)

Хр. 1: 202.19 – 202.32 Mb

Хр. 1: 134.91 – 135.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LGR6 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 967 амінокислот, а молекулярна маса — 104 298^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSPPGLRAL	WLCAALCASR	RAGGAPQPGP	GPTACPAPCH	CQEDGIMLSA
DCSELGLSAV	PGDLDPLTAY	LDLSMNNLTE	LQPGLFHHLR	FLEELRLSGN
HLSHIPGQAF	SGLYSLKILM	LQNNQLGGIP	AEALWELPSL	QSLRLDANLI
SLVPERSFEG	LSSLRHLWLD	DNALTEIPVR	ALNNLPALQA	MTLALNRISH
IPDYAFQNLT	SLVVLHLHNN	RIQHLGTHSF	EGLHNLETLD	LNYNKLQEFP
VAIRTLGRLQ	ELGFHNNNIK	AIPEKAFMGN	PLLQTIHFYD	NPIQFVGRSA
FQYLPKLHTL	SLNGAMDIQE	FPDLKGTTSL	EILTLTRAGI	RLLPSGMCQQ
LPRLRVLELS	HNQIEELPSL	HRCQKLEEIG	LQHNRIWEIG	ADTFSQLSSL
QALDLSWNAI	RSIHPEAFST	LHSLVKLDLT	DNQLTTLPLA	GLGGLMHLKL
KGNLALSQAF	SKDSFPKLRI	LEVPYAYQCC	PYGMCASFFK	ASGQWEAEDL
HLDDEESSKR	PLGLLARQAE	NHYDQDLDEL	QLEMEDSKPH	PSVQCSPTPG
PFKPCEYLFE	SWGIRLAVWA	IVLLSVLCNG	LVLLTVFAGG	PVPLPPVKFV
VGAIAGANTL	TGISCGLLAS	VDALTFGQFS	EYGARWETGL	GCRATGFLAV
LGSEASVLLL	TLAAVQCSVS	VSCVRAYGKS	PSLGSVRAGV	LGCLALAGLA
AALPLASVGE	YGASPLCLPY	APPEGQPAAL	GFTVALVMMN	SFCFLVVAGA
YIKLYCDLPR	GDFEAVWDCA	MVRHVAWLIF	ADGLLYCPVA	FLSFASMLGL
FPVTPEAVKS	VLLVVLPLPA	CLNPLLYLLF	NPHFRDDLRR	LRPRAGDSGP
LAYAAAGELE	KSSCDSTQAL	VAFSDVDLIL	EASEAGRPPG	LETYGFPSVT
LISCQQPGAP	RLEGSHCVEP	EGNHFGNPQP	SMDGELLLRA	EGSTPAGGGL
SGGGGFQPSG	LAFASHV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Takeda S., Kadowaki S., Haga T., Takaesu H., Mitaku S. (2002). Identification of G protein-coupled receptor genes from the human genome sequence. FEBS Lett. 520: 97—101. PMID 12044878 DOI:10.1016/S0014-5793(02)02775-8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19719 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9HBX8 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.